More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0294 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0294  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 
170 aa  341  4e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.774382  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2124  ferric uptake regulator, Fur family  60.13 
 
 
157 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.506102  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4192  ferric uptake regulator, Fur family  65.12 
 
 
141 aa  176  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0145  fur family transcriptional regulator  62.88 
 
 
140 aa  175  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2159  ferric uptake regulator family protein  61.48 
 
 
146 aa  174  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00488582 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11938  ferric uptake regulation protein furA (fur)  61.76 
 
 
150 aa  174  6e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1102  ferric uptake regulator, Fur family  59.23 
 
 
140 aa  173  8e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.387055  normal  0.912899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2053  ferric-uptake regulator  60.28 
 
 
201 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1623  ferric uptake regulator, Fur family  65.65 
 
 
137 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2705  ferric uptake regulator, Fur family  59.56 
 
 
139 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3313  ferric uptake regulator, Fur family  62.12 
 
 
146 aa  170  6.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.977689  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36340  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  61.64 
 
 
151 aa  170  6.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  58.78 
 
 
139 aa  169  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3965  ferric uptake regulator, Fur family  60.61 
 
 
138 aa  168  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0468  ferric-uptake regulator  59.42 
 
 
173 aa  167  9e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0684  ferric uptake regulator family protein  62.22 
 
 
142 aa  166  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564127  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3452  ferric uptake regulator family protein  57.97 
 
 
145 aa  166  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604214  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0874  ferric-uptake regulator  63.57 
 
 
146 aa  166  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.250116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4454  ferric uptake regulator, Fur family  61.83 
 
 
147 aa  165  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4803  ferric uptake regulator, Fur family  61.54 
 
 
154 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2681  ferric uptake regulator family protein  60.61 
 
 
195 aa  164  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.445944  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2983  ferric uptake regulator family protein  57.86 
 
 
149 aa  164  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.319363  normal  0.752016 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0738  ferric uptake regulator family protein  60.74 
 
 
142 aa  164  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376687  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2712  ferric uptake regulator family protein  60.61 
 
 
157 aa  164  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2726  ferric uptake regulator family protein  60.61 
 
 
157 aa  164  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20346 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3814  ferric uptake regulator, Fur family  58.91 
 
 
146 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000136698  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0839  ferric-uptake regulator  59.85 
 
 
143 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22450  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  59.23 
 
 
159 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2714  ferric-uptake regulator  60.47 
 
 
147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352648  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2725  ferric uptake regulator, Fur family  55.4 
 
 
152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2095  ferric uptake regulator family protein  60 
 
 
166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.509153  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3209  ferric uptake regulator family protein  61.42 
 
 
147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.829925  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0237  Fur family ferric uptake regulator  59.7 
 
 
161 aa  162  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0518  ferric ion uptake regulator  58.46 
 
 
139 aa  161  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1532  ferric uptake regulator family protein  60.16 
 
 
174 aa  160  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0229059 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01070  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  59.38 
 
 
142 aa  158  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20420  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  58.91 
 
 
140 aa  157  8e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.375668  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1937  ferric uptake regulator, Fur family  58.46 
 
 
137 aa  153  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0166827  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  56.59 
 
 
139 aa  152  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0866  ferric uptake regulator, Fur family  54.79 
 
 
154 aa  152  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0758878  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3239  ferric uptake regulator, Fur family  55.81 
 
 
173 aa  147  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24980  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  56.3 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5253  ferric uptake regulator family protein  59.46 
 
 
158 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2781  ferric uptake regulator, Fur family  48.15 
 
 
164 aa  128  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.028886 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3077  ferric uptake regulator family protein  48.89 
 
 
155 aa  127  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4279  ferric uptake regulator, Fur family  48.51 
 
 
183 aa  126  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000762776  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4885  ferric uptake regulator family protein  61.86 
 
 
108 aa  121  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0503467  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4974  ferric uptake regulator family protein  61.86 
 
 
108 aa  121  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2141  ferric uptake regulator family protein  43.2 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  34.11 
 
 
166 aa  79  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1966  ferric uptake regulator family protein  34.53 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00359557  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1143  ferric uptake regulator, Fur family  32.85 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000124537  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  35.43 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  38.46 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.499744 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  30.28 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  27.14 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  24.11 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  31.16 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0438  ferric uptake regulation protein  32.84 
 
 
136 aa  72  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0414  ferric uptake regulation protein  32.84 
 
 
136 aa  72  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3278  ferric uptake regulator, Fur family  33.09 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.351465 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0347  ferric uptake regulator, Fur family  33.1 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  27.66 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  27.94 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  28.36 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  28.79 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  28.79 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  28.79 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
144 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  28.79 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  28.79 
 
 
144 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  28.79 
 
 
144 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  31.39 
 
 
152 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
144 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  28.79 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0149  ferric uptake regulator, Fur family  28.8 
 
 
139 aa  70.5  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000946287  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  29.1 
 
 
146 aa  70.5  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0967  ferric uptake regulator, Fur family  32.62 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.924679  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  29.29 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  27.61 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  28.89 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0105  ferric uptake regulator family protein  30.99 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.013681  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  28.89 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  29.79 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  31.5 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  29.79 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0734  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000194517  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0767  ferric uptake regulator family protein  38 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.531572  normal  0.0222977 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  31.69 
 
 
146 aa  67.4  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0726  ferric uptake regulator, Fur family  33.06 
 
 
130 aa  67  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.787789  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0987  ferric uptake regulator family protein  29.32 
 
 
147 aa  67  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00388915 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  32.8 
 
 
146 aa  67  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4185  ferric uptake regulator, Fur family  28.03 
 
 
139 aa  67  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421488  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0263  FUR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
138 aa  67.4  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0768  iron ABC transporter  30.83 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000612083  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  31.62 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  28.76 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0406  ferric uptake regulator, Fur family  28.24 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>