More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4251 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4251  FUR family nickel uptake regulator  100 
 
 		 139 aa  280  3.0000000000000004e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0966436  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0375  ferric uptake regulator family protein  54.2 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0473  Fur family ferric uptake regulator  51.11 
 
 		 136 aa  149  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0061  FUR family nickel uptake regulator  53.73 
 
 		 150 aa  149  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0312  ferric uptake regulator family protein  53.44 
 
 		 174 aa  147  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0918  ferric uptake regulator  53.91 
 
 		 137 aa  144  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5708  ferric uptake regulator, Fur family  49.63 
 
 		 143 aa  135  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0654  ferric uptake regulator, Fur family  54.07 
 
 		 136 aa  136  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6836  ferric uptake regulator, Fur family  51.15 
 
 		 144 aa  128  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6149  ferric uptake regulator family protein  53.12 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8242  ferric uptake regulator, Fur family  53.79 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0883  ferric uptake regulator, Fur family  45.99 
 
 		 140 aa  116  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.061821  hitchhiker  0.00451054 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4626  ferric uptake regulator, Fur family  48.2 
 
 		 159 aa  110  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795409  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  37.12 
 
 		 142 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_19  transcriptional regulator, Fur family  36.36 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.677591  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0020  FUR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 142 aa  103  6e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147149  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1315  transcriptional regulator, TrmB  38.97 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0940  ferric uptake regulator, Fur family  30.28 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  35.43 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2725  ferric uptake regulator, Fur family  37.8 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  34.56 
 
 		 143 aa  87.4  6e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0603  ferric uptake regulator family protein  35.97 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  32.81 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  32.03 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  32.03 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  32.03 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  32.03 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  32.03 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  32.03 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  32.03 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  33.09 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  30 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  33.09 
 
 		 167 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  33.09 
 
 		 167 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1147  FUR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0199  ferric uptake regulator, Fur family  33.88 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.18921  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  27.86 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2661  ferric uptake regulator family protein  34.33 
 
 		 173 aa  80.1  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.946961  normal  0.0414019 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  28.99 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21260  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  33.85 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.570442  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  28.26 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2058  ferric uptake regulator, Fur family  30.66 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3965  ferric uptake regulator, Fur family  35.94 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  29.23 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  30 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  32.56 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  33.86 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1138  ferric uptake regulator, Fur family  29.69 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716078  normal  0.825565 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0468  ferric-uptake regulator  33.33 
 
 		 173 aa  76.6  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  30 
 
 		 148 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  29.79 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  30.43 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  28.67 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  28.67 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  28.67 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  27.46 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  32.28 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0896  ferric uptake regulator, Fur family  27.94 
 
 		 166 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  30.43 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  29.08 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  30.43 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  32.33 
 
 		 146 aa  72  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22450  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  33.59 
 
 		 159 aa  72  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  27.13 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2053  ferric-uptake regulator  32.85 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0980  ferric uptake regulator family protein  29.69 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.875301  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3313  ferric uptake regulator, Fur family  32.35 
 
 		 146 aa  72  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.977689  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  31.54 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2705  ferric uptake regulator, Fur family  33.58 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1680  ferric uptake regulator, Fur family  31.62 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  30.95 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4201  transcriptional regulator, Fur family  28.37 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0217905  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3922  ferric uptake regulator family protein  28.37 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000572819  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  32.54 
 
 		 147 aa  72  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1036  transcriptional regulator, Fur family  28.37 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0163253  normal  0.210334 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0987  ferric uptake regulator family protein  27.94 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00388915 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  24.65 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1532  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0229059 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1006  ferric uptake regulator, Fur family  29.71 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000144475 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  27.91 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0314  ferric uptake regulator family protein  30.22 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0295931  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  24.63 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20420  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  34.88 
 
 		 140 aa  70.1  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.375668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0058  ferric uptake regulator family protein  27.21 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0235193  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  29.77 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2145  ferric-uptake regulator  34.51 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4185  ferric uptake regulator, Fur family  30.88 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1140  ferric uptake regulator family protein  35.07 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  27.01 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1653  ferric uptake regulator family protein  38.1 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.364818 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4001  FUR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000832394  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1474  ferric uptake regulator family protein  33.85 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  31.25 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1789  ferric uptake regulator, Fur family  25.55 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.372499  normal  0.929582 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  30.28 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>