More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0468 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0468  ferric-uptake regulator  100 
 
 
173 aa  354  3.9999999999999996e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3965  ferric uptake regulator, Fur family  66.67 
 
 
138 aa  195  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36340  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  66.92 
 
 
151 aa  182  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0145  fur family transcriptional regulator  62.79 
 
 
140 aa  169  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0294  ferric uptake regulator, Fur family  59.42 
 
 
170 aa  167  9e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.774382  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  63.28 
 
 
139 aa  164  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2705  ferric uptake regulator, Fur family  55.07 
 
 
139 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20420  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  58.52 
 
 
140 aa  164  8e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.375668  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22450  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  55.88 
 
 
159 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1102  ferric uptake regulator, Fur family  56.25 
 
 
140 aa  162  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.387055  normal  0.912899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4803  ferric uptake regulator, Fur family  58.21 
 
 
154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3814  ferric uptake regulator, Fur family  56.06 
 
 
146 aa  160  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000136698  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1532  ferric uptake regulator family protein  49.69 
 
 
174 aa  159  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0229059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2053  ferric-uptake regulator  52.26 
 
 
201 aa  159  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4192  ferric uptake regulator, Fur family  54.74 
 
 
141 aa  159  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0839  ferric-uptake regulator  58.59 
 
 
143 aa  159  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3452  ferric uptake regulator family protein  50.7 
 
 
145 aa  156  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604214  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2725  ferric uptake regulator, Fur family  54.89 
 
 
152 aa  154  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3209  ferric uptake regulator family protein  52.17 
 
 
147 aa  154  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.829925  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0518  ferric ion uptake regulator  55.64 
 
 
139 aa  154  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0237  Fur family ferric uptake regulator  55.38 
 
 
161 aa  154  9e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2159  ferric uptake regulator family protein  53.19 
 
 
146 aa  153  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00488582 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4454  ferric uptake regulator, Fur family  56.72 
 
 
147 aa  153  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0874  ferric-uptake regulator  52.99 
 
 
146 aa  153  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.250116  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1623  ferric uptake regulator, Fur family  58.59 
 
 
137 aa  152  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3313  ferric uptake regulator, Fur family  50 
 
 
146 aa  152  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.977689  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0738  ferric uptake regulator family protein  57.81 
 
 
142 aa  152  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376687  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01070  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  56.59 
 
 
142 aa  152  2.9999999999999998e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11938  ferric uptake regulation protein furA (fur)  54.26 
 
 
150 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2681  ferric uptake regulator family protein  50.67 
 
 
195 aa  150  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.445944  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2712  ferric uptake regulator family protein  50.67 
 
 
157 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2726  ferric uptake regulator family protein  50.67 
 
 
157 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20346 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0684  ferric uptake regulator family protein  56.25 
 
 
142 aa  147  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564127  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2714  ferric-uptake regulator  50.75 
 
 
147 aa  147  7e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352648  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3239  ferric uptake regulator, Fur family  53.62 
 
 
173 aa  146  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2983  ferric uptake regulator family protein  54.96 
 
 
149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.319363  normal  0.752016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5253  ferric uptake regulator family protein  65.38 
 
 
158 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2124  ferric uptake regulator, Fur family  51.16 
 
 
157 aa  145  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.506102  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24980  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  51.52 
 
 
153 aa  144  6e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2095  ferric uptake regulator family protein  53.85 
 
 
166 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.509153  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  50.74 
 
 
139 aa  143  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1937  ferric uptake regulator, Fur family  49.24 
 
 
137 aa  140  9e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0166827  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0866  ferric uptake regulator, Fur family  52.21 
 
 
154 aa  137  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0758878  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4279  ferric uptake regulator, Fur family  43.1 
 
 
183 aa  135  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000762776  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4885  ferric uptake regulator family protein  62.89 
 
 
108 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0503467  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4974  ferric uptake regulator family protein  62.89 
 
 
108 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2781  ferric uptake regulator, Fur family  46.21 
 
 
164 aa  120  9e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.028886 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3077  ferric uptake regulator family protein  45.11 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  31.75 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4251  FUR family nickel uptake regulator  33.33 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0966436  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  28.95 
 
 
166 aa  77  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  31.91 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  32.64 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3278  ferric uptake regulator, Fur family  35.66 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.351465 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 
146 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0122  ferric uptake regulation protein  35.94 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00816522  normal  0.910281 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  36.43 
 
 
149 aa  72  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.499744 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0375  ferric uptake regulator family protein  33.58 
 
 
143 aa  72  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  30 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1966  ferric uptake regulator family protein  32.58 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2141  ferric uptake regulator family protein  37.6 
 
 
137 aa  70.5  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  29.46 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  31.06 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  29.46 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0918  ferric uptake regulator  32.82 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1143  ferric uptake regulator, Fur family  31.58 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000124537  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0473  Fur family ferric uptake regulator  29.1 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  30.3 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0312  ferric uptake regulator family protein  33.86 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0247  ferric uptake transcriptional (FUR)-like transcription regulator protein  34.27 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0105  ferric uptake regulator family protein  30.15 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.013681  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0873  ferric uptake regulator, Fur family protein  28.91 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  31.65 
 
 
144 aa  67  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  32.06 
 
 
146 aa  67  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0543  ferric uptake regulator, Fur family  32.31 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.70942 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  27.14 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1230  FUR family transcriptional regulator  28.03 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0757057  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  30.43 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0438  ferric uptake regulation protein  34.07 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0414  ferric uptake regulation protein  34.07 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0058  ferric uptake regulator family protein  31.34 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0235193  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2727  ferric uptake regulator family protein  33.09 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284846  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5708  ferric uptake regulator, Fur family  32.37 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_19  transcriptional regulator, Fur family  26.81 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.677591  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0020  FUR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147149  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1188  ferric uptake regulator, Fur family  30.99 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  37.04 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1420  FUR family transcriptional regulator  28.03 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0522352  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  37.04 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0263  FUR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1792  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000306351  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  28.99 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  28.99 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  28.99 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01084  ferric uptake regulator  28.68 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00618384  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  28.99 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  29.41 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0101  ferric uptake regulator, Fur family  31.47 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>