More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0839 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0839  ferric-uptake regulator  100 
 
 		 143 aa  286  6e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20420  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  68.5 
 
 		 140 aa  181  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.375668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2705  ferric uptake regulator, Fur family  64.62 
 
 		 139 aa  179  8.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11938  ferric uptake regulation protein furA (fur)  66.92 
 
 		 150 aa  176  7e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  60.77 
 
 		 139 aa  175  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01070  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  64.06 
 
 		 142 aa  174  5e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2124  ferric uptake regulator, Fur family  61.83 
 
 		 157 aa  170  5.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.506102  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36340  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  60.58 
 
 		 151 aa  169  9e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2714  ferric-uptake regulator  63.85 
 
 		 147 aa  167  6e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352648  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3452  ferric uptake regulator family protein  61.72 
 
 		 145 aa  167  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1532  ferric uptake regulator family protein  63.28 
 
 		 174 aa  166  9e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0229059 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0145  fur family transcriptional regulator  62.02 
 
 		 140 aa  166  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0518  ferric ion uptake regulator  58.33 
 
 		 139 aa  166  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3965  ferric uptake regulator, Fur family  59.09 
 
 		 138 aa  165  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2681  ferric uptake regulator family protein  62.69 
 
 		 195 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.445944  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2712  ferric uptake regulator family protein  62.69 
 
 		 157 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2726  ferric uptake regulator family protein  62.69 
 
 		 157 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.20346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2983  ferric uptake regulator family protein  62.5 
 
 		 149 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.319363  normal  0.752016 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4803  ferric uptake regulator, Fur family  60.9 
 
 		 154 aa  164  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0738  ferric uptake regulator family protein  59.56 
 
 		 142 aa  163  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376687  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2159  ferric uptake regulator family protein  59.26 
 
 		 146 aa  163  6.9999999999999995e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00488582 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0294  ferric uptake regulator, Fur family  59.85 
 
 		 170 aa  163  6.9999999999999995e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.774382  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4454  ferric uptake regulator, Fur family  61.83 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4192  ferric uptake regulator, Fur family  61.54 
 
 		 141 aa  162  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0874  ferric-uptake regulator  63.08 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.250116  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3209  ferric uptake regulator family protein  60.77 
 
 		 147 aa  161  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.829925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2053  ferric-uptake regulator  57.14 
 
 		 201 aa  160  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  59.7 
 
 		 139 aa  160  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0684  ferric uptake regulator family protein  58.82 
 
 		 142 aa  160  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564127  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1102  ferric uptake regulator, Fur family  57.25 
 
 		 140 aa  160  7e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.387055  normal  0.912899 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0468  ferric-uptake regulator  58.59 
 
 		 173 aa  159  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3239  ferric uptake regulator, Fur family  61.54 
 
 		 173 aa  157  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0237  Fur family ferric uptake regulator  57.46 
 
 		 161 aa  157  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2095  ferric uptake regulator family protein  61.54 
 
 		 166 aa  157  7e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.509153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2725  ferric uptake regulator, Fur family  57.69 
 
 		 152 aa  155  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22450  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  56.62 
 
 		 159 aa  155  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3814  ferric uptake regulator, Fur family  57.89 
 
 		 146 aa  154  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000136698  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3313  ferric uptake regulator, Fur family  56.69 
 
 		 146 aa  150  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.977689  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1623  ferric uptake regulator, Fur family  56.92 
 
 		 137 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24980  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  57.69 
 
 		 153 aa  149  8.999999999999999e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0866  ferric uptake regulator, Fur family  58.21 
 
 		 154 aa  145  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0758878  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1937  ferric uptake regulator, Fur family  50.76 
 
 		 137 aa  134  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0166827  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5253  ferric uptake regulator family protein  56.52 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4279  ferric uptake regulator, Fur family  47.01 
 
 		 183 aa  124  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000762776  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3077  ferric uptake regulator family protein  46.32 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4885  ferric uptake regulator family protein  60.42 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0503467  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2781  ferric uptake regulator, Fur family  46.67 
 
 		 164 aa  121  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.028886 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4974  ferric uptake regulator family protein  60.42 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  29.71 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  30.94 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0122  ferric uptake regulation protein  30.94 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00816522  normal  0.910281 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  28.68 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  28.03 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1966  ferric uptake regulator family protein  30.08 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00359557  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1194  ferric-uptake regulator  30.94 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  29.1 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  29.1 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  30.94 
 
 		 151 aa  67  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  30.94 
 
 		 151 aa  67  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  26.09 
 
 		 142 aa  66.6  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 144 aa  66.6  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  26.09 
 
 		 144 aa  66.6  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  26.09 
 
 		 144 aa  66.6  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  26.09 
 
 		 142 aa  66.6  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  26.09 
 
 		 142 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 144 aa  66.6  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  26.09 
 
 		 142 aa  66.6  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  26.09 
 
 		 142 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  29.69 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  26.09 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  26.67 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0967  ferric uptake regulator, Fur family  30.47 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.924679  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0438  ferric uptake regulation protein  29.55 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0414  ferric uptake regulation protein  29.55 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  25.74 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  28.91 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1388  ferric uptake regulator, Fur family  33.6 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00327608  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0406  ferric uptake regulator, Fur family  27.21 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  32.82 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4234  ferric uptake regulator family protein  35.29 
 
 		 167 aa  63.9  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0343972  normal  0.519768 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4578  ferric uptake regulator, Fur family  29.2 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.622664  normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1405  ferric uptake regulator family protein  30.16 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1792  ferric uptake regulator, Fur family  33.59 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000306351  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0726  ferric uptake regulator, Fur family  31.75 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.787789  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3292  FUR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000231053  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0223  transcriptional regulator  29.1 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1451  ferric uptake regulation protein  27.82 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000060196  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  21.28 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1389  ferric uptake regulation protein  27.61 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000498211  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0247  ferric uptake transcriptional (FUR)-like transcription regulator protein  29.71 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1575  ferric uptake regulator  30.69 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0458  ferric uptake regulator, Fur family  28.89 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000485327 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0282  ferric uptake regulation protein  28.89 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2050  ferric uptake regulator, Fur family  30.23 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  28.46 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4251  FUR family nickel uptake regulator  28.12 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0966436  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  26.77 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  28.99 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>