More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2620 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2620  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 164 aa  335  9.999999999999999e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0314  ferric uptake regulator family protein  87.2 
 
 		 164 aa  294  3e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0295931  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1680  ferric uptake regulator, Fur family  64.52 
 
 		 167 aa  217  7e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1474  ferric uptake regulator family protein  57.32 
 
 		 168 aa  214  4e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0896  ferric uptake regulator, Fur family  64.47 
 
 		 166 aa  214  5e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1573  ferric uptake regulator, Fur family  61.84 
 
 		 171 aa  207  5e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719756 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1982  ferric uptake regulator family protein  60.56 
 
 		 165 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0159  ferric uptake regulator, Fur family  37.58 
 
 		 176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1610  ferric uptake regulator, Fur family  39.29 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.596418  normal  0.587643 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4578  ferric uptake regulator, Fur family  36.05 
 
 		 166 aa  104  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.622664  normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1203  ferric-uptake regulator  35.17 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.43174 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2145  ferric-uptake regulator  36.09 
 
 		 164 aa  101  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1703  ferric uptake regulator protein  36.17 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.341625 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  35.11 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  33.57 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0247  ferric uptake regulator, Fur family  30.63 
 
 		 165 aa  92.4  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2222  ferric uptake regulator family protein  33.8 
 
 		 152 aa  90.9  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08771  putative iron storage-related regulatory protein  32.58 
 
 		 151 aa  87.8  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.139976  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  32.64 
 
 		 157 aa  87.8  6e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  30.15 
 
 		 144 aa  87.8  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  35.43 
 
 		 142 aa  87.4  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  35.43 
 
 		 142 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  35.43 
 
 		 142 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  33.08 
 
 		 146 aa  87.4  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 144 aa  87  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  35.43 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  35.43 
 
 		 144 aa  87  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  35.43 
 
 		 144 aa  87  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  32.64 
 
 		 157 aa  87  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  32.64 
 
 		 157 aa  87  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  30.15 
 
 		 148 aa  87  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 144 aa  87  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  35.43 
 
 		 142 aa  87  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  35.43 
 
 		 142 aa  87  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  32.03 
 
 		 176 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  32.45 
 
 		 150 aa  85.1  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  35.61 
 
 		 155 aa  84.3  7e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  28.57 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  28.57 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  31.62 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  32.64 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  31.25 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  31.82 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  29.32 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  29.77 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  28.26 
 
 		 143 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  31.06 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  28.36 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  34.93 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  33.58 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0061  FUR family nickel uptake regulator  29.86 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  29.55 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  30.95 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1334  ferric uptake regulator family protein  33.87 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  30.95 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2798  Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins  30 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.1309500000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  36.3 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3966  ferric uptake regulator family protein  32.06 
 
 		 150 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.867334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3949  ferric uptake regulator, Fur family  29.58 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.234293  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3863  ferric uptake regulator, Fur family  29.58 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199126  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3806  ferric uptake regulator family protein  29.58 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  31.54 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  32.31 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  25.36 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1315  transcriptional regulator, TrmB  31.75 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  33.78 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0418  ferric-uptake regulator  30 
 
 		 136 aa  73.6  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00383086  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  30.66 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0529  ferric uptake regulator, Fur family  32.82 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000605392  normal  0.102669 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5908  ferric uptake regulator, Fur family  28 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4454  ferric uptake regulator, Fur family  33.85 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1411  ferric uptake regulator family protein  33.07 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  30.88 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  28.87 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3452  ferric uptake regulator family protein  34.33 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0928  FUR family manganese uptake regulator  30.65 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3924  ferric uptake regulator family protein  29.79 
 
 		 182 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.567476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0918  ferric uptake regulator  31.58 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0375  ferric uptake regulator family protein  26.87 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0987  ferric uptake regulator family protein  30.94 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00388915 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1532  ferric uptake regulator family protein  30.07 
 
 		 174 aa  72  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0229059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0684  ferric uptake regulator family protein  32.06 
 
 		 142 aa  72  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564127  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0768  iron ABC transporter  33.33 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000612083  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  29.86 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  27.48 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6836  ferric uptake regulator, Fur family  31.54 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  32 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2725  ferric uptake regulator, Fur family  30.99 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1293  ferric uptake regulator family protein  28.87 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4803  ferric uptake regulator, Fur family  30.56 
 
 		 154 aa  70.5  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  28.17 
 
 		 166 aa  70.5  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0312  ferric uptake regulator family protein  25.52 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3404  ferric uptake regulator family protein  32.59 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.092554  normal  0.327657 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1892  Fur family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 141 aa  70.5  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1143  ferric uptake regulator, Fur family  34.09 
 
 		 150 aa  70.5  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000124537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>