More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2714 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2714  ferric-uptake regulator  100 
 
 
147 aa  296  7e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352648  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11938  ferric uptake regulation protein furA (fur)  73.57 
 
 
150 aa  219  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2681  ferric uptake regulator family protein  70.39 
 
 
195 aa  211  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.445944  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2712  ferric uptake regulator family protein  69.48 
 
 
157 aa  210  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2726  ferric uptake regulator family protein  69.48 
 
 
157 aa  210  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20346 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3452  ferric uptake regulator family protein  67.38 
 
 
145 aa  205  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604214  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4192  ferric uptake regulator, Fur family  72.46 
 
 
141 aa  201  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0874  ferric-uptake regulator  74.24 
 
 
146 aa  199  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.250116  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2983  ferric uptake regulator family protein  68.53 
 
 
149 aa  197  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.319363  normal  0.752016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1532  ferric uptake regulator family protein  68.38 
 
 
174 aa  193  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0229059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2053  ferric-uptake regulator  68.61 
 
 
201 aa  189  8e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3209  ferric uptake regulator family protein  68.7 
 
 
147 aa  189  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.829925  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2705  ferric uptake regulator, Fur family  66.17 
 
 
139 aa  186  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2159  ferric uptake regulator family protein  69.29 
 
 
146 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00488582 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3313  ferric uptake regulator, Fur family  61.11 
 
 
146 aa  178  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.977689  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3814  ferric uptake regulator, Fur family  62.6 
 
 
146 aa  172  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000136698  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2124  ferric uptake regulator, Fur family  61.48 
 
 
157 aa  170  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.506102  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22450  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  60.58 
 
 
159 aa  168  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  58.59 
 
 
139 aa  167  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0839  ferric-uptake regulator  63.85 
 
 
143 aa  167  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4454  ferric uptake regulator, Fur family  59.72 
 
 
147 aa  166  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36340  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  61.65 
 
 
151 aa  165  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0738  ferric uptake regulator family protein  61.54 
 
 
142 aa  165  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376687  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0684  ferric uptake regulator family protein  62.02 
 
 
142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564127  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4803  ferric uptake regulator, Fur family  59.12 
 
 
154 aa  164  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0294  ferric uptake regulator, Fur family  60.47 
 
 
170 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.774382  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1102  ferric uptake regulator, Fur family  54.96 
 
 
140 aa  160  5.0000000000000005e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.387055  normal  0.912899 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20420  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  57.66 
 
 
140 aa  160  8.000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.375668  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01070  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  61.72 
 
 
142 aa  159  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0518  ferric ion uptake regulator  55.64 
 
 
139 aa  158  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2725  ferric uptake regulator, Fur family  56.12 
 
 
152 aa  158  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1623  ferric uptake regulator, Fur family  58.91 
 
 
137 aa  157  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0145  fur family transcriptional regulator  56.49 
 
 
140 aa  157  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0237  Fur family ferric uptake regulator  57.48 
 
 
161 aa  153  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  55.22 
 
 
139 aa  153  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2095  ferric uptake regulator family protein  56.12 
 
 
166 aa  153  8e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.509153  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3965  ferric uptake regulator, Fur family  54.26 
 
 
138 aa  148  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0468  ferric-uptake regulator  50.75 
 
 
173 aa  147  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0866  ferric uptake regulator, Fur family  57.14 
 
 
154 aa  147  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0758878  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3239  ferric uptake regulator, Fur family  53.62 
 
 
173 aa  146  9e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1937  ferric uptake regulator, Fur family  53.44 
 
 
137 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0166827  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24980  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  51.02 
 
 
153 aa  139  9e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2781  ferric uptake regulator, Fur family  46.58 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.028886 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3077  ferric uptake regulator family protein  48.91 
 
 
155 aa  131  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4885  ferric uptake regulator family protein  61 
 
 
108 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0503467  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4974  ferric uptake regulator family protein  61 
 
 
108 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5253  ferric uptake regulator family protein  57.28 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4279  ferric uptake regulator, Fur family  44.37 
 
 
183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000762776  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2141  ferric uptake regulator family protein  37.98 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  31.85 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 
138 aa  77  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0105  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.013681  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  30.34 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0726  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 
130 aa  73.6  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.787789  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  28.15 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2513  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275348  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1230  FUR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0757057  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  36.84 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.499744 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1143  ferric uptake regulator, Fur family  29.23 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000124537  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  29.41 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1420  FUR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0522352  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1388  ferric uptake regulator, Fur family  34.65 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00327608  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  29.71 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  29.71 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  29.71 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  27.61 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  29.71 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  22.22 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  29.71 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  29.71 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  29.71 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  27.94 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2524  ferric uptake regulator, Fur family  29.69 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.568134  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  27.61 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1966  ferric uptake regulator family protein  27.14 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00359557  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3674  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2366  ferric uptake regulator, Fur family  30.47 
 
 
131 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.437919 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1792  ferric uptake regulator, Fur family  32.81 
 
 
150 aa  67  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000306351  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  28.57 
 
 
142 aa  67  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0263  FUR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
138 aa  67  0.00000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  26.32 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  29.01 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0352  ferric uptake regulator, Fur family  32.79 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  29.01 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0347  ferric uptake regulator, Fur family  30.83 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0284  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0246387 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0375  ferric uptake regulator family protein  31.91 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  21.53 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1211  ferric uptake regulation protein  23.97 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0179394  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5708  ferric uptake regulator, Fur family  29.71 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  29.01 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0247  ferric uptake transcriptional (FUR)-like transcription regulator protein  29.33 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0122  ferric uptake regulation protein  28.68 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00816522  normal  0.910281 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  21.58 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1354  ferric uptake regulator, Fur family  31.11 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000236384  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3278  ferric uptake regulator, Fur family  29.23 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.351465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>