More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_19 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_19  transcriptional regulator, Fur family  100 
 
 
142 aa  295  1e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.677591  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0020  FUR family transcriptional regulator  97.89 
 
 
142 aa  290  5e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147149  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  91.55 
 
 
142 aa  274  4e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1315  transcriptional regulator, TrmB  41.98 
 
 
151 aa  130  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2058  ferric uptake regulator, Fur family  40.62 
 
 
145 aa  124  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0473  Fur family ferric uptake regulator  45.74 
 
 
136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4251  FUR family nickel uptake regulator  36.36 
 
 
139 aa  105  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0966436  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  38.41 
 
 
144 aa  104  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0918  ferric uptake regulator  39.26 
 
 
137 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0375  ferric uptake regulator family protein  36.17 
 
 
143 aa  101  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_002936  DET1147  FUR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
135 aa  100  6e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0312  ferric uptake regulator family protein  35.97 
 
 
174 aa  100  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0061  FUR family nickel uptake regulator  39.23 
 
 
150 aa  100  8e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  39.69 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  36.36 
 
 
143 aa  99  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  35.61 
 
 
138 aa  97.1  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0654  ferric uptake regulator, Fur family  42.64 
 
 
136 aa  94.7  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  34.31 
 
 
143 aa  94.4  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 
166 aa  94.4  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  32.85 
 
 
153 aa  93.6  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  39.53 
 
 
142 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  39.53 
 
 
142 aa  93.6  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  39.53 
 
 
142 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  35.29 
 
 
150 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  39.53 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  39.53 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  39.53 
 
 
142 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  39.53 
 
 
142 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  35.17 
 
 
146 aa  92.8  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  31.82 
 
 
148 aa  92  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  34.53 
 
 
151 aa  92.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6836  ferric uptake regulator, Fur family  35.56 
 
 
144 aa  92  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0980  ferric uptake regulator family protein  35.34 
 
 
135 aa  91.7  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.875301  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  38.76 
 
 
142 aa  92  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  33.58 
 
 
143 aa  91.7  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  38.76 
 
 
143 aa  91.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  33.33 
 
 
149 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
149 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
149 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  32.85 
 
 
143 aa  90.9  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1147  ferric uptake regulator family protein  34.04 
 
 
155 aa  90.5  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1036  transcriptional regulator, Fur family  33.81 
 
 
151 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0163253  normal  0.210334 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4201  transcriptional regulator, Fur family  33.81 
 
 
151 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0217905  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  38.28 
 
 
146 aa  90.1  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  33.08 
 
 
152 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3922  ferric uptake regulator family protein  33.81 
 
 
151 aa  90.1  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000572819  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4115  transcriptional regulator, Fur family  33.81 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5116299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4160  FUR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4224  transcriptional regulator, Fur family  33.81 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00546613  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4001  FUR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000832394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3832  FUR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3848  FUR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000844204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4313  FUR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8242  ferric uptake regulator, Fur family  37.31 
 
 
144 aa  89  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  35.04 
 
 
147 aa  88.6  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  37.12 
 
 
150 aa  88.6  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  33.33 
 
 
143 aa  87.8  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  35.94 
 
 
150 aa  87.8  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  32.17 
 
 
147 aa  87.4  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  34.59 
 
 
144 aa  87  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  32.85 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  32.85 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  32.85 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2259  ferric uptake regulator, Fur family  35.51 
 
 
154 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  30.28 
 
 
146 aa  85.9  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  37.21 
 
 
154 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  34.85 
 
 
146 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2029  FUR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
150 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1746  FUR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
150 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5708  ferric uptake regulator, Fur family  34.56 
 
 
143 aa  84.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  30.77 
 
 
144 aa  84  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1241  ferric uptake regulator, Fur family  33.08 
 
 
170 aa  84  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00903138 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  31.58 
 
 
155 aa  84  7e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  29.93 
 
 
145 aa  83.6  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  30.53 
 
 
151 aa  83.6  9e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  27.61 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  27.61 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1892  Fur family transcriptional regulator  30.6 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  27.61 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  35.16 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1006  ferric uptake regulator, Fur family  35.77 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000144475 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  31.47 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0347  ferric uptake regulator, Fur family  36.43 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  31.06 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  31.06 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  30.83 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1806  ferric uptake regulator family protein  34.15 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.696064  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  31.06 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6149  ferric uptake regulator family protein  39.52 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1411  ferric uptake regulator family protein  34.85 
 
 
150 aa  80.1  0.000000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  34.29 
 
 
142 aa  80.1  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2837  ferric uptake regulator family protein  34.09 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0940  ferric uptake regulator, Fur family  32.81 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0529  ferric uptake regulator, Fur family  37.21 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000605392  normal  0.102669 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2747  ferric uptake transcriptional repressor transcription regulator protein  34.09 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4185  ferric uptake regulator, Fur family  32.84 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421488  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0396  ferric uptake regulator, Fur family  35.61 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2986  ferric uptake regulator, Fur family  34.09 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.105319  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>