More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3496 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3496  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 
152 aa  300  6.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0164  putative transcription regulator protein  45.58 
 
 
172 aa  128  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1183  ferric uptake regulator, Fur family  47.59 
 
 
158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.837957 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1467  transcriptional regulator, Fur family  47.59 
 
 
158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0128  ferric uptake regulator family protein  43.94 
 
 
169 aa  111  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.1335 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1233  ferric uptake regulator family protein  42.03 
 
 
147 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0048  putative transcription regulator protein  45.75 
 
 
172 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3379  ferric uptake regulator, Fur family  47.18 
 
 
175 aa  107  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3702  ferric uptake regulator, Fur family  47.18 
 
 
175 aa  107  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2512  ferric uptake regulator family protein  38.06 
 
 
201 aa  97.1  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.450617  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3018  ferric uptake regulator, Fur family  39.13 
 
 
145 aa  82  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0481144  normal  0.294593 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0931  ferric uptake regulator family protein  30.83 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5541  ferric uptake regulator, Fur family  32.61 
 
 
138 aa  77.8  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.713771 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1930  ferric uptake regulator, Fur family  28.91 
 
 
144 aa  77  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0025  ferric uptake regulator family protein  33.08 
 
 
149 aa  77  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344249  normal  0.157034 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1469  ferric uptake regulator, Fur family  40.62 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0185274  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4566  Fur family transcriptional regulator protein  31.65 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3640  hypothetical protein  32.93 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1604  putative transcription regulator protein  34.53 
 
 
144 aa  72  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000436344  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1728  ferric uptake regulator family protein  36.3 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.597021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2685  ferric uptake regulator family protein  28.99 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0992523 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0621  putative ferric uptake regulator, Fur family  31.58 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.776664  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0747  ferric-uptake regulator  29.45 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0533  ferric uptake regulator, Fur family  29.93 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4742  ferric uptake regulator, Fur family  35.62 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  32.37 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0132  ferric-uptake regulator  26.45 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0768  iron ABC transporter  30.37 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000612083  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3564  ferric uptake regulator family protein  36.64 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.201475 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2211  ferric uptake regulator family protein  30.71 
 
 
150 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.395667  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  25.93 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  30 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2620  ferric uptake regulator, Fur family  28.87 
 
 
164 aa  62  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  36.29 
 
 
139 aa  61.6  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  31.82 
 
 
143 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0734  ferric uptake regulator family protein  24.16 
 
 
155 aa  60.8  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000194517  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  29.79 
 
 
143 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0116  ferric uptake regulator, Fur family  40 
 
 
142 aa  60.8  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.241411 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3292  FUR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
121 aa  60.5  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000231053  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22450  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  35.92 
 
 
159 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2053  ferric-uptake regulator  36.43 
 
 
201 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  30.15 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  31.58 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2725  ferric uptake regulator, Fur family  32.59 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1680  ferric uptake regulator, Fur family  28.38 
 
 
167 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
150 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  28.99 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  28.99 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  28.99 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  28.99 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  28.99 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  28.99 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  28.99 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1102  ferric uptake regulator, Fur family  34.09 
 
 
140 aa  57.8  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.387055  normal  0.912899 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2000  ferric uptake regulator, Fur family  37.6 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  26.09 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0940  ferric uptake regulator, Fur family  25.69 
 
 
145 aa  57.8  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4458  ferric uptake regulator family protein  31.45 
 
 
141 aa  57.4  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.342841  hitchhiker  0.00667855 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  29.55 
 
 
143 aa  57  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1143  ferric uptake regulator, Fur family  25.38 
 
 
150 aa  57  0.00000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000124537  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3240  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
148 aa  57  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000230922  hitchhiker  0.00191408 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  27.27 
 
 
148 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  25.36 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  32.85 
 
 
139 aa  56.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0488  zinc uptake regulation protein  27.61 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.695603  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  29.55 
 
 
138 aa  56.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  27.03 
 
 
152 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03918  DNA-binding transcriptional repressor, Zn(II)-binding  31.34 
 
 
171 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3947  ferric uptake regulator, Fur family  31.34 
 
 
171 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3982  zinc uptake transcriptional repressor  31.34 
 
 
171 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.224982 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  27.78 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0468  ferric-uptake regulator  34.88 
 
 
173 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4599  zinc uptake transcriptional repressor  31.34 
 
 
171 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1144  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4286  zinc uptake transcriptional repressor  31.34 
 
 
171 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4551  zinc uptake transcriptional repressor  31.34 
 
 
171 aa  56.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03878  hypothetical protein  31.34 
 
 
171 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0519  ferric uptake regulator family protein  35.94 
 
 
135 aa  55.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.639512  normal  0.494415 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0825  ferric uptake regulator family protein  28.35 
 
 
121 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0802  ferric uptake regulator family protein  28.35 
 
 
121 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0418  ferric-uptake regulator  24.26 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00383086  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4508  zinc uptake transcriptional repressor  31.34 
 
 
171 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5527  zinc uptake transcriptional repressor  31.34 
 
 
171 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.508187  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  31.39 
 
 
143 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1373  ferric uptake regulator, Fur family  24.26 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000536701  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2141  ferric uptake regulator family protein  37.69 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2159  ferric uptake regulator family protein  35.48 
 
 
146 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00488582 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11678  putative transcription regulator  26.77 
 
 
137 aa  55.1  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
143 aa  54.7  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4433  zinc uptake transcriptional repressor  30.6 
 
 
171 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000291933 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4635  zinc uptake transcriptional repressor  30.6 
 
 
171 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4583  zinc uptake transcriptional repressor  30.6 
 
 
171 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4584  zinc uptake transcriptional repressor  30.6 
 
 
171 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735671  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1795  SsrA-binding protein  22.56 
 
 
124 aa  54.7  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.248367  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2705  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  23.68 
 
 
155 aa  54.7  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4498  zinc uptake transcriptional repressor  30.6 
 
 
171 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>