More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_36340 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_36340  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  100 
 
 
151 aa  305  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0468  ferric-uptake regulator  66.92 
 
 
173 aa  182  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4803  ferric uptake regulator, Fur family  59.44 
 
 
154 aa  174  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3965  ferric uptake regulator, Fur family  62.12 
 
 
138 aa  173  6e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1623  ferric uptake regulator, Fur family  64.39 
 
 
137 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0145  fur family transcriptional regulator  61.19 
 
 
140 aa  171  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0294  ferric uptake regulator, Fur family  61.64 
 
 
170 aa  170  5e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.774382  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0839  ferric-uptake regulator  60.58 
 
 
143 aa  169  9e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2705  ferric uptake regulator, Fur family  62.79 
 
 
139 aa  169  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  62.5 
 
 
139 aa  168  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0738  ferric uptake regulator family protein  63.08 
 
 
142 aa  168  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376687  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22450  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  56.67 
 
 
159 aa  166  7e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2095  ferric uptake regulator family protein  59.85 
 
 
166 aa  166  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.509153  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2714  ferric-uptake regulator  61.65 
 
 
147 aa  165  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352648  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4454  ferric uptake regulator, Fur family  60.87 
 
 
147 aa  165  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11938  ferric uptake regulation protein furA (fur)  60.9 
 
 
150 aa  164  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2681  ferric uptake regulator family protein  58.27 
 
 
195 aa  163  8e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.445944  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2124  ferric uptake regulator, Fur family  60.31 
 
 
157 aa  163  9e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.506102  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1102  ferric uptake regulator, Fur family  59.38 
 
 
140 aa  163  9e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.387055  normal  0.912899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0518  ferric ion uptake regulator  55.56 
 
 
139 aa  163  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0684  ferric uptake regulator family protein  61.72 
 
 
142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564127  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2712  ferric uptake regulator family protein  58.27 
 
 
157 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2726  ferric uptake regulator family protein  58.27 
 
 
157 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20346 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0866  ferric uptake regulator, Fur family  62.69 
 
 
154 aa  161  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0758878  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2159  ferric uptake regulator family protein  62.5 
 
 
146 aa  159  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00488582 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2053  ferric-uptake regulator  60.61 
 
 
201 aa  159  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3452  ferric uptake regulator family protein  56.62 
 
 
145 aa  159  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604214  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2983  ferric uptake regulator family protein  61.07 
 
 
149 aa  159  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.319363  normal  0.752016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3209  ferric uptake regulator family protein  55.24 
 
 
147 aa  158  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.829925  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4192  ferric uptake regulator, Fur family  60.63 
 
 
141 aa  155  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01070  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  57.14 
 
 
142 aa  154  3e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2725  ferric uptake regulator, Fur family  54.48 
 
 
152 aa  154  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20420  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  56.82 
 
 
140 aa  153  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.375668  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0874  ferric-uptake regulator  56.83 
 
 
146 aa  154  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.250116  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0237  Fur family ferric uptake regulator  54.29 
 
 
161 aa  153  9e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1532  ferric uptake regulator family protein  57.25 
 
 
174 aa  152  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0229059 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5253  ferric uptake regulator family protein  68.14 
 
 
158 aa  150  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  55.91 
 
 
139 aa  149  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3313  ferric uptake regulator, Fur family  53.68 
 
 
146 aa  149  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.977689  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24980  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  55.47 
 
 
153 aa  147  6e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3814  ferric uptake regulator, Fur family  53.38 
 
 
146 aa  146  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000136698  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1937  ferric uptake regulator, Fur family  54.62 
 
 
137 aa  144  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0166827  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3239  ferric uptake regulator, Fur family  56.59 
 
 
173 aa  142  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4885  ferric uptake regulator family protein  68.37 
 
 
108 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0503467  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4974  ferric uptake regulator family protein  68.37 
 
 
108 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3077  ferric uptake regulator family protein  46.21 
 
 
155 aa  124  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2781  ferric uptake regulator, Fur family  45.26 
 
 
164 aa  123  9e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.028886 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4279  ferric uptake regulator, Fur family  48.46 
 
 
183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000762776  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  34.35 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1143  ferric uptake regulator, Fur family  29.58 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000124537  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2141  ferric uptake regulator family protein  41.67 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  29.77 
 
 
166 aa  75.5  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3278  ferric uptake regulator, Fur family  35.71 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.351465 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1194  ferric-uptake regulator  31.37 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  28.47 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4185  ferric uptake regulator, Fur family  31.34 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421488  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0247  ferric uptake transcriptional (FUR)-like transcription regulator protein  36.88 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  28.57 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0375  ferric uptake regulator family protein  33.83 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0122  ferric uptake regulation protein  31.5 
 
 
154 aa  72  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00816522  normal  0.910281 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  31.58 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0438  ferric uptake regulation protein  31.58 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0414  ferric uptake regulation protein  31.58 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1905  ferric uptake regulator family protein  29.85 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  34.51 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.499744 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  28.24 
 
 
148 aa  70.5  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2050  ferric uptake regulator, Fur family  33.86 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  28.24 
 
 
148 aa  70.5  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0312  ferric uptake regulator family protein  35.56 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  31.06 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  23.94 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  27.94 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  27.94 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1389  ferric uptake regulation protein  32.09 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000498211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  27.94 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  27.94 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  27.94 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  27.94 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  27.94 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  27.94 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  27.94 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  27.94 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1451  ferric uptake regulation protein  32.09 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000060196  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1405  ferric uptake regulator family protein  31.54 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0347  ferric uptake regulator, Fur family  30.08 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1792  ferric uptake regulator, Fur family  34.11 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000306351  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  25.37 
 
 
143 aa  67  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  34.72 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1300  ferric uptake regulator family protein  26.62 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  34.72 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1188  ferric uptake regulator, Fur family  31.25 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0844  ferric uptake regulator, Fur family  32.35 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126283  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5746  ferric uptake regulator, DNA-binding transcriptional dual regulator of siderophore biosynthesis and transport  31.34 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0141  ferric uptake regulator, Fur family  33.87 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.896296  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  30.22 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6836  ferric uptake regulator, Fur family  31.85 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1966  ferric uptake regulator family protein  31.58 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00359557  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  26.92 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0967  ferric uptake regulator, Fur family  31.85 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.924679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>