More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3313 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3313  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 
146 aa  290  3e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.977689  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0874  ferric-uptake regulator  71.43 
 
 
146 aa  197  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.250116  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3452  ferric uptake regulator family protein  61.81 
 
 
145 aa  193  8.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604214  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1532  ferric uptake regulator family protein  66.91 
 
 
174 aa  189  8e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0229059 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11938  ferric uptake regulation protein furA (fur)  65.22 
 
 
150 aa  189  9e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3209  ferric uptake regulator family protein  64.49 
 
 
147 aa  189  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.829925  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2983  ferric uptake regulator family protein  65.44 
 
 
149 aa  181  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.319363  normal  0.752016 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4192  ferric uptake regulator, Fur family  65.22 
 
 
141 aa  180  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2714  ferric-uptake regulator  61.11 
 
 
147 aa  178  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352648  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2681  ferric uptake regulator family protein  62.32 
 
 
195 aa  177  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.445944  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2712  ferric uptake regulator family protein  62.32 
 
 
157 aa  177  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2726  ferric uptake regulator family protein  62.32 
 
 
157 aa  177  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20346 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2053  ferric-uptake regulator  60.84 
 
 
201 aa  172  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2159  ferric uptake regulator family protein  63.64 
 
 
146 aa  171  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00488582 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3814  ferric uptake regulator, Fur family  56.34 
 
 
146 aa  170  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000136698  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0294  ferric uptake regulator, Fur family  62.12 
 
 
170 aa  170  5e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.774382  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2705  ferric uptake regulator, Fur family  61.36 
 
 
139 aa  167  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  56.82 
 
 
139 aa  166  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0145  fur family transcriptional regulator  62.12 
 
 
140 aa  165  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1623  ferric uptake regulator, Fur family  60.16 
 
 
137 aa  159  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0518  ferric ion uptake regulator  59.09 
 
 
139 aa  158  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2124  ferric uptake regulator, Fur family  59.38 
 
 
157 aa  158  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.506102  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01070  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  56.39 
 
 
142 aa  155  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0738  ferric uptake regulator family protein  58.59 
 
 
142 aa  154  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376687  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4803  ferric uptake regulator, Fur family  56.62 
 
 
154 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4454  ferric uptake regulator, Fur family  58.52 
 
 
147 aa  154  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  54.89 
 
 
139 aa  153  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0684  ferric uptake regulator family protein  58.59 
 
 
142 aa  152  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564127  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0468  ferric-uptake regulator  50 
 
 
173 aa  152  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20420  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  56.39 
 
 
140 aa  151  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.375668  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1102  ferric uptake regulator, Fur family  53.12 
 
 
140 aa  151  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.387055  normal  0.912899 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22450  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  60.94 
 
 
159 aa  150  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0839  ferric-uptake regulator  56.69 
 
 
143 aa  150  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36340  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  53.68 
 
 
151 aa  149  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0237  Fur family ferric uptake regulator  55.47 
 
 
161 aa  148  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3965  ferric uptake regulator, Fur family  56.69 
 
 
138 aa  147  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2725  ferric uptake regulator, Fur family  53.08 
 
 
152 aa  142  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2095  ferric uptake regulator family protein  54.26 
 
 
166 aa  142  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.509153  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24980  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  51.47 
 
 
153 aa  135  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3239  ferric uptake regulator, Fur family  51.85 
 
 
173 aa  136  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0866  ferric uptake regulator, Fur family  52.67 
 
 
154 aa  134  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0758878  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3077  ferric uptake regulator family protein  51.47 
 
 
155 aa  132  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2781  ferric uptake regulator, Fur family  48.95 
 
 
164 aa  130  7.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.028886 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1937  ferric uptake regulator, Fur family  46.21 
 
 
137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0166827  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5253  ferric uptake regulator family protein  57.55 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4279  ferric uptake regulator, Fur family  45.99 
 
 
183 aa  118  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000762776  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4885  ferric uptake regulator family protein  57.89 
 
 
108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0503467  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4974  ferric uptake regulator family protein  57.89 
 
 
108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  31.03 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0375  ferric uptake regulator family protein  34.04 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2141  ferric uptake regulator family protein  37.69 
 
 
137 aa  80.1  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  29.01 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0418  ferric-uptake regulator  28.36 
 
 
136 aa  79  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00383086  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  31.58 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  36.43 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.499744 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0312  ferric uptake regulator family protein  32.86 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  27.61 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  25.74 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1143  ferric uptake regulator, Fur family  30.6 
 
 
150 aa  73.6  0.0000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000124537  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
144 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  27.13 
 
 
144 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  27.13 
 
 
144 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  27.13 
 
 
142 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  27.13 
 
 
142 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
144 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  27.13 
 
 
142 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  27.13 
 
 
142 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  27.13 
 
 
142 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  27.21 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  27.13 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  22.86 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0767  ferric uptake regulator family protein  36.89 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.531572  normal  0.0222977 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4251  FUR family nickel uptake regulator  32.35 
 
 
139 aa  72  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0966436  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0105  ferric uptake regulator family protein  29.29 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.013681  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  23.85 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0726  ferric uptake regulator, Fur family  34.96 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.787789  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1597  ferric uptake regulator, Fur family  29.25 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  23.4 
 
 
147 aa  70.1  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3278  ferric uptake regulator, Fur family  33.85 
 
 
149 aa  70.1  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.351465 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  25.53 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1354  ferric uptake regulator, Fur family  34.96 
 
 
133 aa  68.6  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000236384  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  27.34 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  28.37 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4099  ferric uptake regulator family protein  28.99 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3924  ferric uptake regulator family protein  34.03 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.567476 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0352  ferric uptake regulator, Fur family  34.43 
 
 
131 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3662  ferric uptake regulator, Fur family  32.31 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3806  ferric uptake regulator family protein  34.07 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0222  ferric-uptake regulator  29.2 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1641  FUR family transcriptional regulator  30 
 
 
136 aa  67  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.600696  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0347  ferric uptake regulator, Fur family  30.15 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  23.53 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3863  ferric uptake regulator, Fur family  34.62 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199126  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  23.53 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3949  ferric uptake regulator, Fur family  34.62 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.234293  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3769  ferric uptake regulator, Fur family  31.54 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0593  ferric uptake regulator family protein  30.94 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.211078  unclonable  0.00000627235 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  25.64 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6836  ferric uptake regulator, Fur family  33.58 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>