More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3947 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3947  FUR family manganese uptake regulator  100 
 
 
142 aa  285  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.960435  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1243  ferric uptake regulator family protein  73.05 
 
 
141 aa  204  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1654  ferric uptake regulation protein, putative  75.97 
 
 
141 aa  200  7e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.179894  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1601  putative ferric uptake regulation protein  75.97 
 
 
141 aa  199  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248674  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0360  ferric uptake regulation protein  68.7 
 
 
138 aa  186  8e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2913  ferric uptake regulator family protein  63.24 
 
 
142 aa  164  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3767  ferric uptake regulator family protein  55.56 
 
 
140 aa  147  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2968  ferric uptake regulator family protein  55.12 
 
 
151 aa  145  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3031  ferric uptake regulator family protein  55.97 
 
 
139 aa  142  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2142  putative ferric uptake regulation protein  49.65 
 
 
137 aa  141  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0454  ferric uptake regulator, Fur family  53.68 
 
 
143 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0466  ferric uptake regulator family protein  55.2 
 
 
151 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0021  ferric uptake regulator, Fur family  52.99 
 
 
142 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.531166 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4436  ferric uptake regulator family protein  50.39 
 
 
144 aa  135  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3615  ferric uptake regulator family protein  54.62 
 
 
168 aa  135  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0033  ferric uptake regulator, Fur family  54.76 
 
 
142 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.968997  normal  0.145253 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0044  ferric uptake regulator family protein  53.08 
 
 
150 aa  134  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1799  FUR family manganese uptake regulator  48.91 
 
 
137 aa  134  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0588  ferric uptake regulator family protein  50.74 
 
 
165 aa  133  8e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0932  ferric uptake regulator family protein  53.23 
 
 
137 aa  133  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0013  ferric-uptake regulator  51.11 
 
 
156 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0292053 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1820  ferric uptake regulator family protein  53.44 
 
 
144 aa  132  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.168146 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0244  ferric-uptake regulator  51.47 
 
 
143 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1161  ferric uptake regulator family protein  52.42 
 
 
137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.13561  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0013  ferric uptake regulator family protein  55.46 
 
 
135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00124444  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1260  ferric uptake regulator family protein  53.62 
 
 
140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2494  FUR family manganese uptake regulator  52.42 
 
 
137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2385  ferric uptake regulator family protein  48.87 
 
 
140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0435  ferric uptake regulator  54.76 
 
 
135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2066  ferric uptake regulator family protein  48.12 
 
 
141 aa  131  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.779744  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0984  ferric uptake regulator family protein  52.42 
 
 
140 aa  130  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0020  ferric uptake regulator family protein  53.6 
 
 
149 aa  130  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0165645  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0928  FUR family manganese uptake regulator  48.91 
 
 
138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2101  ferric uptake regulator, Fur family  47.54 
 
 
158 aa  119  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63020  ferric uptake regulation protein  43.41 
 
 
134 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01181  ferric uptake regulator Fur  44.27 
 
 
136 aa  107  8.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0678895  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1516  FUR family transcriptional regulator  43.51 
 
 
146 aa  105  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.995871  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5484  ferric uptake regulation protein  42.64 
 
 
134 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1459  ferric uptake regulator family protein  43.51 
 
 
146 aa  105  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.773495  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  40 
 
 
135 aa  105  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000081899  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4731  ferric uptake regulator family protein  42.64 
 
 
134 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741724  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3627  ferric uptake regulator family protein  42.19 
 
 
139 aa  103  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4730  ferric uptake regulator, Fur family  41.86 
 
 
134 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289101 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  42.74 
 
 
148 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1594  ferric uptake regulator, Fur family  42.31 
 
 
135 aa  103  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0760  ferric uptake regulator family protein  41.09 
 
 
134 aa  102  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.809862  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4596  ferric uptake regulator family protein  41.86 
 
 
134 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.209502 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43000  Ferric-uptake regulator, fur  42.19 
 
 
134 aa  102  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  42.74 
 
 
148 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0702  ferric uptake regulator family protein  41.86 
 
 
134 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49525  hitchhiker  0.0000821406 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4508  ferric uptake regulation protein  40.31 
 
 
135 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.358038  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1334  ferric uptake regulator family protein  42.15 
 
 
150 aa  102  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1690  ferric uptake regulator  40.94 
 
 
150 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000286155  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0833  ferric uptake regulator  41.73 
 
 
147 aa  100  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4198  ferric-uptake regulator  39.53 
 
 
135 aa  100  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  42.74 
 
 
148 aa  100  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  42.06 
 
 
176 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  42.74 
 
 
148 aa  100  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  42.74 
 
 
148 aa  100  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  42.74 
 
 
150 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  42.74 
 
 
148 aa  100  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  42.74 
 
 
150 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  42.74 
 
 
150 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  42.74 
 
 
148 aa  100  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  42.74 
 
 
148 aa  100  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  42.74 
 
 
148 aa  100  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  42.74 
 
 
150 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  42.74 
 
 
150 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  42.74 
 
 
148 aa  100  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  42.74 
 
 
148 aa  100  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  42.74 
 
 
148 aa  100  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  39.06 
 
 
149 aa  98.6  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1206  ferric uptake regulator  42.74 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000560641  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3125  ferric uptake regulator  42.74 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  41.13 
 
 
148 aa  98.2  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2152  ferric uptake regulator  39.68 
 
 
140 aa  98.2  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  39.06 
 
 
149 aa  97.8  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  41.94 
 
 
148 aa  97.8  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  41.94 
 
 
148 aa  97.8  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1575  ferric uptake regulator  42.06 
 
 
147 aa  97.4  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1593  ferric uptake regulator  39.68 
 
 
143 aa  97.4  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000083166  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  40.16 
 
 
143 aa  97.4  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  39.68 
 
 
143 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  39.68 
 
 
143 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  41.13 
 
 
148 aa  96.7  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  40.48 
 
 
143 aa  96.7  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  39.68 
 
 
143 aa  95.9  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  41.13 
 
 
143 aa  95.9  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  39.37 
 
 
161 aa  95.5  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  40.48 
 
 
167 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  35.29 
 
 
143 aa  95.9  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  40.48 
 
 
143 aa  95.9  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  40.48 
 
 
167 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  40.48 
 
 
167 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3097  ferric uptake regulator family protein  39.53 
 
 
150 aa  95.5  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0967  ferric uptake regulator, Fur family  40 
 
 
142 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.924679  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  40.48 
 
 
143 aa  95.5  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2338  ferric uptake regulator  40.16 
 
 
169 aa  95.5  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807618  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  39.68 
 
 
143 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  39.37 
 
 
143 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>