More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2124 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2124  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 
157 aa  315  2e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.506102  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0294  ferric uptake regulator, Fur family  60.13 
 
 
170 aa  182  1.0000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.774382  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2053  ferric-uptake regulator  62.12 
 
 
201 aa  177  4.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11938  ferric uptake regulation protein furA (fur)  60.9 
 
 
150 aa  176  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2159  ferric uptake regulator family protein  61.48 
 
 
146 aa  174  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00488582 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0684  ferric uptake regulator family protein  61.43 
 
 
142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564127  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3452  ferric uptake regulator family protein  58.96 
 
 
145 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604214  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2714  ferric-uptake regulator  61.48 
 
 
147 aa  170  5.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352648  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0839  ferric-uptake regulator  61.83 
 
 
143 aa  170  6.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1102  ferric uptake regulator, Fur family  55.4 
 
 
140 aa  169  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.387055  normal  0.912899 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  61.72 
 
 
139 aa  169  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2983  ferric uptake regulator family protein  59.71 
 
 
149 aa  169  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.319363  normal  0.752016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3209  ferric uptake regulator family protein  57.46 
 
 
147 aa  168  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.829925  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0738  ferric uptake regulator family protein  59.29 
 
 
142 aa  167  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376687  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1623  ferric uptake regulator, Fur family  62.22 
 
 
137 aa  165  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0866  ferric uptake regulator, Fur family  61.64 
 
 
154 aa  165  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0758878  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3814  ferric uptake regulator, Fur family  59.23 
 
 
146 aa  164  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000136698  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0874  ferric-uptake regulator  61.07 
 
 
146 aa  164  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.250116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4192  ferric uptake regulator, Fur family  58.96 
 
 
141 aa  163  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  63.08 
 
 
139 aa  163  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2681  ferric uptake regulator family protein  55 
 
 
195 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.445944  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36340  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  60.31 
 
 
151 aa  163  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2705  ferric uptake regulator, Fur family  58.59 
 
 
139 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2712  ferric uptake regulator family protein  55 
 
 
157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2726  ferric uptake regulator family protein  55 
 
 
157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20346 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2095  ferric uptake regulator family protein  61.54 
 
 
166 aa  160  5.0000000000000005e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.509153  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0518  ferric ion uptake regulator  57.14 
 
 
139 aa  160  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1532  ferric uptake regulator family protein  58.02 
 
 
174 aa  159  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0229059 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22450  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  59.7 
 
 
159 aa  159  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01070  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  56.03 
 
 
142 aa  158  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3965  ferric uptake regulator, Fur family  57.25 
 
 
138 aa  158  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3313  ferric uptake regulator, Fur family  59.38 
 
 
146 aa  158  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.977689  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4454  ferric uptake regulator, Fur family  59.7 
 
 
147 aa  157  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0145  fur family transcriptional regulator  56.49 
 
 
140 aa  155  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4803  ferric uptake regulator, Fur family  54.48 
 
 
154 aa  152  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0237  Fur family ferric uptake regulator  56.92 
 
 
161 aa  152  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0468  ferric-uptake regulator  51.16 
 
 
173 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20420  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  51.08 
 
 
140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.375668  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2725  ferric uptake regulator, Fur family  53.12 
 
 
152 aa  143  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1937  ferric uptake regulator, Fur family  52.71 
 
 
137 aa  135  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0166827  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3239  ferric uptake regulator, Fur family  52.9 
 
 
173 aa  134  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24980  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  53.12 
 
 
153 aa  133  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4885  ferric uptake regulator family protein  65.66 
 
 
108 aa  130  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0503467  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4974  ferric uptake regulator family protein  65.66 
 
 
108 aa  130  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3077  ferric uptake regulator family protein  46.15 
 
 
155 aa  128  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5253  ferric uptake regulator family protein  58.18 
 
 
158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2781  ferric uptake regulator, Fur family  47.41 
 
 
164 aa  127  6e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.028886 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4279  ferric uptake regulator, Fur family  44.59 
 
 
183 aa  122  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000762776  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2141  ferric uptake regulator family protein  42.4 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  29.77 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3278  ferric uptake regulator, Fur family  34.92 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.351465 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1143  ferric uptake regulator, Fur family  30.53 
 
 
150 aa  73.6  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000124537  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  34.11 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0473  Fur family ferric uptake regulator  30.88 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3769  ferric uptake regulator, Fur family  32 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  30.16 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  29.93 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3662  ferric uptake regulator, Fur family  32.54 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  32.54 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  27.01 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0438  ferric uptake regulation protein  29.55 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0414  ferric uptake regulation protein  29.55 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  29.55 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  29.55 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  29.55 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  29.55 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  29.55 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  29.55 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  29.55 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1966  ferric uptake regulator family protein  32.06 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00359557  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  27.69 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2809  FUR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.110848  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  26.98 
 
 
143 aa  67  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  27.21 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0406  ferric uptake regulator, Fur family  26.52 
 
 
139 aa  67  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  26.98 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0149  ferric uptake regulator, Fur family  28.57 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000946287  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  26.28 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  21.21 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2661  ferric uptake regulator family protein  33.58 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.946961  normal  0.0414019 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  32 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0654  ferric uptake regulator, Fur family  32.35 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0312  ferric uptake regulator family protein  32.84 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1451  ferric uptake regulation protein  26.67 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000060196  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0918  ferric uptake regulator  28.89 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5530  ferric uptake regulator family protein  29.93 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1469  ferric uptake regulator, Fur family  34.15 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0185274  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0418  ferric-uptake regulator  25.98 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00383086  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1389  ferric uptake regulation protein  26.67 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000498211  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0375  ferric uptake regulator family protein  31.34 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1142  ferric uptake regulator family protein  27.14 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000076439  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  27.41 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  27.27 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2576  ferric uptake regulator, Fur family  29.37 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.710249  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2986  ferric uptake regulator, Fur family  29.37 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.105319  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0061  FUR family nickel uptake regulator  31.39 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  31.69 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>