More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1703 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1703  ferric uptake regulator protein  100 
 
 
165 aa  345  2e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.341625 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1610  ferric uptake regulator, Fur family  75.97 
 
 
174 aa  253  6e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.596418  normal  0.587643 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4578  ferric uptake regulator, Fur family  77.08 
 
 
166 aa  246  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.622664  normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1203  ferric-uptake regulator  72.97 
 
 
164 aa  230  7.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.43174 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0159  ferric uptake regulator, Fur family  54.04 
 
 
176 aa  192  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2222  ferric uptake regulator family protein  60.61 
 
 
152 aa  176  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08771  putative iron storage-related regulatory protein  57.89 
 
 
151 aa  168  3e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.139976  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0247  ferric uptake regulator, Fur family  54.93 
 
 
165 aa  167  6e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  36.69 
 
 
167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  34.67 
 
 
167 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  34.67 
 
 
167 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  36.03 
 
 
143 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  38.76 
 
 
176 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1680  ferric uptake regulator, Fur family  36.88 
 
 
167 aa  103  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2620  ferric uptake regulator, Fur family  36.17 
 
 
164 aa  99.4  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0896  ferric uptake regulator, Fur family  34.84 
 
 
166 aa  97.4  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  32.24 
 
 
152 aa  97.1  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1474  ferric uptake regulator family protein  31.01 
 
 
168 aa  96.3  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1982  ferric uptake regulator family protein  36.5 
 
 
165 aa  95.1  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1573  ferric uptake regulator, Fur family  34.87 
 
 
171 aa  95.1  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00719756 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  33.1 
 
 
148 aa  94  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0314  ferric uptake regulator family protein  34.51 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0295931  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3924  ferric uptake regulator family protein  34.9 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.567476 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  32.14 
 
 
144 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2145  ferric-uptake regulator  32.65 
 
 
164 aa  89  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 
143 aa  88.2  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  32.59 
 
 
143 aa  88.2  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  31.97 
 
 
146 aa  87  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  32.31 
 
 
154 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0934  ferric uptake regulator family protein  34.53 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.634788  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  32.59 
 
 
153 aa  86.3  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 
149 aa  86.3  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  32.59 
 
 
143 aa  86.3  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  32.84 
 
 
143 aa  85.5  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3806  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
152 aa  83.6  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5908  ferric uptake regulator, Fur family  31.88 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616966  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2593  ferric uptake regulator family protein  35.04 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000283641 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3863  ferric uptake regulator, Fur family  31.43 
 
 
160 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199126  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3949  ferric uptake regulator, Fur family  32.58 
 
 
160 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.234293  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0229  ferric uptake regulator family protein  33.57 
 
 
151 aa  82  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  33.56 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  33.56 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0570  ferric uptake regulator family protein  35.04 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1084  ferric uptake regulator, Fur family  35.43 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.784641  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  33.56 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0544  ferric uptake regulator family protein  35.04 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0596927  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3735  ferric uptake regulator family protein  35.04 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345676 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0616  ferric uptake regulator family protein  34.31 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.740565  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  33.33 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2737  ferric uptake regulator family protein  34.31 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348547  normal  0.830954 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0166  ferric uptake regulator family protein  34.31 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0649  ferric uptake regulator family protein  34.31 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  34.48 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  32.89 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2338  ferric uptake regulator  32.69 
 
 
169 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807618  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0753  ferric uptake regulator family protein  34.56 
 
 
148 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.629039  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  35.07 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  35.07 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  35.07 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2066  ferric uptake regulator family protein  34.13 
 
 
141 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.779744  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  35.07 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1593  ferric uptake regulator  34.33 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000083166  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  31.58 
 
 
154 aa  77.8  0.00000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  34.33 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  34.33 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3385  ferric uptake regulator, Fur family  33.58 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.514247  hitchhiker  0.0000888993 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  32.64 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  30.92 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  30.28 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  34.59 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  34.33 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  32.87 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0571  ferric uptake regulator family protein  33.58 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0967  ferric uptake regulator, Fur family  33.09 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.924679  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0251  ferric uptake regulator, Fur family  32.14 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1206  ferric uptake regulator  33.33 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000560641  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  33.33 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  32.85 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  33.58 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  30.77 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  33.58 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3125  ferric uptake regulator  33.33 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  33.33 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2385  ferric uptake regulator family protein  34.38 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2458  ferric uptake regulator  33.33 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3420  ferric uptake regulator  33.33 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133952  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3457  ferric uptake regulator  33.33 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1206  ferric uptake regulator  33.33 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0984  ferric uptake regulator family protein  33.61 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3791  ferric uptake regulator family protein  34.07 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2645  ferric uptake regulator  33.33 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1234  ferric uptake regulator  33.33 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3455  ferric uptake regulator  33.33 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114286  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0375  ferric uptake regulator  33.33 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  31.33 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2837  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  31.88 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  33.58 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  31.79 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  31.79 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>