More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4578 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4578  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 166 aa  351  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.622664  normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1610  ferric uptake regulator, Fur family  80.39 
 
 		 174 aa  271  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.596418  normal  0.587643 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1703  ferric uptake regulator protein  77.08 
 
 		 165 aa  246  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.341625 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1203  ferric-uptake regulator  67.3 
 
 		 164 aa  227  5e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.43174 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0159  ferric uptake regulator, Fur family  58.33 
 
 		 176 aa  204  4e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2222  ferric uptake regulator family protein  61.31 
 
 		 152 aa  186  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0247  ferric uptake regulator, Fur family  53.85 
 
 		 165 aa  184  4e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08771  putative iron storage-related regulatory protein  59.12 
 
 		 151 aa  178  4e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.139976  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  37.88 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  37.12 
 
 		 167 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  37.12 
 
 		 167 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  37.31 
 
 		 143 aa  107  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  37.98 
 
 		 176 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2620  ferric uptake regulator, Fur family  36.05 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1680  ferric uptake regulator, Fur family  37.31 
 
 		 167 aa  103  9e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1982  ferric uptake regulator family protein  36.99 
 
 		 165 aa  103  9e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1573  ferric uptake regulator, Fur family  37.68 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719756 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0314  ferric uptake regulator family protein  35.92 
 
 		 164 aa  97.1  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0295931  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1474  ferric uptake regulator family protein  31.85 
 
 		 168 aa  95.9  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0896  ferric uptake regulator, Fur family  37.4 
 
 		 166 aa  95.5  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  34.07 
 
 		 148 aa  94.7  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 152 aa  94.4  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  32.59 
 
 		 143 aa  94.4  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  31.62 
 
 		 143 aa  90.5  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  31.62 
 
 		 143 aa  90.9  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3791  ferric uptake regulator family protein  36.43 
 
 		 152 aa  90.5  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  31.85 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5908  ferric uptake regulator, Fur family  34.48 
 
 		 165 aa  90.5  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0934  ferric uptake regulator family protein  35.51 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.634788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0967  ferric uptake regulator, Fur family  35.51 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.924679  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2145  ferric-uptake regulator  34.35 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  32.12 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  33.08 
 
 		 146 aa  90.1  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2837  ferric uptake regulator family protein  36.5 
 
 		 143 aa  89.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2976  ferric uptake regulator family protein  36.5 
 
 		 143 aa  89.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  30.61 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0570  ferric uptake regulator family protein  36.76 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4610  ferric uptake regulator family protein  35.25 
 
 		 181 aa  88.6  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0544  ferric uptake regulator family protein  36.76 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0596927  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3806  ferric uptake regulator family protein  33.57 
 
 		 152 aa  88.6  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2986  ferric uptake regulator, Fur family  35.77 
 
 		 143 aa  88.6  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.105319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2576  ferric uptake regulator, Fur family  35.77 
 
 		 143 aa  88.6  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.710249  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2747  ferric uptake transcriptional repressor transcription regulator protein  35.77 
 
 		 143 aa  87.8  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2737  ferric uptake regulator family protein  36.03 
 
 		 142 aa  87.4  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348547  normal  0.830954 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3735  ferric uptake regulator family protein  36.03 
 
 		 142 aa  87.4  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345676 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0166  ferric uptake regulator family protein  36.03 
 
 		 142 aa  87.4  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0649  ferric uptake regulator family protein  36.03 
 
 		 142 aa  87.4  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0616  ferric uptake regulator family protein  36.03 
 
 		 142 aa  87.4  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.740565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1123  ferric uptake regulator family protein  34.04 
 
 		 148 aa  86.3  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.488583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  31.91 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0753  ferric uptake regulator family protein  34.07 
 
 		 148 aa  86.3  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.629039  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3863  ferric uptake regulator, Fur family  32.14 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199126  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  32.62 
 
 		 150 aa  85.5  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3924  ferric uptake regulator family protein  31.85 
 
 		 182 aa  85.5  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.567476 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 150 aa  85.1  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  33.57 
 
 		 149 aa  85.1  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1727  ferric uptake regulator, Fur family  34.33 
 
 		 146 aa  84.7  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  32.35 
 
 		 148 aa  84.7  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1593  ferric uptake regulator  36.36 
 
 		 143 aa  84.7  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000083166  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  32.35 
 
 		 148 aa  84.7  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  33.57 
 
 		 149 aa  84.3  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2066  ferric uptake regulator family protein  35.16 
 
 		 141 aa  84.3  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.779744  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  30.94 
 
 		 144 aa  84.3  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  30.23 
 
 		 144 aa  84  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  34.78 
 
 		 148 aa  84  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0894  ferric uptake regulator family protein  34.81 
 
 		 152 aa  84  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572753 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  34.78 
 
 		 148 aa  84  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  35.07 
 
 		 143 aa  84  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3385  ferric uptake regulator, Fur family  34.81 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.514247  hitchhiker  0.0000888993 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  34.78 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3949  ferric uptake regulator, Fur family  31.43 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.234293  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2645  ferric uptake regulator  34.56 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1234  ferric uptake regulator  34.56 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1084  ferric uptake regulator, Fur family  36.29 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.784641  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2458  ferric uptake regulator  34.56 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0375  ferric uptake regulator  34.56 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3457  ferric uptake regulator  34.56 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1206  ferric uptake regulator  34.56 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3420  ferric uptake regulator  34.56 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133952  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0571  ferric uptake regulator family protein  34.07 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3455  ferric uptake regulator  34.56 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114286  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2593  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000283641 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1690  ferric uptake regulator  34.04 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000286155  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  35.34 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  34 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  35.61 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  33.59 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0229  ferric uptake regulator family protein  32.37 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  35.61 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  34.85 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  34.85 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  34.85 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0833  ferric uptake regulator  34.78 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  34.59 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  34.33 
 
 		 143 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  34.33 
 
 		 143 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  32.85 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  34.33 
 
 		 143 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>