More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0284 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0284  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 128 aa  266  8e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0246387 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3674  ferric uptake regulator family protein  77.24 
 
 		 129 aa  198  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2366  ferric uptake regulator, Fur family  70.63 
 
 		 131 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.437919 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1388  ferric uptake regulator, Fur family  64.8 
 
 		 136 aa  174  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00327608  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2513  ferric uptake regulator, Fur family  52.46 
 
 		 137 aa  137  7e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275348  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0141  ferric uptake regulator, Fur family  53.17 
 
 		 133 aa  136  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.896296  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  47.15 
 
 		 134 aa  123  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0822  ferric uptake regulator family protein  50 
 
 		 126 aa  121  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000300093  normal  0.0104511 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3251  ferric uptake regulator family protein  50.4 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  45.08 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0543  ferric uptake regulator, Fur family  45.74 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.70942 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0726  ferric uptake regulator, Fur family  41.94 
 
 		 130 aa  100  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.787789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0352  ferric uptake regulator, Fur family  39.84 
 
 		 131 aa  100  9e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2524  ferric uptake regulator, Fur family  41.27 
 
 		 138 aa  99.8  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.568134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25080  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  40.48 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0884067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1806  ferric uptake regulator family protein  43.2 
 
 		 141 aa  98.2  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.696064  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2005  ferric uptake regulator, Fur family  37.8 
 
 		 128 aa  98.2  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  42.75 
 
 		 137 aa  97.4  6e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0101  ferric uptake regulator, Fur family  39.68 
 
 		 139 aa  97.1  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133113  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  40.5 
 
 		 143 aa  94.4  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 142 aa  94  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1472  ferric uptake regulator, Fur family  40.32 
 
 		 131 aa  93.6  8e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000290418  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  39.67 
 
 		 142 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  39.67 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  39.67 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  39.67 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  39.67 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  39.67 
 
 		 142 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  39.67 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1722  ferric uptake regulator family protein  38.89 
 
 		 146 aa  92  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.907916 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0122  ferric uptake regulation protein  40.32 
 
 		 154 aa  91.3  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00816522  normal  0.910281 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0149  ferric uptake regulator, Fur family  38.02 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000946287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  39.67 
 
 		 150 aa  90.9  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  39.67 
 
 		 150 aa  89.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2141  ferric uptake regulator family protein  37.98 
 
 		 137 aa  90.1  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0153  ferric uptake regulator, Fur family  36.36 
 
 		 139 aa  89.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000104646  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3240  ferric uptake regulator family protein  38.84 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000230922  hitchhiker  0.00191408 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  37.7 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3815  ferric uptake regulator family protein  37.69 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  37.7 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1354  ferric uptake regulator, Fur family  40 
 
 		 133 aa  87.4  5e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000236384  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1505  FUR family transcriptional regulator  36 
 
 		 141 aa  87.4  6e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000456774  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0135  ferric uptake regulator, Fur family  36.72 
 
 		 139 aa  87  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000297915  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0754  ferric uptake regulator family protein  36.89 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.354602  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1037  ferric uptake regulator family protein  43.68 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0953137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  37.7 
 
 		 166 aa  85.9  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1966  ferric uptake regulator family protein  38.58 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00359557  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3292  FUR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000231053  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0584  ferric uptake regulator family protein  39.34 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.274905  normal  0.220198 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1420  FUR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0522352  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1230  FUR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0757057  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1279  transcriptional regulator, Fur family  34.96 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000471651  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1295  ferric uptake regulator family protein  34.4 
 
 		 141 aa  84  7e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000494544  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3112  ferric uptake regulator family protein  41.27 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.966736  normal  0.35423 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2727  ferric uptake regulator family protein  36.59 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284846  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  37.7 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2002  ferric uptake regulator family protein  36.51 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0758566  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0105  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.013681  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0480  ferric uptake regulator, Fur family  35.48 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1241  ferric uptake regulator, Fur family  36.07 
 
 		 170 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00903138 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  34.15 
 
 		 143 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  34.15 
 
 		 143 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3531  ferric uptake regulator, Fur family  34.15 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1224  ferric uptake regulator family protein  33.88 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.293203  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1415  ferric uptake regulator family protein  33.07 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000163802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2198  ferric uptake regulator, Fur family  38.52 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  35.25 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  33.85 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  34.96 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  33.88 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0208  ferric uptake regulator family protein  35.34 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  34.15 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1892  Fur family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1188  ferric uptake regulator, Fur family  32.28 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1792  ferric uptake regulator, Fur family  33.06 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000306351  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2809  FUR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.110848  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  32.31 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  31.75 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2730  ferric uptake regulator family protein  36.72 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0347  ferric uptake regulator, Fur family  35.2 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  30.71 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  36.59 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3370  ferric uptake regulator, Fur family  35.48 
 
 		 167 aa  72  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.073099  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2723  ferric uptake regulation protein  33.72 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.259626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  33.33 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  32 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4099  ferric uptake regulator family protein  31.97 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2543  ferric-uptake regulator  37.3 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37741  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  37.1 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  34.4 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2442  ferric uptake regulator, Fur family  35.71 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168746 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  30.47 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  32.56 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>