More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_21120 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_21120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  100 
 
 		 139 aa  283  5.999999999999999e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2705  ferric uptake regulator, Fur family  60.43 
 
 		 139 aa  184  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0145  fur family transcriptional regulator  63.91 
 
 		 140 aa  181  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  59.56 
 
 		 139 aa  179  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1532  ferric uptake regulator family protein  65.62 
 
 		 174 aa  179  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0229059 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11938  ferric uptake regulation protein furA (fur)  62.96 
 
 		 150 aa  177  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2983  ferric uptake regulator family protein  62.59 
 
 		 149 aa  176  9e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.319363  normal  0.752016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3452  ferric uptake regulator family protein  60.74 
 
 		 145 aa  176  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4192  ferric uptake regulator, Fur family  61.07 
 
 		 141 aa  175  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20420  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  61.54 
 
 		 140 aa  176  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.375668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0839  ferric-uptake regulator  60.77 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3209  ferric uptake regulator family protein  62.22 
 
 		 147 aa  174  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.829925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2725  ferric uptake regulator, Fur family  58.78 
 
 		 152 aa  174  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2159  ferric uptake regulator family protein  58.96 
 
 		 146 aa  171  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00488582 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2053  ferric-uptake regulator  59.26 
 
 		 201 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1102  ferric uptake regulator, Fur family  60.94 
 
 		 140 aa  170  5e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.387055  normal  0.912899 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2124  ferric uptake regulator, Fur family  61.72 
 
 		 157 aa  169  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.506102  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0294  ferric uptake regulator, Fur family  58.78 
 
 		 170 aa  169  1e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.774382  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0874  ferric-uptake regulator  60 
 
 		 146 aa  169  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.250116  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36340  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  62.5 
 
 		 151 aa  168  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0738  ferric uptake regulator family protein  61.72 
 
 		 142 aa  167  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376687  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0518  ferric ion uptake regulator  58.46 
 
 		 139 aa  167  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2714  ferric-uptake regulator  58.59 
 
 		 147 aa  167  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352648  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4803  ferric uptake regulator, Fur family  58.46 
 
 		 154 aa  167  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2681  ferric uptake regulator family protein  61.07 
 
 		 195 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.445944  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0684  ferric uptake regulator family protein  61.72 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564127  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3313  ferric uptake regulator, Fur family  56.82 
 
 		 146 aa  166  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.977689  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2712  ferric uptake regulator family protein  61.07 
 
 		 157 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3814  ferric uptake regulator, Fur family  56.3 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000136698  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2726  ferric uptake regulator family protein  61.07 
 
 		 157 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.20346 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0468  ferric-uptake regulator  63.28 
 
 		 173 aa  164  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4454  ferric uptake regulator, Fur family  60.63 
 
 		 147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22450  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  60.94 
 
 		 159 aa  163  6.9999999999999995e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0237  Fur family ferric uptake regulator  54.41 
 
 		 161 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3965  ferric uptake regulator, Fur family  59.06 
 
 		 138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2095  ferric uptake regulator family protein  59.84 
 
 		 166 aa  160  4.0000000000000004e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.509153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01070  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  56.82 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1623  ferric uptake regulator, Fur family  56.25 
 
 		 137 aa  155  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1937  ferric uptake regulator, Fur family  53.54 
 
 		 137 aa  148  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0166827  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0866  ferric uptake regulator, Fur family  54.96 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0758878  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24980  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  50 
 
 		 153 aa  140  7e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4885  ferric uptake regulator family protein  66.32 
 
 		 108 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0503467  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4974  ferric uptake regulator family protein  66.32 
 
 		 108 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5253  ferric uptake regulator family protein  59.09 
 
 		 158 aa  136  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3077  ferric uptake regulator family protein  48.48 
 
 		 155 aa  130  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3239  ferric uptake regulator, Fur family  50 
 
 		 173 aa  130  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2781  ferric uptake regulator, Fur family  47.41 
 
 		 164 aa  127  6e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.028886 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4279  ferric uptake regulator, Fur family  43.41 
 
 		 183 aa  115  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000762776  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  38.52 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  33.09 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2141  ferric uptake regulator family protein  39.84 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  32.33 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  32.33 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  32.33 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  32.33 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  32.62 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  32.33 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  32.33 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  32.33 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  32.33 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  38.17 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.499744 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0122  ferric uptake regulation protein  33.85 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00816522  normal  0.910281 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  32.31 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4099  ferric uptake regulator family protein  32.84 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1143  ferric uptake regulator, Fur family  32.58 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000124537  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  28.47 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0105  ferric uptake regulator family protein  31.58 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.013681  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2809  FUR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 152 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.110848  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1966  ferric uptake regulator family protein  33.09 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00359557  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1792  ferric uptake regulator, Fur family  34.09 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000306351  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  30.88 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  30.88 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  27.69 
 
 		 134 aa  72  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1144  ferric uptake regulator family protein  37.1 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0529  ferric uptake regulator, Fur family  29.93 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000605392  normal  0.102669 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3278  ferric uptake regulator, Fur family  33.06 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.351465 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0222  ferric-uptake regulator  32.35 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0726  ferric uptake regulator, Fur family  35.66 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.787789  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0367  FUR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.596718  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3240  ferric uptake regulator family protein  35.56 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000230922  hitchhiker  0.00191408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0375  ferric uptake regulator family protein  32.81 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0344  FUR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.470674  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0543  ferric uptake regulator, Fur family  30.4 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.70942 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0149  ferric uptake regulator, Fur family  33.59 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000946287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0312  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0418  ferric-uptake regulator  28.24 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00383086  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2620  ferric uptake regulator, Fur family  34.29 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3674  ferric uptake regulator family protein  35.16 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0767  ferric uptake regulator family protein  31.54 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.531572  normal  0.0222977 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1296  FUR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2727  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284846  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4251  FUR family nickel uptake regulator  31.01 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0966436  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4185  ferric uptake regulator, Fur family  28.57 
 
 		 139 aa  67  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1230  FUR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 139 aa  67  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0757057  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2513  ferric uptake regulator, Fur family  35.71 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>