More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4454 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4454  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 147 aa  289  9e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4803  ferric uptake regulator, Fur family  71.23 
 
 		 154 aa  203  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0145  fur family transcriptional regulator  73.08 
 
 		 140 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0518  ferric ion uptake regulator  71.32 
 
 		 139 aa  193  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0237  Fur family ferric uptake regulator  72.09 
 
 		 161 aa  191  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1937  ferric uptake regulator, Fur family  69.47 
 
 		 137 aa  187  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0166827  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11938  ferric uptake regulation protein furA (fur)  61.43 
 
 		 150 aa  174  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2705  ferric uptake regulator, Fur family  66.14 
 
 		 139 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0874  ferric-uptake regulator  66.92 
 
 		 146 aa  170  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.250116  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1532  ferric uptake regulator family protein  63.43 
 
 		 174 aa  170  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0229059 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2681  ferric uptake regulator family protein  62.41 
 
 		 195 aa  169  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.445944  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2712  ferric uptake regulator family protein  62.41 
 
 		 157 aa  169  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2726  ferric uptake regulator family protein  62.41 
 
 		 157 aa  169  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.20346 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0738  ferric uptake regulator family protein  62.88 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376687  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0684  ferric uptake regulator family protein  62.88 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564127  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2725  ferric uptake regulator, Fur family  59.71 
 
 		 152 aa  168  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22450  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  58.5 
 
 		 159 aa  166  7e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2714  ferric-uptake regulator  59.72 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352648  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0294  ferric uptake regulator, Fur family  61.83 
 
 		 170 aa  165  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.774382  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2983  ferric uptake regulator family protein  64.18 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.319363  normal  0.752016 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36340  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  60.87 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  60.63 
 
 		 139 aa  164  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4192  ferric uptake regulator, Fur family  63.5 
 
 		 141 aa  163  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2095  ferric uptake regulator family protein  62.79 
 
 		 166 aa  163  6.9999999999999995e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.509153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3965  ferric uptake regulator, Fur family  60.9 
 
 		 138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0839  ferric-uptake regulator  61.83 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3452  ferric uptake regulator family protein  59.4 
 
 		 145 aa  161  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20420  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  61.19 
 
 		 140 aa  161  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.375668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3814  ferric uptake regulator, Fur family  58.27 
 
 		 146 aa  161  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000136698  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2053  ferric-uptake regulator  57.14 
 
 		 201 aa  160  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3209  ferric uptake regulator family protein  57.14 
 
 		 147 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.829925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1102  ferric uptake regulator, Fur family  56.59 
 
 		 140 aa  160  6e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.387055  normal  0.912899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  62.5 
 
 		 139 aa  157  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2124  ferric uptake regulator, Fur family  59.7 
 
 		 157 aa  157  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.506102  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1623  ferric uptake regulator, Fur family  59.85 
 
 		 137 aa  156  8e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2159  ferric uptake regulator family protein  58.65 
 
 		 146 aa  156  8e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00488582 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01070  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  62.2 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3313  ferric uptake regulator, Fur family  58.52 
 
 		 146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.977689  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0468  ferric-uptake regulator  56.72 
 
 		 173 aa  153  8e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0866  ferric uptake regulator, Fur family  55.63 
 
 		 154 aa  150  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0758878  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3239  ferric uptake regulator, Fur family  57.81 
 
 		 173 aa  142  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24980  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  57.48 
 
 		 153 aa  140  6e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4885  ferric uptake regulator family protein  67.71 
 
 		 108 aa  130  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0503467  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4974  ferric uptake regulator family protein  67.71 
 
 		 108 aa  130  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5253  ferric uptake regulator family protein  58.26 
 
 		 158 aa  126  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4279  ferric uptake regulator, Fur family  48.59 
 
 		 183 aa  116  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000762776  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3077  ferric uptake regulator family protein  48.46 
 
 		 155 aa  115  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2781  ferric uptake regulator, Fur family  48.46 
 
 		 164 aa  114  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.028886 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2141  ferric uptake regulator family protein  41.27 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  29.37 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2620  ferric uptake regulator, Fur family  33.85 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0105  ferric uptake regulator family protein  31.25 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.013681  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  31.58 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  29.2 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1792  ferric uptake regulator, Fur family  36.15 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000306351  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1143  ferric uptake regulator, Fur family  31.34 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000124537  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  31.25 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2513  ferric uptake regulator, Fur family  33.83 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275348  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  29.23 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1315  transcriptional regulator, TrmB  31.06 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1966  ferric uptake regulator family protein  31.06 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0314  ferric uptake regulator family protein  34.11 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0295931  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0726  ferric uptake regulator, Fur family  35.77 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.787789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2050  ferric uptake regulator, Fur family  32.35 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1388  ferric uptake regulator, Fur family  34.68 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00327608  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0767  ferric uptake regulator family protein  32.28 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.531572  normal  0.0222977 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  32.61 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  31.58 
 
 		 142 aa  67  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4251  FUR family nickel uptake regulator  33.08 
 
 		 139 aa  67  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0966436  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  28.28 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3278  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.351465 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  27.59 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0122  ferric uptake regulation protein  30.95 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00816522  normal  0.910281 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  26.56 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1892  Fur family transcriptional regulator  25 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  28.79 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  28.78 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  27.14 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  27.14 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  27.14 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  27.14 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  27.14 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0284  ferric uptake regulator family protein  35.77 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0246387 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  31.11 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3653  ferric uptake regulator family protein  33.09 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188238  normal  0.295199 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  34.72 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.499744 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07451  ferric uptake regulator family protein  31.65 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0979772 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  28.03 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  28.03 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  28.79 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  29.71 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0529  ferric uptake regulator, Fur family  28.36 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000605392  normal  0.102669 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0184  ferric uptake regulator, Fur family  36.5 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.567959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0332  ferric uptake regulator, Fur family  28.15 
 
 		 146 aa  62  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000307002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0347  ferric uptake regulator, Fur family  32.81 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0734  ferric uptake regulator family protein  24.48 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000194517  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2366  ferric uptake regulator, Fur family  34.15 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.437919 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>