More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2705 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2705  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 
139 aa  283  5.999999999999999e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4192  ferric uptake regulator, Fur family  71.97 
 
 
141 aa  196  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11938  ferric uptake regulation protein furA (fur)  71.88 
 
 
150 aa  192  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1532  ferric uptake regulator family protein  69.77 
 
 
174 aa  188  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0229059 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0874  ferric-uptake regulator  71.32 
 
 
146 aa  187  5.999999999999999e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.250116  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3452  ferric uptake regulator family protein  65.89 
 
 
145 aa  186  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604214  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2714  ferric-uptake regulator  66.17 
 
 
147 aa  186  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352648  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2681  ferric uptake regulator family protein  70 
 
 
195 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.445944  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2159  ferric uptake regulator family protein  66.67 
 
 
146 aa  186  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00488582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2712  ferric uptake regulator family protein  70 
 
 
157 aa  185  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2726  ferric uptake regulator family protein  70 
 
 
157 aa  185  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20346 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2053  ferric-uptake regulator  65.19 
 
 
201 aa  185  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  60.43 
 
 
139 aa  184  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3209  ferric uptake regulator family protein  64.23 
 
 
147 aa  184  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.829925  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2983  ferric uptake regulator family protein  69.12 
 
 
149 aa  183  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.319363  normal  0.752016 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01070  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  66.15 
 
 
142 aa  180  6e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0839  ferric-uptake regulator  64.62 
 
 
143 aa  179  8.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22450  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  64.12 
 
 
159 aa  176  5.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0738  ferric uptake regulator family protein  61.48 
 
 
142 aa  175  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376687  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20420  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  62.41 
 
 
140 aa  174  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.375668  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3965  ferric uptake regulator, Fur family  63.36 
 
 
138 aa  172  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0294  ferric uptake regulator, Fur family  59.56 
 
 
170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.774382  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0684  ferric uptake regulator family protein  62.6 
 
 
142 aa  171  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564127  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4454  ferric uptake regulator, Fur family  66.14 
 
 
147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1102  ferric uptake regulator, Fur family  58.21 
 
 
140 aa  171  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.387055  normal  0.912899 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0145  fur family transcriptional regulator  61.54 
 
 
140 aa  170  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3814  ferric uptake regulator, Fur family  58.57 
 
 
146 aa  170  6.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000136698  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36340  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  62.79 
 
 
151 aa  169  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1623  ferric uptake regulator, Fur family  62.96 
 
 
137 aa  168  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4803  ferric uptake regulator, Fur family  62.31 
 
 
154 aa  168  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3313  ferric uptake regulator, Fur family  61.36 
 
 
146 aa  167  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.977689  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0468  ferric-uptake regulator  55.07 
 
 
173 aa  164  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  56.3 
 
 
139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2124  ferric uptake regulator, Fur family  58.59 
 
 
157 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.506102  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2725  ferric uptake regulator, Fur family  58.02 
 
 
152 aa  161  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0518  ferric ion uptake regulator  57.25 
 
 
139 aa  158  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2095  ferric uptake regulator family protein  58.91 
 
 
166 aa  156  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.509153  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3239  ferric uptake regulator, Fur family  59.69 
 
 
173 aa  154  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0237  Fur family ferric uptake regulator  57.03 
 
 
161 aa  152  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24980  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  53.24 
 
 
153 aa  152  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0866  ferric uptake regulator, Fur family  56.82 
 
 
154 aa  149  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0758878  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1937  ferric uptake regulator, Fur family  53.85 
 
 
137 aa  147  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0166827  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5253  ferric uptake regulator family protein  61.82 
 
 
158 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3077  ferric uptake regulator family protein  51.49 
 
 
155 aa  135  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2781  ferric uptake regulator, Fur family  50.37 
 
 
164 aa  134  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.028886 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4885  ferric uptake regulator family protein  62.5 
 
 
108 aa  130  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0503467  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4974  ferric uptake regulator family protein  62.5 
 
 
108 aa  130  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4279  ferric uptake regulator, Fur family  46.43 
 
 
183 aa  127  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000762776  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2141  ferric uptake regulator family protein  41.6 
 
 
137 aa  82  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  30.3 
 
 
150 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1143  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000124537  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  39.84 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.499744 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  30.71 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  29.55 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  29.55 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  29.55 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  29.55 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  29.55 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  29.55 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  29.55 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  29.55 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  30.6 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  31.34 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0726  ferric uptake regulator, Fur family  37.5 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.787789  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4251  FUR family nickel uptake regulator  33.58 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0966436  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2513  ferric uptake regulator, Fur family  35.88 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275348  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0529  ferric uptake regulator, Fur family  28.89 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000605392  normal  0.102669 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0153  ferric uptake regulator, Fur family  33.06 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000104646  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  26.87 
 
 
148 aa  70.1  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  26.87 
 
 
148 aa  70.1  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3240  ferric uptake regulator family protein  35.88 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000230922  hitchhiker  0.00191408 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4099  ferric uptake regulator family protein  29.2 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  26.67 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  25.19 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  29.93 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1966  ferric uptake regulator family protein  30.88 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00359557  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0149  ferric uptake regulator, Fur family  30 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000946287  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0122  ferric uptake regulation protein  30.71 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00816522  normal  0.910281 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0406  ferric uptake regulator, Fur family  27.91 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1073  ferric uptake regulator, Fur family  30.16 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5708  ferric uptake regulator, Fur family  31.62 
 
 
143 aa  67  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  30.47 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  30.47 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1140  ferric uptake regulator family protein  35.77 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0105  ferric uptake regulator family protein  29.77 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.013681  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2524  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.568134  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  28 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4742  ferric uptake regulator, Fur family  34.29 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0391  FUR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2620  ferric uptake regulator, Fur family  29.63 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2171  ferric uptake regulator, Fur family  33.86 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00854605  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0352  ferric uptake regulator, Fur family  34.15 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  28.99 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  21.37 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1388  ferric uptake regulator, Fur family  37.01 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00327608  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0734  ferric uptake regulator family protein  27.27 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000194517  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0347  ferric uptake regulator, Fur family  29.41 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>