More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3966 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3966  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 
150 aa  306  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.867334  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7202  ferric uptake regulator, Fur family  47.83 
 
 
128 aa  117  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0753  ferric uptake regulator family protein  38.41 
 
 
148 aa  105  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.629039  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0375  ferric uptake regulator  39.69 
 
 
142 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3924  ferric uptake regulator family protein  36.43 
 
 
149 aa  104  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2458  ferric uptake regulator  39.69 
 
 
142 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2645  ferric uptake regulator  39.69 
 
 
142 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3457  ferric uptake regulator  39.69 
 
 
142 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1234  ferric uptake regulator  39.69 
 
 
142 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3420  ferric uptake regulator  39.69 
 
 
142 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133952  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3272  ferric uptake regulator, Fur family  36.43 
 
 
138 aa  104  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.710175  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3455  ferric uptake regulator  39.69 
 
 
142 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114286  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0616  ferric uptake regulator family protein  39.69 
 
 
142 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.740565  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1206  ferric uptake regulator  39.69 
 
 
142 aa  104  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0166  ferric uptake regulator family protein  39.69 
 
 
142 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0649  ferric uptake regulator family protein  39.69 
 
 
142 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2737  ferric uptake regulator family protein  39.69 
 
 
142 aa  104  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348547  normal  0.830954 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6009  ferric uptake regulator family protein  36.64 
 
 
155 aa  103  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.964976 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0570  ferric uptake regulator family protein  38.93 
 
 
142 aa  103  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0544  ferric uptake regulator family protein  38.93 
 
 
142 aa  103  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0596927  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3735  ferric uptake regulator family protein  38.93 
 
 
142 aa  102  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3653  ferric uptake regulator family protein  39.84 
 
 
149 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188238  normal  0.295199 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4555  ferric uptake regulator family protein  32.37 
 
 
145 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0603  ferric uptake regulator family protein  34.11 
 
 
138 aa  101  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401566  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2593  ferric uptake regulator family protein  38.89 
 
 
142 aa  101  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000283641 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2837  ferric uptake regulator family protein  37.12 
 
 
143 aa  100  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0406  ferric uptake regulator, Fur family  34.88 
 
 
139 aa  100  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5530  ferric uptake regulator family protein  38.93 
 
 
146 aa  100  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0251  ferric uptake regulator, Fur family  37.78 
 
 
167 aa  99.8  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0438  ferric uptake regulation protein  39.53 
 
 
136 aa  99.8  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0414  ferric uptake regulation protein  39.53 
 
 
136 aa  99.8  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  35.38 
 
 
143 aa  99.4  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2976  ferric uptake regulator family protein  37.12 
 
 
143 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0934  ferric uptake regulator family protein  37.8 
 
 
147 aa  99  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.634788  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3791  ferric uptake regulator family protein  36.23 
 
 
152 aa  99  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3385  ferric uptake regulator, Fur family  38.17 
 
 
142 aa  98.6  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.514247  hitchhiker  0.0000888993 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0571  ferric uptake regulator family protein  38.17 
 
 
142 aa  98.6  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2747  ferric uptake transcriptional repressor transcription regulator protein  36.88 
 
 
143 aa  97.8  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5746  ferric uptake regulator, DNA-binding transcriptional dual regulator of siderophore biosynthesis and transport  39.53 
 
 
157 aa  98.2  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0229  ferric uptake regulator family protein  36.3 
 
 
151 aa  97.8  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0223  transcriptional regulator  35.25 
 
 
145 aa  97.4  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2986  ferric uptake regulator, Fur family  38.28 
 
 
143 aa  97.4  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.105319  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1123  ferric uptake regulator family protein  36.17 
 
 
148 aa  97.4  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.488583  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2576  ferric uptake regulator, Fur family  38.28 
 
 
143 aa  97.4  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.710249  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2050  ferric uptake regulator, Fur family  36.72 
 
 
141 aa  97.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  34.29 
 
 
143 aa  96.7  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  33.59 
 
 
144 aa  95.1  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1690  ferric uptake regulator  34.27 
 
 
150 aa  94.7  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000286155  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  37.59 
 
 
161 aa  95.1  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4610  ferric uptake regulator family protein  34.06 
 
 
181 aa  94.4  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0474  ferric uptake regulator family protein  34.59 
 
 
143 aa  94.7  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 
144 aa  94.7  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1451  ferric uptake regulation protein  35.11 
 
 
155 aa  94.4  5e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000060196  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  36.84 
 
 
143 aa  94.4  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1389  ferric uptake regulation protein  35.11 
 
 
145 aa  94  6e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000498211  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0282  ferric uptake regulation protein  37.3 
 
 
158 aa  94  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0458  ferric uptake regulator, Fur family  37.3 
 
 
158 aa  94  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000485327 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1481  ferric uptake regulator family protein  35.11 
 
 
140 aa  93.6  9e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.268678  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  36.84 
 
 
143 aa  92.8  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4234  ferric uptake regulator family protein  33.82 
 
 
167 aa  92  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0343972  normal  0.519768 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  36.43 
 
 
143 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1194  ferric-uptake regulator  32.43 
 
 
159 aa  92.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  36.43 
 
 
143 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  35.77 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0475  ferric uptake regulator family protein  38.1 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1727  ferric uptake regulator, Fur family  36.64 
 
 
146 aa  92  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  36.43 
 
 
143 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  35.77 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  36.43 
 
 
143 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01084  ferric uptake regulator  35.56 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00618384  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  35.82 
 
 
157 aa  91.7  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  36.09 
 
 
143 aa  91.3  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  33.8 
 
 
149 aa  91.3  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1405  ferric uptake regulator family protein  36.22 
 
 
137 aa  91.3  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  36.09 
 
 
143 aa  90.5  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  34.06 
 
 
150 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  34.06 
 
 
150 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0987  ferric uptake regulator, Fur family  36.22 
 
 
139 aa  90.5  7e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.647798  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  34.06 
 
 
150 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  34.06 
 
 
150 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  34.06 
 
 
150 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  34.06 
 
 
148 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  34.06 
 
 
148 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  34.06 
 
 
148 aa  90.5  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  34.06 
 
 
148 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0967  ferric uptake regulator, Fur family  33.85 
 
 
142 aa  90.1  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.924679  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  34.06 
 
 
148 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  34.04 
 
 
149 aa  90.5  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  34.06 
 
 
148 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  34.06 
 
 
148 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  34.06 
 
 
148 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  34.06 
 
 
148 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  36.09 
 
 
143 aa  90.1  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  36.09 
 
 
143 aa  90.1  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  35.66 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2338  ferric uptake regulator  35.34 
 
 
169 aa  89.7  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807618  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0873  ferric uptake regulator, Fur family protein  35.61 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1575  ferric uptake regulator  34.33 
 
 
147 aa  89  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0833  ferric uptake regulator  33.33 
 
 
147 aa  89  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0894  ferric uptake regulator family protein  33.85 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.572753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>