More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_22450 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_22450  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  100 
 
 		 159 aa  319  9.000000000000001e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1102  ferric uptake regulator, Fur family  62.96 
 
 		 140 aa  189  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.387055  normal  0.912899 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2705  ferric uptake regulator, Fur family  64.12 
 
 		 139 aa  176  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0738  ferric uptake regulator family protein  64.39 
 
 		 142 aa  173  7e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376687  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4192  ferric uptake regulator, Fur family  66.15 
 
 		 141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3965  ferric uptake regulator, Fur family  60.87 
 
 		 138 aa  171  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0145  fur family transcriptional regulator  61.03 
 
 		 140 aa  169  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1623  ferric uptake regulator, Fur family  62.88 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0684  ferric uptake regulator family protein  62.88 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564127  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2714  ferric-uptake regulator  60.58 
 
 		 147 aa  168  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352648  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2159  ferric uptake regulator family protein  66.14 
 
 		 146 aa  167  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00488582 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1532  ferric uptake regulator family protein  60.56 
 
 		 174 aa  167  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0229059 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36340  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  56.67 
 
 		 151 aa  166  8e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2053  ferric-uptake regulator  64.06 
 
 		 201 aa  166  9e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4454  ferric uptake regulator, Fur family  58.5 
 
 		 147 aa  166  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4803  ferric uptake regulator, Fur family  56.83 
 
 		 154 aa  166  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2681  ferric uptake regulator family protein  61.48 
 
 		 195 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.445944  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2712  ferric uptake regulator family protein  61.48 
 
 		 157 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2725  ferric uptake regulator, Fur family  55 
 
 		 152 aa  164  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2726  ferric uptake regulator family protein  61.48 
 
 		 157 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.20346 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  60.94 
 
 		 139 aa  163  9e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0294  ferric uptake regulator, Fur family  59.23 
 
 		 170 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.774382  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0468  ferric-uptake regulator  55.88 
 
 		 173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  58.33 
 
 		 139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2983  ferric uptake regulator family protein  61.48 
 
 		 149 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.319363  normal  0.752016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0518  ferric ion uptake regulator  55.97 
 
 		 139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0874  ferric-uptake regulator  60.43 
 
 		 146 aa  161  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.250116  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20420  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  60.45 
 
 		 140 aa  160  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.375668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11938  ferric uptake regulation protein furA (fur)  57.46 
 
 		 150 aa  160  9e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2124  ferric uptake regulator, Fur family  59.7 
 
 		 157 aa  159  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.506102  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3452  ferric uptake regulator family protein  55.4 
 
 		 145 aa  156  9e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604214  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0237  Fur family ferric uptake regulator  54.48 
 
 		 161 aa  154  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0839  ferric-uptake regulator  56.62 
 
 		 143 aa  155  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3209  ferric uptake regulator family protein  55.47 
 
 		 147 aa  152  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.829925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3313  ferric uptake regulator, Fur family  60.94 
 
 		 146 aa  150  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.977689  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3814  ferric uptake regulator, Fur family  56.92 
 
 		 146 aa  150  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000136698  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2095  ferric uptake regulator family protein  56.25 
 
 		 166 aa  150  7e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.509153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01070  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  56.12 
 
 		 142 aa  149  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0866  ferric uptake regulator, Fur family  55.71 
 
 		 154 aa  149  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0758878  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3239  ferric uptake regulator, Fur family  54.62 
 
 		 173 aa  141  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24980  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  54.2 
 
 		 153 aa  141  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3077  ferric uptake regulator family protein  53.28 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2781  ferric uptake regulator, Fur family  54.96 
 
 		 164 aa  136  8.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.028886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5253  ferric uptake regulator family protein  58.26 
 
 		 158 aa  133  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1937  ferric uptake regulator, Fur family  51.18 
 
 		 137 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0166827  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4885  ferric uptake regulator family protein  66.33 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0503467  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4974  ferric uptake regulator family protein  66.33 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4279  ferric uptake regulator, Fur family  41.78 
 
 		 183 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000762776  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4251  FUR family nickel uptake regulator  33.59 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0966436  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  35.29 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.499744 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1143  ferric uptake regulator, Fur family  30.77 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000124537  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  32.31 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2141  ferric uptake regulator family protein  34.85 
 
 		 137 aa  67  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3240  ferric uptake regulator family protein  33.85 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000230922  hitchhiker  0.00191408 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3278  ferric uptake regulator, Fur family  31.88 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.351465 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  27.92 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  28.03 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3863  ferric uptake regulator, Fur family  32.14 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199126  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0061  FUR family nickel uptake regulator  29.53 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  27.41 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5708  ferric uptake regulator, Fur family  30 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1966  ferric uptake regulator family protein  29.2 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00359557  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4742  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3949  ferric uptake regulator, Fur family  31.34 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.234293  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  26.15 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  21.21 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3806  ferric uptake regulator family protein  31.34 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0105  ferric uptake regulator family protein  27.91 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.013681  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0767  ferric uptake regulator family protein  33 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.531572  normal  0.0222977 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  23.88 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0347  ferric uptake regulator, Fur family  30.6 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0654  ferric uptake regulator, Fur family  31.25 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3389  ferric uptake regulator family protein  35.79 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.261962  normal  0.0261677 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4099  ferric uptake regulator family protein  30.53 
 
 		 143 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3496  ferric uptake regulator, Fur family  35.92 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6836  ferric uptake regulator, Fur family  32.06 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0473  Fur family ferric uptake regulator  34.07 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0418  ferric-uptake regulator  27.91 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00383086  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2620  ferric uptake regulator, Fur family  27.4 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  29.01 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  25.56 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0375  ferric uptake regulator family protein  28.68 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2524  ferric uptake regulator, Fur family  34.68 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.568134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1597  ferric uptake regulator, Fur family  29.55 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  29.01 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0726  ferric uptake regulator, Fur family  33.07 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.787789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0842  ferric uptake regulator, Fur family  24.5 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1296  FUR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2050  ferric uptake regulator, Fur family  28.12 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1792  ferric uptake regulator, Fur family  31.78 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000306351  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1295  ferric uptake regulator family protein  28.23 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000494544  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2809  FUR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.110848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0406  ferric uptake regulator, Fur family  29.32 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  25.38 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  27.27 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3924  ferric uptake regulator family protein  29.33 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1140  ferric uptake regulator family protein  31.01 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3653  ferric uptake regulator family protein  29.17 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188238  normal  0.295199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>