More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1532 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1532  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 
174 aa  351  2.9999999999999997e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0229059 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0874  ferric-uptake regulator  78.95 
 
 
146 aa  214  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.250116  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3452  ferric uptake regulator family protein  70.29 
 
 
145 aa  204  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604214  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11938  ferric uptake regulation protein furA (fur)  72.46 
 
 
150 aa  204  4e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2681  ferric uptake regulator family protein  61.68 
 
 
195 aa  204  7e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.445944  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4192  ferric uptake regulator, Fur family  72.06 
 
 
141 aa  202  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2053  ferric-uptake regulator  66.45 
 
 
201 aa  202  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2159  ferric uptake regulator family protein  71.64 
 
 
146 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00488582 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3209  ferric uptake regulator family protein  68.84 
 
 
147 aa  197  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.829925  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2983  ferric uptake regulator family protein  71.32 
 
 
149 aa  195  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.319363  normal  0.752016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2712  ferric uptake regulator family protein  63.87 
 
 
157 aa  194  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2726  ferric uptake regulator family protein  63.87 
 
 
157 aa  194  6e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20346 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2714  ferric-uptake regulator  68.38 
 
 
147 aa  193  9e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352648  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3313  ferric uptake regulator, Fur family  66.91 
 
 
146 aa  189  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.977689  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2705  ferric uptake regulator, Fur family  69.77 
 
 
139 aa  188  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3814  ferric uptake regulator, Fur family  64.39 
 
 
146 aa  186  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000136698  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  65.62 
 
 
139 aa  179  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01070  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  63.16 
 
 
142 aa  177  9e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4454  ferric uptake regulator, Fur family  63.43 
 
 
147 aa  170  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22450  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  60.56 
 
 
159 aa  167  5e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0839  ferric-uptake regulator  63.28 
 
 
143 aa  166  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0145  fur family transcriptional regulator  60.16 
 
 
140 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1102  ferric uptake regulator, Fur family  52.21 
 
 
140 aa  160  7e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.387055  normal  0.912899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  57.89 
 
 
139 aa  159  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3965  ferric uptake regulator, Fur family  60.63 
 
 
138 aa  160  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0294  ferric uptake regulator, Fur family  60.16 
 
 
170 aa  160  1e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.774382  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2124  ferric uptake regulator, Fur family  58.02 
 
 
157 aa  159  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.506102  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0738  ferric uptake regulator family protein  62.02 
 
 
142 aa  159  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376687  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0468  ferric-uptake regulator  49.69 
 
 
173 aa  159  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20420  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  60.94 
 
 
140 aa  159  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.375668  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4803  ferric uptake regulator, Fur family  61.42 
 
 
154 aa  158  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0684  ferric uptake regulator family protein  62.5 
 
 
142 aa  158  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564127  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2725  ferric uptake regulator, Fur family  57.25 
 
 
152 aa  158  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0518  ferric ion uptake regulator  59.06 
 
 
139 aa  157  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0237  Fur family ferric uptake regulator  58.27 
 
 
161 aa  157  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1623  ferric uptake regulator, Fur family  57.25 
 
 
137 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0866  ferric uptake regulator, Fur family  56.93 
 
 
154 aa  152  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0758878  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36340  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  57.25 
 
 
151 aa  152  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2095  ferric uptake regulator family protein  58.59 
 
 
166 aa  145  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.509153  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1937  ferric uptake regulator, Fur family  54.26 
 
 
137 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0166827  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24980  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  53.33 
 
 
153 aa  142  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3239  ferric uptake regulator, Fur family  55.64 
 
 
173 aa  139  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5253  ferric uptake regulator family protein  60.58 
 
 
158 aa  131  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4885  ferric uptake regulator family protein  63.37 
 
 
108 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0503467  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4974  ferric uptake regulator family protein  63.37 
 
 
108 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3077  ferric uptake regulator family protein  51.15 
 
 
155 aa  129  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4279  ferric uptake regulator, Fur family  42.26 
 
 
183 aa  126  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000762776  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2781  ferric uptake regulator, Fur family  48.85 
 
 
164 aa  121  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.028886 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2141  ferric uptake regulator family protein  42.06 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0105  ferric uptake regulator family protein  30.5 
 
 
147 aa  79  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.013681  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  32.35 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1143  ferric uptake regulator, Fur family  31.06 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000124537  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  29.55 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  36.09 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.499744 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  30.66 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2513  ferric uptake regulator, Fur family  33.82 
 
 
137 aa  72  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275348  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2620  ferric uptake regulator, Fur family  30.07 
 
 
164 aa  72  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  27.21 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4251  FUR family nickel uptake regulator  33.33 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0966436  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  31.54 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  32.61 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0375  ferric uptake regulator family protein  32.81 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3389  ferric uptake regulator family protein  33.09 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.261962  normal  0.0261677 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  31.06 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  30.28 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  30.28 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4099  ferric uptake regulator family protein  30.6 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1140  ferric uptake regulator family protein  34.67 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  31.06 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  31.06 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  31.06 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  31.06 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3278  ferric uptake regulator, Fur family  31.78 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.351465 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  31.06 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  29.23 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  29.6 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0312  ferric uptake regulator family protein  32.56 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0122  ferric uptake regulation protein  29.92 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00816522  normal  0.910281 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0529  ferric uptake regulator, Fur family  25.93 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000605392  normal  0.102669 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  28.91 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2366  ferric uptake regulator, Fur family  30 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.437919 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  24.09 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  26.36 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  26.36 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3662  ferric uptake regulator, Fur family  29.41 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0726  ferric uptake regulator, Fur family  32.26 
 
 
130 aa  63.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.787789  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1388  ferric uptake regulator, Fur family  32.31 
 
 
136 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00327608  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3769  ferric uptake regulator, Fur family  28.47 
 
 
151 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  23.4 
 
 
155 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  23.94 
 
 
146 aa  63.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0543  ferric uptake regulator, Fur family  27.91 
 
 
139 aa  63.2  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.70942 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  24.11 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1474  ferric uptake regulator family protein  28.77 
 
 
168 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1792  ferric uptake regulator, Fur family  31.11 
 
 
150 aa  63.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000306351  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0768  iron ABC transporter  27.4 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000612083  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  26.21 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1966  ferric uptake regulator family protein  28.12 
 
 
149 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00359557  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2524  ferric uptake regulator, Fur family  32.56 
 
 
138 aa  62.4  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.568134  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>