More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2053 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2053  ferric-uptake regulator  100 
 
 		 201 aa  403  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2159  ferric uptake regulator family protein  89.63 
 
 		 146 aa  246  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00488582 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11938  ferric uptake regulation protein furA (fur)  70.07 
 
 		 150 aa  202  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1532  ferric uptake regulator family protein  66.45 
 
 		 174 aa  202  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0229059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4192  ferric uptake regulator, Fur family  69.34 
 
 		 141 aa  201  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3452  ferric uptake regulator family protein  69.78 
 
 		 145 aa  201  6e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0874  ferric-uptake regulator  67.88 
 
 		 146 aa  191  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.250116  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3209  ferric uptake regulator family protein  66.91 
 
 		 147 aa  191  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.829925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2714  ferric-uptake regulator  68.61 
 
 		 147 aa  189  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352648  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2705  ferric uptake regulator, Fur family  65.19 
 
 		 139 aa  185  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2983  ferric uptake regulator family protein  63.64 
 
 		 149 aa  181  7e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.319363  normal  0.752016 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3814  ferric uptake regulator, Fur family  60.58 
 
 		 146 aa  179  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000136698  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2681  ferric uptake regulator family protein  53.89 
 
 		 195 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.445944  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2712  ferric uptake regulator family protein  63.5 
 
 		 157 aa  177  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2726  ferric uptake regulator family protein  63.5 
 
 		 157 aa  177  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.20346 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2124  ferric uptake regulator, Fur family  62.12 
 
 		 157 aa  177  9e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.506102  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0294  ferric uptake regulator, Fur family  60.28 
 
 		 170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.774382  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01070  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  63.43 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3313  ferric uptake regulator, Fur family  60.84 
 
 		 146 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.977689  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  59.26 
 
 		 139 aa  172  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3965  ferric uptake regulator, Fur family  60.45 
 
 		 138 aa  167  7e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22450  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  64.06 
 
 		 159 aa  166  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4803  ferric uptake regulator, Fur family  60.77 
 
 		 154 aa  162  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0145  fur family transcriptional regulator  56.93 
 
 		 140 aa  162  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2725  ferric uptake regulator, Fur family  58.74 
 
 		 152 aa  161  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0839  ferric-uptake regulator  57.14 
 
 		 143 aa  160  9e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0738  ferric uptake regulator family protein  61.83 
 
 		 142 aa  160  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376687  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4454  ferric uptake regulator, Fur family  57.14 
 
 		 147 aa  160  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1623  ferric uptake regulator, Fur family  60.94 
 
 		 137 aa  159  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0684  ferric uptake regulator family protein  61.83 
 
 		 142 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564127  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0468  ferric-uptake regulator  52.26 
 
 		 173 aa  159  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36340  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  60.61 
 
 		 151 aa  159  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  56.3 
 
 		 139 aa  158  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0518  ferric ion uptake regulator  56.3 
 
 		 139 aa  158  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1102  ferric uptake regulator, Fur family  54.55 
 
 		 140 aa  158  5e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.387055  normal  0.912899 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2095  ferric uptake regulator family protein  58.7 
 
 		 166 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.509153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20420  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  57.58 
 
 		 140 aa  154  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.375668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0866  ferric uptake regulator, Fur family  57.25 
 
 		 154 aa  151  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0758878  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0237  Fur family ferric uptake regulator  54.69 
 
 		 161 aa  148  7e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1937  ferric uptake regulator, Fur family  54.26 
 
 		 137 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0166827  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24980  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  51.72 
 
 		 153 aa  143  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3239  ferric uptake regulator, Fur family  55.88 
 
 		 173 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5253  ferric uptake regulator family protein  59.29 
 
 		 158 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2781  ferric uptake regulator, Fur family  45.99 
 
 		 164 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.028886 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4885  ferric uptake regulator family protein  64.58 
 
 		 108 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0503467  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3077  ferric uptake regulator family protein  45.26 
 
 		 155 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4974  ferric uptake regulator family protein  64.58 
 
 		 108 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4279  ferric uptake regulator, Fur family  45.77 
 
 		 183 aa  121  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000762776  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  31.06 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3769  ferric uptake regulator, Fur family  30.77 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2141  ferric uptake regulator family protein  40.3 
 
 		 137 aa  77  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1143  ferric uptake regulator, Fur family  29.61 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000124537  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  32.61 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3662  ferric uptake regulator, Fur family  30.77 
 
 		 151 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3278  ferric uptake regulator, Fur family  35.88 
 
 		 149 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.351465 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  33.83 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4251  FUR family nickel uptake regulator  32.85 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0966436  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  28.87 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  29.63 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  30.53 
 
 		 166 aa  71.2  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  36.84 
 
 		 149 aa  70.5  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.499744 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1144  ferric uptake regulator family protein  36.89 
 
 		 137 aa  70.9  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2524  ferric uptake regulator, Fur family  33.86 
 
 		 138 aa  71.2  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.568134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  31.54 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2366  ferric uptake regulator, Fur family  31.75 
 
 		 131 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.437919 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  27.14 
 
 		 146 aa  70.5  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  32.35 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  27.46 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  30.6 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3806  ferric uptake regulator family protein  31.76 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1188  ferric uptake regulator, Fur family  30.43 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0734  ferric uptake regulator family protein  28.99 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000194517  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4099  ferric uptake regulator family protein  31.16 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  32.59 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0726  ferric uptake regulator, Fur family  34.38 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.787789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4234  ferric uptake regulator family protein  30.94 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0343972  normal  0.519768 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2620  ferric uptake regulator, Fur family  33.59 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  30.3 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0105  ferric uptake regulator family protein  30.28 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.013681  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  26.76 
 
 		 143 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1597  ferric uptake regulator, Fur family  36.09 
 
 		 139 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2373  ferric uptake regulator, Fur family  34.09 
 
 		 154 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000416204 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0375  ferric uptake regulator family protein  34.35 
 
 		 143 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0406  ferric uptake regulator, Fur family  28.24 
 
 		 139 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3653  ferric uptake regulator family protein  31.58 
 
 		 149 aa  67.4  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188238  normal  0.295199 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  25.37 
 
 		 145 aa  67.8  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 142 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_19  transcriptional regulator, Fur family  30.3 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.677591  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0222  ferric-uptake regulator  31.16 
 
 		 139 aa  67  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0438  ferric uptake regulation protein  33.83 
 
 		 136 aa  67  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0414  ferric uptake regulation protein  33.83 
 
 		 136 aa  67  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0122  ferric uptake regulation protein  33.07 
 
 		 154 aa  67  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00816522  normal  0.910281 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0847  ferric uptake regulator, Fur family  30.43 
 
 		 146 aa  67  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  29.46 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2727  ferric uptake regulator family protein  29.93 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3949  ferric uptake regulator, Fur family  31.08 
 
 		 160 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.234293  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0768  iron ABC transporter  29.5 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000612083  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2638  zinc uptake regulator  33.85 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3863  ferric uptake regulator, Fur family  31.08 
 
 		 160 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199126  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  30.4 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>