More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_24980 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_24980  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  100 
 
 
153 aa  305  2.0000000000000002e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20420  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  60.87 
 
 
140 aa  163  6.9999999999999995e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.375668  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4192  ferric uptake regulator, Fur family  57.78 
 
 
141 aa  154  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2705  ferric uptake regulator, Fur family  53.24 
 
 
139 aa  152  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2681  ferric uptake regulator family protein  53.29 
 
 
195 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.445944  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2712  ferric uptake regulator family protein  53.29 
 
 
157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2726  ferric uptake regulator family protein  53.29 
 
 
157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20346 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3965  ferric uptake regulator, Fur family  55.47 
 
 
138 aa  149  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0839  ferric-uptake regulator  57.69 
 
 
143 aa  149  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2983  ferric uptake regulator family protein  55.32 
 
 
149 aa  148  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.319363  normal  0.752016 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11938  ferric uptake regulation protein furA (fur)  55.56 
 
 
150 aa  147  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36340  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  55.47 
 
 
151 aa  147  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2725  ferric uptake regulator, Fur family  53.9 
 
 
152 aa  147  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3452  ferric uptake regulator family protein  51.82 
 
 
145 aa  147  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604214  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3209  ferric uptake regulator family protein  54.07 
 
 
147 aa  146  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.829925  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0684  ferric uptake regulator family protein  58.91 
 
 
142 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564127  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2159  ferric uptake regulator family protein  55.3 
 
 
146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00488582 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0294  ferric uptake regulator, Fur family  56.3 
 
 
170 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.774382  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0874  ferric-uptake regulator  57.58 
 
 
146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.250116  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0468  ferric-uptake regulator  51.52 
 
 
173 aa  144  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0145  fur family transcriptional regulator  55.22 
 
 
140 aa  144  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2053  ferric-uptake regulator  51.72 
 
 
201 aa  143  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3239  ferric uptake regulator, Fur family  52.74 
 
 
173 aa  142  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1532  ferric uptake regulator family protein  53.33 
 
 
174 aa  142  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0229059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0738  ferric uptake regulator family protein  55.8 
 
 
142 aa  141  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376687  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1623  ferric uptake regulator, Fur family  56.49 
 
 
137 aa  141  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22450  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  54.2 
 
 
159 aa  141  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0237  Fur family ferric uptake regulator  54.74 
 
 
161 aa  140  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4454  ferric uptake regulator, Fur family  57.48 
 
 
147 aa  140  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  50 
 
 
139 aa  140  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4803  ferric uptake regulator, Fur family  55.04 
 
 
154 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01070  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  52.63 
 
 
142 aa  139  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0518  ferric ion uptake regulator  53.79 
 
 
139 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2714  ferric-uptake regulator  51.02 
 
 
147 aa  139  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352648  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1102  ferric uptake regulator, Fur family  47.66 
 
 
140 aa  139  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.387055  normal  0.912899 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3313  ferric uptake regulator, Fur family  51.47 
 
 
146 aa  135  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.977689  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3077  ferric uptake regulator family protein  52.63 
 
 
155 aa  133  9e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2124  ferric uptake regulator, Fur family  53.12 
 
 
157 aa  133  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.506102  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2781  ferric uptake regulator, Fur family  51.47 
 
 
164 aa  132  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.028886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  49.63 
 
 
139 aa  131  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3814  ferric uptake regulator, Fur family  50 
 
 
146 aa  130  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000136698  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2095  ferric uptake regulator family protein  51.56 
 
 
166 aa  125  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.509153  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5253  ferric uptake regulator family protein  57.8 
 
 
158 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0866  ferric uptake regulator, Fur family  48.57 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0758878  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1937  ferric uptake regulator, Fur family  50.39 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0166827  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4279  ferric uptake regulator, Fur family  42.57 
 
 
183 aa  110  9e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000762776  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4885  ferric uptake regulator family protein  57.14 
 
 
108 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0503467  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4974  ferric uptake regulator family protein  57.14 
 
 
108 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6836  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 
144 aa  72  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2050  ferric uptake regulator, Fur family  34.35 
 
 
141 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0347  ferric uptake regulator, Fur family  36.03 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1315  transcriptional regulator, TrmB  29.93 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  31.65 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1143  ferric uptake regulator, Fur family  29.69 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000124537  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3966  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.867334  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  31.25 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  31.47 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  32.61 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  28.03 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0105  ferric uptake regulator family protein  31.91 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.013681  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  28.03 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  30.28 
 
 
143 aa  67  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0263  FUR family transcriptional regulator  32 
 
 
138 aa  67  0.00000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  31.25 
 
 
144 aa  67  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1905  ferric uptake regulator family protein  29.85 
 
 
140 aa  67  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  27.08 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4742  ferric uptake regulator, Fur family  36.09 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1211  ferric uptake regulation protein  26.62 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0179394  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0726  ferric uptake regulator, Fur family  34.09 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.787789  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  31.06 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  33.56 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  33.56 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7202  ferric uptake regulator, Fur family  35.34 
 
 
128 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0418  ferric-uptake regulator  27.13 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00383086  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3018  ferric uptake regulator, Fur family  38.06 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0481144  normal  0.294593 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3531  ferric uptake regulator, Fur family  29.23 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1481  ferric uptake regulator family protein  30.53 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.268678  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  30.6 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3125  ferric uptake regulator  32.37 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1206  ferric uptake regulator  32.37 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000560641  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0061  FUR family nickel uptake regulator  31.3 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0918  ferric uptake regulator  29.93 
 
 
137 aa  63.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  30.43 
 
 
148 aa  63.5  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0122  ferric uptake regulation protein  31.01 
 
 
154 aa  63.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00816522  normal  0.910281 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  30.43 
 
 
148 aa  63.5  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1389  ferric uptake regulation protein  32.33 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000498211  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1451  ferric uptake regulation protein  32.33 
 
 
155 aa  63.5  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000060196  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01084  ferric uptake regulator  35.05 
 
 
142 aa  63.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00618384  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  31.65 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1405  ferric uptake regulator family protein  30.43 
 
 
137 aa  63.5  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5746  ferric uptake regulator, DNA-binding transcriptional dual regulator of siderophore biosynthesis and transport  34.62 
 
 
157 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  34.69 
 
 
150 aa  62.8  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  34.69 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  31.16 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  31.16 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5530  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  31.16 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  31.16 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  34.69 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  31.16 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>