More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1610 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1610  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 174 aa  367  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.596418  normal  0.587643 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4578  ferric uptake regulator, Fur family  80.39 
 
 		 166 aa  271  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.622664  normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1703  ferric uptake regulator protein  75.97 
 
 		 165 aa  253  6e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.341625 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1203  ferric-uptake regulator  71.83 
 
 		 164 aa  225  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.43174 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0159  ferric uptake regulator, Fur family  56.05 
 
 		 176 aa  200  9e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2222  ferric uptake regulator family protein  56.93 
 
 		 152 aa  176  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0247  ferric uptake regulator, Fur family  50.98 
 
 		 165 aa  171  2.9999999999999996e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08771  putative iron storage-related regulatory protein  54.68 
 
 		 151 aa  167  5e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.139976  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2620  ferric uptake regulator, Fur family  39.29 
 
 		 164 aa  112  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1982  ferric uptake regulator family protein  40.28 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  38.46 
 
 		 167 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1680  ferric uptake regulator, Fur family  37.96 
 
 		 167 aa  107  8.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  37.69 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  37.69 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  37.59 
 
 		 143 aa  106  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  38.76 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0314  ferric uptake regulator family protein  36.88 
 
 		 164 aa  103  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0295931  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1474  ferric uptake regulator family protein  35.76 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1573  ferric uptake regulator, Fur family  36.42 
 
 		 171 aa  101  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719756 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0896  ferric uptake regulator, Fur family  37.32 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2145  ferric-uptake regulator  36.57 
 
 		 164 aa  99  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 143 aa  94.7  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  33.08 
 
 		 152 aa  94  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  30.77 
 
 		 154 aa  90.9  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  32.35 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  31.91 
 
 		 149 aa  90.5  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5908  ferric uptake regulator, Fur family  34.59 
 
 		 165 aa  89.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  32.06 
 
 		 148 aa  89.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  33.08 
 
 		 146 aa  87.8  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  32.58 
 
 		 144 aa  87.4  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  30.88 
 
 		 143 aa  87  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  30.88 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  31.39 
 
 		 153 aa  87  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3806  ferric uptake regulator family protein  33.85 
 
 		 152 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3949  ferric uptake regulator, Fur family  33.08 
 
 		 160 aa  85.5  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.234293  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3863  ferric uptake regulator, Fur family  33.08 
 
 		 160 aa  85.5  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199126  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3924  ferric uptake regulator family protein  32.41 
 
 		 182 aa  84.3  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.567476 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0967  ferric uptake regulator, Fur family  33.09 
 
 		 142 aa  84  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.924679  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  31.03 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0753  ferric uptake regulator family protein  33.57 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.629039  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0894  ferric uptake regulator family protein  33.09 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572753 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  31.21 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  31.21 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  32.54 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  32.03 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  31.34 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  32.03 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  34.09 
 
 		 158 aa  80.5  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  32.84 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2593  ferric uptake regulator family protein  32.12 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000283641 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  32.84 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  32.84 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  32.84 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  32.84 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0229  ferric uptake regulator family protein  33.09 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0934  ferric uptake regulator family protein  31.62 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.634788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3791  ferric uptake regulator family protein  33.82 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2066  ferric uptake regulator family protein  34.71 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.779744  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3735  ferric uptake regulator family protein  32.85 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345676 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0570  ferric uptake regulator family protein  32.85 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  31.88 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  32.09 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  32.09 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0544  ferric uptake regulator family protein  32.85 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0596927  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  31.82 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  31.43 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1084  ferric uptake regulator, Fur family  35.66 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.784641  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4610  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 181 aa  78.2  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  32.84 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1593  ferric uptake regulator  32.84 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000083166  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  30.66 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  32.09 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  30.56 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  30.37 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2737  ferric uptake regulator family protein  32.12 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348547  normal  0.830954 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0616  ferric uptake regulator family protein  32.12 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.740565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0166  ferric uptake regulator family protein  32.12 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  32.09 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0649  ferric uptake regulator family protein  32.12 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0251  ferric uptake regulator, Fur family  31.39 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  33.33 
 
 		 148 aa  77  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  32.84 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0984  ferric uptake regulator family protein  33.06 
 
 		 140 aa  77  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2976  ferric uptake regulator family protein  32.61 
 
 		 143 aa  77  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  32.58 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  31.01 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  28.79 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  31.01 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  32.09 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2338  ferric uptake regulator  32.09 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807618  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  33.33 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  32.58 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  33.33 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  34.11 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  32.58 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  32.09 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>