More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0159 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0159  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 176 aa  369  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4578  ferric uptake regulator, Fur family  58.33 
 
 		 166 aa  204  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.622664  normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1610  ferric uptake regulator, Fur family  56.05 
 
 		 174 aa  200  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.596418  normal  0.587643 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1203  ferric-uptake regulator  57.89 
 
 		 164 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.43174 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1703  ferric uptake regulator protein  54.04 
 
 		 165 aa  192  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.341625 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2222  ferric uptake regulator family protein  54.35 
 
 		 152 aa  174  8e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0247  ferric uptake regulator, Fur family  49.36 
 
 		 165 aa  169  1e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08771  putative iron storage-related regulatory protein  53.79 
 
 		 151 aa  164  5.9999999999999996e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.139976  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  41.91 
 
 		 167 aa  124  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  41.18 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  41.18 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  41.55 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1680  ferric uptake regulator, Fur family  37.59 
 
 		 167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2620  ferric uptake regulator, Fur family  37.58 
 
 		 164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1982  ferric uptake regulator family protein  38.78 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  38.76 
 
 		 176 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0314  ferric uptake regulator family protein  34.64 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0295931  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2145  ferric-uptake regulator  41.67 
 
 		 164 aa  106  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0896  ferric uptake regulator, Fur family  37.59 
 
 		 166 aa  105  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1474  ferric uptake regulator family protein  35.56 
 
 		 168 aa  105  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1573  ferric uptake regulator, Fur family  36.62 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719756 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0753  ferric uptake regulator family protein  38.85 
 
 		 148 aa  102  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.629039  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  37.78 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  35.56 
 
 		 143 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  39.1 
 
 		 143 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  39.1 
 
 		 143 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  37.59 
 
 		 143 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0967  ferric uptake regulator, Fur family  37.68 
 
 		 142 aa  99.8  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.924679  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  33.55 
 
 		 154 aa  99  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  32.89 
 
 		 152 aa  96.7  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  30.67 
 
 		 149 aa  95.5  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5908  ferric uptake regulator, Fur family  32.67 
 
 		 165 aa  94.4  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  36.36 
 
 		 144 aa  93.2  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  37.24 
 
 		 150 aa  93.2  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1123  ferric uptake regulator family protein  35.46 
 
 		 148 aa  92.4  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.488583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  34.07 
 
 		 146 aa  92  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 148 aa  91.7  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  35.21 
 
 		 157 aa  91.7  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  35.21 
 
 		 157 aa  91.7  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  34.53 
 
 		 150 aa  91.3  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  34.78 
 
 		 148 aa  91.3  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  34.78 
 
 		 148 aa  91.3  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2576  ferric uptake regulator, Fur family  37.41 
 
 		 143 aa  91.3  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.710249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2986  ferric uptake regulator, Fur family  37.41 
 
 		 143 aa  91.3  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.105319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0928  FUR family manganese uptake regulator  41.13 
 
 		 138 aa  91.3  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2747  ferric uptake transcriptional repressor transcription regulator protein  37.41 
 
 		 143 aa  90.5  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  34.51 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  34.85 
 
 		 143 aa  90.5  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  36.36 
 
 		 151 aa  90.1  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0833  ferric uptake regulator  34.78 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  34.06 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  36.36 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1727  ferric uptake regulator, Fur family  37.59 
 
 		 146 aa  89  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  33.57 
 
 		 158 aa  89  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  34.78 
 
 		 148 aa  89.4  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3791  ferric uptake regulator family protein  36.69 
 
 		 152 aa  89  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1206  ferric uptake regulator  36.36 
 
 		 149 aa  88.6  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000560641  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3125  ferric uptake regulator  36.36 
 
 		 149 aa  88.6  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3947  FUR family manganese uptake regulator  36.72 
 
 		 142 aa  88.6  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.960435  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  34.31 
 
 		 147 aa  88.6  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  35.61 
 
 		 150 aa  88.2  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  35.61 
 
 		 150 aa  88.2  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  35.61 
 
 		 150 aa  88.2  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  35.61 
 
 		 150 aa  88.2  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  34.09 
 
 		 143 aa  88.2  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  34.09 
 
 		 143 aa  88.2  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  35.61 
 
 		 148 aa  88.2  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  35.61 
 
 		 148 aa  88.2  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  35.61 
 
 		 148 aa  88.2  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  35.61 
 
 		 148 aa  87.8  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  35.61 
 
 		 148 aa  88.2  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  35.61 
 
 		 148 aa  88.2  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  35.61 
 
 		 148 aa  88.2  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2976  ferric uptake regulator family protein  35.97 
 
 		 143 aa  88.2  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  35.61 
 
 		 150 aa  88.2  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  35.61 
 
 		 148 aa  88.2  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  35.61 
 
 		 148 aa  88.2  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  35.61 
 
 		 148 aa  88.2  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  33.1 
 
 		 149 aa  87.8  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2837  ferric uptake regulator family protein  35.97 
 
 		 143 aa  87.8  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  34.09 
 
 		 143 aa  87.8  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  34.09 
 
 		 143 aa  87.8  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  33.1 
 
 		 155 aa  87  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2058  ferric uptake regulator, Fur family  39.1 
 
 		 145 aa  87  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  33.82 
 
 		 154 aa  87  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 150 aa  86.7  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  34.85 
 
 		 148 aa  86.7  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  31.03 
 
 		 148 aa  86.3  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1799  FUR family manganese uptake regulator  37.19 
 
 		 137 aa  86.3  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1593  ferric uptake regulator  33.58 
 
 		 143 aa  86.7  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000083166  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  31.03 
 
 		 148 aa  86.3  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  33.58 
 
 		 143 aa  86.7  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0894  ferric uptake regulator family protein  34.81 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572753 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  33.1 
 
 		 155 aa  85.9  3e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  33.58 
 
 		 143 aa  85.5  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  34.85 
 
 		 148 aa  85.9  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2338  ferric uptake regulator  33.33 
 
 		 169 aa  85.9  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807618  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3385  ferric uptake regulator, Fur family  36.3 
 
 		 142 aa  85.5  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.514247  hitchhiker  0.0000888993 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4610  ferric uptake regulator family protein  33.55 
 
 		 181 aa  85.1  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  33.58 
 
 		 143 aa  85.5  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>