More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0199 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0199  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 150 aa  298  2e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.18921  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0061  FUR family nickel uptake regulator  41.09 
 
 		 150 aa  104  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2661  ferric uptake regulator family protein  40.91 
 
 		 173 aa  103  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.946961  normal  0.0414019 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21260  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  39.13 
 
 		 157 aa  97.8  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.570442  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5708  ferric uptake regulator, Fur family  38.85 
 
 		 143 aa  95.9  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0473  Fur family ferric uptake regulator  35.38 
 
 		 136 aa  95.5  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6836  ferric uptake regulator, Fur family  35.43 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0375  ferric uptake regulator family protein  38.28 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1315  transcriptional regulator, TrmB  33.1 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0312  ferric uptake regulator family protein  34.97 
 
 		 174 aa  91.3  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0918  ferric uptake regulator  35.38 
 
 		 137 aa  90.9  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4251  FUR family nickel uptake regulator  35.07 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0966436  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  32.37 
 
 		 150 aa  87.8  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2058  ferric uptake regulator, Fur family  33.58 
 
 		 145 aa  86.7  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3806  ferric uptake regulator family protein  37.33 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3863  ferric uptake regulator, Fur family  37.41 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199126  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  31.62 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0980  ferric uptake regulator family protein  31.3 
 
 		 135 aa  84.7  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.875301  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  31.06 
 
 		 143 aa  84  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0654  ferric uptake regulator, Fur family  36.57 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6149  ferric uptake regulator family protein  36.03 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3949  ferric uptake regulator, Fur family  36.73 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.234293  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1224  ferric uptake regulator family protein  31.54 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.293203  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  30 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  30 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  30 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1982  ferric uptake regulator family protein  36.43 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  30 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  30.3 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  30.3 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  30.3 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  30.3 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  30.3 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1279  transcriptional regulator, Fur family  32.03 
 
 		 141 aa  80.1  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000471651  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1147  FUR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  33.08 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8242  ferric uptake regulator, Fur family  34.59 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1138  ferric uptake regulator, Fur family  32.54 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716078  normal  0.825565 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3924  ferric uptake regulator family protein  35.92 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.567476 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  27.82 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1295  ferric uptake regulator family protein  31.25 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000494544  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2620  ferric uptake regulator, Fur family  25.5 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  27.86 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0768  iron ABC transporter  29.2 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000612083  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  28.26 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1505  FUR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000456774  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0684  ferric uptake regulator family protein  35.11 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564127  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0396  ferric uptake regulator, Fur family  34.33 
 
 		 175 aa  75.1  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1140  ferric uptake regulator family protein  37.96 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3922  ferric uptake regulator family protein  26.71 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000572819  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0020  FUR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147149  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0738  ferric uptake regulator family protein  35.11 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376687  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  30.56 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  32.12 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  26.71 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4292  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  37.76 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1474  ferric uptake regulator family protein  31.75 
 
 		 168 aa  73.9  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1036  transcriptional regulator, Fur family  26.71 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0163253  normal  0.210334 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4201  transcriptional regulator, Fur family  26.71 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0217905  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4160  FUR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4001  FUR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000832394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3832  FUR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3848  FUR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000844204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4313  FUR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4224  transcriptional regulator, Fur family  26.71 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00546613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4115  transcriptional regulator, Fur family  26.71 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5116299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0145  fur family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  27.46 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0418  ferric-uptake regulator  31.25 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00383086  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  32.09 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  29.29 
 
 		 148 aa  72  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_19  transcriptional regulator, Fur family  31.01 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.677591  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  28.68 
 
 		 149 aa  72  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  28.68 
 
 		 149 aa  72  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  29.29 
 
 		 148 aa  72  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0314  ferric uptake regulator family protein  28.12 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0295931  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  25.71 
 
 		 147 aa  72  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0883  ferric uptake regulator, Fur family  33.85 
 
 		 140 aa  72  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.061821  hitchhiker  0.00451054 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  32.56 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  33.08 
 
 		 138 aa  70.1  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1680  ferric uptake regulator, Fur family  28.57 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  29.41 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3769  ferric uptake regulator, Fur family  31.82 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1573  ferric uptake regulator, Fur family  27.34 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719756 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  31.06 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3662  ferric uptake regulator, Fur family  31.06 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  25.17 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0896  ferric uptake regulator, Fur family  29.2 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2259  ferric uptake regulator, Fur family  28.28 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2029  FUR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0529  ferric uptake regulator, Fur family  30.23 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000605392  normal  0.102669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0518  ferric ion uptake regulator  34.81 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0229  ferric uptake regulator family protein  30.41 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1746  FUR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1084  ferric uptake regulator, Fur family  29.75 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.784641  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4626  ferric uptake regulator, Fur family  33.82 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795409  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1892  Fur family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>