More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1388 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1388  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 
136 aa  278  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00327608  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2366  ferric uptake regulator, Fur family  64.29 
 
 
131 aa  177  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.437919 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0284  ferric uptake regulator family protein  64.8 
 
 
128 aa  174  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0246387 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3674  ferric uptake regulator family protein  62.6 
 
 
129 aa  168  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2513  ferric uptake regulator, Fur family  49.59 
 
 
137 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275348  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0141  ferric uptake regulator, Fur family  50.39 
 
 
133 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.896296  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  43.08 
 
 
134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3251  ferric uptake regulator family protein  47.97 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0822  ferric uptake regulator family protein  46.28 
 
 
126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000300093  normal  0.0104511 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0543  ferric uptake regulator, Fur family  43.2 
 
 
139 aa  104  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.70942 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  40.91 
 
 
144 aa  101  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2005  ferric uptake regulator, Fur family  36.8 
 
 
128 aa  98.6  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0153  ferric uptake regulator, Fur family  37.01 
 
 
139 aa  93.6  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000104646  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0135  ferric uptake regulator, Fur family  37.21 
 
 
139 aa  93.2  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000297915  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0754  ferric uptake regulator family protein  37.69 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.354602  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0101  ferric uptake regulator, Fur family  37.21 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133113  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1354  ferric uptake regulator, Fur family  37.1 
 
 
133 aa  90.1  9e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000236384  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0352  ferric uptake regulator, Fur family  39.37 
 
 
131 aa  89.7  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0149  ferric uptake regulator, Fur family  39.2 
 
 
139 aa  89  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000946287  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1037  ferric uptake regulator family protein  42.53 
 
 
133 aa  88.6  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0953137  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  38.71 
 
 
146 aa  88.6  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2141  ferric uptake regulator family protein  38.89 
 
 
137 aa  87.8  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  38.52 
 
 
143 aa  87.8  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3815  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 
132 aa  87.8  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  35.77 
 
 
150 aa  87.4  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2524  ferric uptake regulator, Fur family  37.4 
 
 
138 aa  87  8e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.568134  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
142 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  31.06 
 
 
166 aa  86.7  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1472  ferric uptake regulator, Fur family  39.53 
 
 
131 aa  86.3  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000290418  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  38.1 
 
 
150 aa  85.5  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
144 aa  85.5  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  37.7 
 
 
144 aa  85.5  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  37.7 
 
 
144 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  37.7 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
144 aa  85.5  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  37.7 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  37.7 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  37.7 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0726  ferric uptake regulator, Fur family  35.48 
 
 
130 aa  85.1  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.787789  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  37.7 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  34.07 
 
 
148 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  34.07 
 
 
148 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3240  ferric uptake regulator family protein  38.52 
 
 
148 aa  84.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000230922  hitchhiker  0.00191408 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1420  FUR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
139 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0522352  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1230  FUR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
139 aa  83.6  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0757057  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3292  FUR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
121 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000231053  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  36 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0122  ferric uptake regulation protein  37.3 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00816522  normal  0.910281 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25080  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  35.38 
 
 
130 aa  82  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0884067  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0584  ferric uptake regulator family protein  37.4 
 
 
149 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.274905  normal  0.220198 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0105  ferric uptake regulator family protein  33.06 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.013681  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  37.69 
 
 
137 aa  82  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1963  ferric uptake regulator family protein  32.33 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0876725  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1966  ferric uptake regulator family protein  37.04 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00359557  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1188  ferric uptake regulator, Fur family  34.13 
 
 
146 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0480  ferric uptake regulator, Fur family  36.89 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1279  transcriptional regulator, Fur family  33.07 
 
 
141 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000471651  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1806  ferric uptake regulator family protein  35.11 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.696064  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1224  ferric uptake regulator family protein  30.95 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.293203  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2198  ferric uptake regulator, Fur family  35.2 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1722  ferric uptake regulator family protein  34.33 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.907916 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1295  ferric uptake regulator family protein  32.28 
 
 
141 aa  77  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000494544  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1505  FUR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000456774  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0615  ferric uptake regulator, Fur family  32.03 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.12884  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1415  ferric uptake regulator family protein  31.97 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000163802  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1792  ferric uptake regulator, Fur family  34.13 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000306351  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2002  ferric uptake regulator family protein  32 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0758566  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  31.75 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3531  ferric uptake regulator, Fur family  31.75 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1300  ferric uptake regulator family protein  30.3 
 
 
151 aa  73.6  0.0000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2798  Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins  32.26 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.1309500000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  30.22 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1143  ferric uptake regulator, Fur family  31.54 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000124537  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  30.22 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0847  ferric uptake regulator, Fur family  30.3 
 
 
146 aa  72  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3209  ferric uptake regulator family protein  37.3 
 
 
147 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.829925  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  29.37 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  36 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2809  FUR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.110848  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2727  ferric uptake regulator family protein  30.08 
 
 
135 aa  70.1  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284846  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  31.78 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0164  ferric uptake regulator, Fur family  30.36 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112785  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  29.32 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1315  transcriptional regulator, TrmB  35.42 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  31.34 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2714  ferric-uptake regulator  34.65 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352648  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4454  ferric uptake regulator, Fur family  34.68 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4099  ferric uptake regulator family protein  27.56 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0486  ferric uptake regulator, Fur family  37.93 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.53591  normal  0.162007 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0184  ferric uptake regulator, Fur family  30.83 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.567959  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0684  ferric uptake regulator family protein  36.15 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564127  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0738  ferric uptake regulator family protein  36.15 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376687  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1623  ferric uptake regulator, Fur family  36 
 
 
137 aa  67  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2723  ferric uptake regulation protein  29.47 
 
 
155 aa  67  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.259626  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  30.53 
 
 
143 aa  67  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  29.85 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2058  ferric uptake regulator, Fur family  39.77 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0263  FUR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2159  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00488582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>