More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0738 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0738  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 
142 aa  283  4e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376687  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0684  ferric uptake regulator family protein  95.77 
 
 
142 aa  273  8e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564127  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0145  fur family transcriptional regulator  66.92 
 
 
140 aa  189  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  67.42 
 
 
139 aa  184  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1623  ferric uptake regulator, Fur family  66.17 
 
 
137 aa  180  5.0000000000000004e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4803  ferric uptake regulator, Fur family  63.28 
 
 
154 aa  177  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1102  ferric uptake regulator, Fur family  58.82 
 
 
140 aa  177  4.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.387055  normal  0.912899 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2705  ferric uptake regulator, Fur family  61.48 
 
 
139 aa  175  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22450  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  64.39 
 
 
159 aa  173  5e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2095  ferric uptake regulator family protein  64.75 
 
 
166 aa  174  5e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.509153  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0518  ferric ion uptake regulator  62.88 
 
 
139 aa  172  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0237  Fur family ferric uptake regulator  63.08 
 
 
161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0874  ferric-uptake regulator  64.66 
 
 
146 aa  170  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.250116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4454  ferric uptake regulator, Fur family  62.88 
 
 
147 aa  169  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36340  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  63.08 
 
 
151 aa  168  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  61.72 
 
 
139 aa  167  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2124  ferric uptake regulator, Fur family  59.29 
 
 
157 aa  167  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.506102  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0866  ferric uptake regulator, Fur family  63.43 
 
 
154 aa  167  6e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0758878  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4192  ferric uptake regulator, Fur family  63.43 
 
 
141 aa  167  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3452  ferric uptake regulator family protein  60.77 
 
 
145 aa  166  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604214  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2714  ferric-uptake regulator  61.54 
 
 
147 aa  165  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352648  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0294  ferric uptake regulator, Fur family  60.74 
 
 
170 aa  164  4e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.774382  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2983  ferric uptake regulator family protein  62.96 
 
 
149 aa  164  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.319363  normal  0.752016 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0839  ferric-uptake regulator  59.56 
 
 
143 aa  163  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11938  ferric uptake regulation protein furA (fur)  61.54 
 
 
150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20420  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  58.65 
 
 
140 aa  161  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.375668  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2053  ferric-uptake regulator  61.83 
 
 
201 aa  160  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3209  ferric uptake regulator family protein  61.24 
 
 
147 aa  160  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.829925  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2159  ferric uptake regulator family protein  58.7 
 
 
146 aa  160  6e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00488582 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1532  ferric uptake regulator family protein  62.02 
 
 
174 aa  159  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0229059 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2725  ferric uptake regulator, Fur family  56.15 
 
 
152 aa  158  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3965  ferric uptake regulator, Fur family  59.4 
 
 
138 aa  159  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2712  ferric uptake regulator family protein  58.7 
 
 
157 aa  156  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2681  ferric uptake regulator family protein  58.7 
 
 
195 aa  156  8e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.445944  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2726  ferric uptake regulator family protein  58.7 
 
 
157 aa  156  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20346 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3313  ferric uptake regulator, Fur family  58.59 
 
 
146 aa  154  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.977689  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01070  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  59.69 
 
 
142 aa  153  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0468  ferric-uptake regulator  57.81 
 
 
173 aa  152  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3814  ferric uptake regulator, Fur family  56.15 
 
 
146 aa  149  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000136698  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3239  ferric uptake regulator, Fur family  55.38 
 
 
173 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24980  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  55.8 
 
 
153 aa  141  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1937  ferric uptake regulator, Fur family  54.14 
 
 
137 aa  140  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0166827  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5253  ferric uptake regulator family protein  63.3 
 
 
158 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4279  ferric uptake regulator, Fur family  50 
 
 
183 aa  130  9e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000762776  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4885  ferric uptake regulator family protein  67.01 
 
 
108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0503467  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4974  ferric uptake regulator family protein  67.01 
 
 
108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3077  ferric uptake regulator family protein  45.93 
 
 
155 aa  120  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2781  ferric uptake regulator, Fur family  44.44 
 
 
164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.028886 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2141  ferric uptake regulator family protein  44.96 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  32.35 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  35.07 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  29.37 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  34.85 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  31.94 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1966  ferric uptake regulator family protein  31.06 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00359557  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  31.11 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  32.81 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0767  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 
134 aa  73.9  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.531572  normal  0.0222977 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2513  ferric uptake regulator, Fur family  35 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275348  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  30 
 
 
134 aa  73.9  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  32.54 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  28.24 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1279  transcriptional regulator, Fur family  33.87 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000471651  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  28.91 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1295  ferric uptake regulator family protein  33.87 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000494544  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0058  ferric uptake regulator family protein  29.55 
 
 
134 aa  72  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0235193  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  31.16 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  29.63 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0375  ferric uptake regulator family protein  34.59 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0312  ferric uptake regulator family protein  36.57 
 
 
174 aa  72  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1505  FUR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000456774  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2798  Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins  36.62 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.1309500000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0473  Fur family ferric uptake regulator  33.33 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  28.36 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1143  ferric uptake regulator, Fur family  33.08 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000124537  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  29.55 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  28.57 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1905  ferric uptake regulator family protein  27.07 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2620  ferric uptake regulator, Fur family  31.3 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  29.6 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3653  ferric uptake regulator family protein  32.58 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188238  normal  0.295199 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2727  ferric uptake regulator family protein  32.31 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284846  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  24.43 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1451  ferric uptake regulation protein  30.08 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000060196  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1474  ferric uptake regulator family protein  31.69 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1389  ferric uptake regulation protein  30.08 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000498211  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0529  ferric uptake regulator, Fur family  28.89 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000605392  normal  0.102669 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4234  ferric uptake regulator family protein  32.33 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0343972  normal  0.519768 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0247  ferric uptake transcriptional (FUR)-like transcription regulator protein  30.6 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  32.33 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1388  ferric uptake regulator, Fur family  36.15 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00327608  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0199  ferric uptake regulator, Fur family  33.87 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.18921  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0726  ferric uptake regulator, Fur family  34.4 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.787789  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0347  ferric uptake regulator, Fur family  31.06 
 
 
149 aa  67  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  28.57 
 
 
142 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  28.57 
 
 
142 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>