More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1279 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1279  transcriptional regulator, Fur family  100 
 
 		 141 aa  295  2e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000471651  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1295  ferric uptake regulator family protein  92.2 
 
 		 141 aa  280  6.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000494544  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1505  FUR family transcriptional regulator  90.78 
 
 		 141 aa  277  5e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000456774  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  34.38 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  39.37 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2141  ferric uptake regulator family protein  37.01 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  34.11 
 
 		 150 aa  92  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  35.71 
 
 		 142 aa  92  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  35.71 
 
 		 142 aa  92  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  35.71 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  35.71 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  35.71 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  35.71 
 
 		 142 aa  92  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  35.71 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  35.71 
 
 		 166 aa  91.7  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  34.88 
 
 		 142 aa  90.9  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  34.92 
 
 		 143 aa  90.5  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0149  ferric uptake regulator, Fur family  38.71 
 
 		 139 aa  90.1  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000946287  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  38.35 
 
 		 159 aa  88.6  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  36.43 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  31.85 
 
 		 148 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  31.85 
 
 		 148 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  34.62 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  32.58 
 
 		 146 aa  87.4  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  34.4 
 
 		 143 aa  87  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0135  ferric uptake regulator, Fur family  39.34 
 
 		 139 aa  87.4  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000297915  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1144  ferric uptake regulator family protein  35.2 
 
 		 137 aa  87  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  34.65 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0101  ferric uptake regulator, Fur family  38.52 
 
 		 139 aa  86.7  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133113  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  37.98 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0153  ferric uptake regulator, Fur family  34.88 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000104646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0754  ferric uptake regulator family protein  39.34 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.354602  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  34.62 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0822  ferric uptake regulator family protein  34.4 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000300093  normal  0.0104511 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0284  ferric uptake regulator family protein  34.96 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0246387 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0885  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  32.03 
 
 		 142 aa  84  6e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  34.13 
 
 		 146 aa  84  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  36.5 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0603  ferric uptake regulator family protein  37.6 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  34.92 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3674  ferric uptake regulator family protein  35.71 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  34.13 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  31.82 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1892  Fur family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1224  ferric uptake regulator family protein  37.29 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.293203  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  34.4 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1216  ferric uptake regulator, Fur family  33.87 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  33.08 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0726  ferric uptake regulator, Fur family  35.77 
 
 		 130 aa  80.1  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.787789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0543  ferric uptake regulator, Fur family  37.4 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.70942 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2058  ferric uptake regulator, Fur family  31.85 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  34.4 
 
 		 147 aa  80.1  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1623  ferric uptake regulator, Fur family  36.29 
 
 		 137 aa  80.1  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4234  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0343972  normal  0.519768 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0332  ferric uptake regulator, Fur family  37.59 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000307002  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0352  ferric uptake regulator, Fur family  37.21 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1388  ferric uptake regulator, Fur family  33.07 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00327608  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2170  ferric uptake regulator family protein  37.5 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.414225 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0519  ferric uptake regulator family protein  32.81 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.639512  normal  0.494415 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  32.31 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0141  ferric uptake regulator, Fur family  33.86 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.896296  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  31.25 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0987  ferric uptake regulator family protein  33.08 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00388915 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4185  ferric uptake regulator, Fur family  33.6 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2366  ferric uptake regulator, Fur family  34.13 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.437919 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1230  FUR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0757057  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07451  ferric uptake regulator family protein  33.08 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0979772 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0105  ferric uptake regulator family protein  34.65 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.013681  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0279  ferric uptake regulator family protein  29.92 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.666463  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  32.82 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17110  zinc uptake regulator, Fur family  35.11 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184262  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  32.82 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  34.13 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2005  ferric uptake regulator, Fur family  33.07 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0768  iron ABC transporter  31.45 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000612083  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  31.85 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1806  ferric uptake regulator family protein  34.15 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.696064  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  32.8 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1420  FUR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0522352  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7263  ferric uptake regulator family protein  34.35 
 
 		 175 aa  76.6  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0199  ferric uptake regulator, Fur family  31.45 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.18921  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2543  ferric-uptake regulator  31.65 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37741  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0418  ferric-uptake regulator  30.33 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00383086  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0020  FUR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147149  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3922  ferric uptake regulator family protein  34.13 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000572819  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2340  ferric uptake regulator family protein  32.79 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1147  ferric uptake regulator family protein  35.11 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  31.62 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3112  ferric uptake regulator family protein  34.35 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.966736  normal  0.35423 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07031  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0821588  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01070  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  34.65 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1722  ferric uptake regulator family protein  27.78 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.907916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>