More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3239 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3239  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 
173 aa  339  1e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0839  ferric-uptake regulator  61.54 
 
 
143 aa  157  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2705  ferric uptake regulator, Fur family  59.54 
 
 
139 aa  154  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20420  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  55.64 
 
 
140 aa  152  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.375668  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0145  fur family transcriptional regulator  52.9 
 
 
140 aa  150  8.999999999999999e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0294  ferric uptake regulator, Fur family  55.81 
 
 
170 aa  148  3e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.774382  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3965  ferric uptake regulator, Fur family  56.59 
 
 
138 aa  148  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4803  ferric uptake regulator, Fur family  55.64 
 
 
154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0468  ferric-uptake regulator  53.62 
 
 
173 aa  146  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2714  ferric-uptake regulator  53.62 
 
 
147 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352648  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3452  ferric uptake regulator family protein  55.56 
 
 
145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604214  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0738  ferric uptake regulator family protein  55.38 
 
 
142 aa  145  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376687  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24980  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  53.38 
 
 
153 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1623  ferric uptake regulator, Fur family  54.74 
 
 
137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36340  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  56.59 
 
 
151 aa  143  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4454  ferric uptake regulator, Fur family  57.81 
 
 
147 aa  143  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11938  ferric uptake regulation protein furA (fur)  50.33 
 
 
150 aa  143  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  53.73 
 
 
139 aa  143  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22450  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  51.75 
 
 
159 aa  142  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0237  Fur family ferric uptake regulator  52.55 
 
 
161 aa  142  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2681  ferric uptake regulator family protein  49.37 
 
 
195 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.445944  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01070  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  55.07 
 
 
142 aa  141  5e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0874  ferric-uptake regulator  57.14 
 
 
146 aa  141  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.250116  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0518  ferric ion uptake regulator  50.36 
 
 
139 aa  141  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2159  ferric uptake regulator family protein  54.68 
 
 
146 aa  140  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00488582 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2053  ferric-uptake regulator  55.88 
 
 
201 aa  140  9e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2712  ferric uptake regulator family protein  53.52 
 
 
157 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0684  ferric uptake regulator family protein  53.85 
 
 
142 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564127  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2726  ferric uptake regulator family protein  53.52 
 
 
157 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3209  ferric uptake regulator family protein  55.38 
 
 
147 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.829925  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1532  ferric uptake regulator family protein  55.64 
 
 
174 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0229059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2983  ferric uptake regulator family protein  52.78 
 
 
149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.319363  normal  0.752016 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4192  ferric uptake regulator, Fur family  54.69 
 
 
141 aa  138  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3814  ferric uptake regulator, Fur family  54.26 
 
 
146 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000136698  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3313  ferric uptake regulator, Fur family  52.86 
 
 
146 aa  137  7e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.977689  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2725  ferric uptake regulator, Fur family  46.05 
 
 
152 aa  136  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1102  ferric uptake regulator, Fur family  48.84 
 
 
140 aa  134  7.000000000000001e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.387055  normal  0.912899 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2124  ferric uptake regulator, Fur family  52.9 
 
 
157 aa  134  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.506102  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  50 
 
 
139 aa  132  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0866  ferric uptake regulator, Fur family  47.53 
 
 
154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0758878  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2095  ferric uptake regulator family protein  51.09 
 
 
166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.509153  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1937  ferric uptake regulator, Fur family  49.22 
 
 
137 aa  129  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0166827  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2781  ferric uptake regulator, Fur family  44.06 
 
 
164 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.028886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5253  ferric uptake regulator family protein  58.42 
 
 
158 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4279  ferric uptake regulator, Fur family  44.23 
 
 
183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000762776  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3077  ferric uptake regulator family protein  44.78 
 
 
155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4885  ferric uptake regulator family protein  56.84 
 
 
108 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0503467  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4974  ferric uptake regulator family protein  56.84 
 
 
108 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  33.8 
 
 
166 aa  82.8  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  34.78 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  32.12 
 
 
143 aa  77  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  26.71 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  33.08 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  29.1 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  29.1 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0347  ferric uptake regulator, Fur family  34.04 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  33.08 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0122  ferric uptake regulation protein  31.25 
 
 
154 aa  73.9  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00816522  normal  0.910281 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  28.67 
 
 
146 aa  73.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  32.33 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0105  ferric uptake regulator family protein  31.21 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.013681  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  27.61 
 
 
152 aa  72  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  28.57 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  28.57 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0873  ferric uptake regulator, Fur family protein  32.54 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  28.57 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  28.57 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  28.57 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  36.17 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  28.57 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  36.17 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  29.71 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0247  ferric uptake transcriptional (FUR)-like transcription regulator protein  34.75 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  32.62 
 
 
149 aa  70.5  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  32.81 
 
 
143 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  32.12 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1451  ferric uptake regulation protein  33.58 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000060196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  27.82 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1389  ferric uptake regulation protein  33.58 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000498211  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1194  ferric-uptake regulator  31.03 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  28.03 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  24.82 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  24.82 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1966  ferric uptake regulator family protein  30.83 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  31.01 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  30.07 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  28.78 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  30.07 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  30.82 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  31.58 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  26.87 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  30.28 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  30.28 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  30.28 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  30.28 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  29.85 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0153  ferric uptake regulator, Fur family  29.2 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000104646  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>