More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0312 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0312  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 174 aa  348  2e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0375  ferric uptake regulator family protein  95.77 
 
 		 143 aa  273  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5708  ferric uptake regulator, Fur family  63.5 
 
 		 143 aa  173  9e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0918  ferric uptake regulator  55.88 
 
 		 137 aa  161  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0473  Fur family ferric uptake regulator  57.36 
 
 		 136 aa  157  9e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0061  FUR family nickel uptake regulator  55.12 
 
 		 150 aa  150  8.999999999999999e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4251  FUR family nickel uptake regulator  53.44 
 
 		 139 aa  147  9e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0966436  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6149  ferric uptake regulator family protein  61.42 
 
 		 144 aa  142  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6836  ferric uptake regulator, Fur family  53.24 
 
 		 144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0654  ferric uptake regulator, Fur family  54.14 
 
 		 136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8242  ferric uptake regulator, Fur family  52.48 
 
 		 144 aa  130  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4626  ferric uptake regulator, Fur family  56.52 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795409  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0883  ferric uptake regulator, Fur family  45.11 
 
 		 140 aa  107  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.061821  hitchhiker  0.00451054 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_19  transcriptional regulator, Fur family  35.97 
 
 		 142 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.677591  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  35.29 
 
 		 142 aa  99  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0020  FUR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 142 aa  97.8  7e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147149  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1315  transcriptional regulator, TrmB  33.8 
 
 		 151 aa  92.8  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2058  ferric uptake regulator, Fur family  32.85 
 
 		 145 aa  89.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  32.82 
 
 		 146 aa  88.6  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  31.16 
 
 		 155 aa  88.2  5e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  32.37 
 
 		 147 aa  88.2  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21260  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  38.69 
 
 		 157 aa  87.8  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.570442  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  35.42 
 
 		 167 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  35.56 
 
 		 167 aa  85.5  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  31.34 
 
 		 155 aa  85.5  4e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  35.56 
 
 		 167 aa  85.5  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  29.93 
 
 		 146 aa  85.5  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  32.33 
 
 		 138 aa  84.7  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0199  ferric uptake regulator, Fur family  34.92 
 
 		 150 aa  84  9e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.18921  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2661  ferric uptake regulator family protein  38.93 
 
 		 173 aa  84  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.946961  normal  0.0414019 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2725  ferric uptake regulator, Fur family  37.69 
 
 		 152 aa  83.6  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  29.63 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  34.31 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  31.62 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  35.29 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  29.17 
 
 		 155 aa  80.5  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  28.77 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  31.58 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  28.77 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  28.77 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  30.83 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0894  ferric uptake regulator family protein  31.03 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572753 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  29.45 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0058  ferric uptake regulator family protein  35.38 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0235193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1102  ferric uptake regulator, Fur family  35.07 
 
 		 140 aa  77.4  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.387055  normal  0.912899 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4099  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4185  ferric uptake regulator, Fur family  32.61 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3313  ferric uptake regulator, Fur family  32.86 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.977689  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  29.93 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  29.45 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  33.08 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  29.1 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  31.88 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  23.57 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0940  ferric uptake regulator, Fur family  25.52 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4803  ferric uptake regulator, Fur family  33.85 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0529  ferric uptake regulator, Fur family  26.87 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000605392  normal  0.102669 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  31.75 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  27.27 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1138  ferric uptake regulator, Fur family  27.34 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716078  normal  0.825565 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  28.68 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0738  ferric uptake regulator family protein  36.57 
 
 		 142 aa  72  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376687  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  31.06 
 
 		 149 aa  72  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  26.92 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  31.06 
 
 		 149 aa  72  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  28.78 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0874  ferric-uptake regulator  35.34 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.250116  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  29.41 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0684  ferric uptake regulator family protein  33.83 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564127  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2620  ferric uptake regulator, Fur family  25.52 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0518  ferric ion uptake regulator  32.28 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36340  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  35.56 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  26.15 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  26.15 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1474  ferric uptake regulator family protein  29.85 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  26.15 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2543  ferric-uptake regulator  36.72 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37741  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3922  ferric uptake regulator family protein  29.41 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000572819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  26.15 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1147  FUR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  29.71 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  29.55 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  26.15 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  26.15 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1623  ferric uptake regulator, Fur family  32.56 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1241  ferric uptake regulator, Fur family  32.84 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00903138 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  31.5 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  30.53 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1746  FUR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2095  ferric uptake regulator family protein  33.58 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.509153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0314  ferric uptake regulator family protein  26.21 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0295931  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  28.89 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  26.15 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  33.06 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>