More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1469 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1469  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 
130 aa  268  2e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0185274  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2000  ferric uptake regulator, Fur family  71.9 
 
 
127 aa  166  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4458  ferric uptake regulator family protein  57.6 
 
 
141 aa  160  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.342841  hitchhiker  0.00667855 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3389  ferric uptake regulator family protein  60.33 
 
 
145 aa  155  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.261962  normal  0.0261677 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3564  ferric uptake regulator family protein  53.33 
 
 
137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.201475 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0519  ferric uptake regulator family protein  51.61 
 
 
135 aa  120  5e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.639512  normal  0.494415 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2294  ferric uptake regulator, Fur family  47.93 
 
 
123 aa  111  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3626  ferric uptake regulator, Fur family  39.69 
 
 
149 aa  104  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1144  ferric uptake regulator family protein  44.19 
 
 
137 aa  103  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3007  ferric uptake regulator family protein  35.83 
 
 
137 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.830794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4413  transcriptional regulator, Fur family  35.83 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000236646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4359  FUR family transcriptional regulator  35.83 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.291339  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4181  FUR family transcriptional regulator  35.83 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4019  FUR family transcriptional regulator  35.83 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.642016  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4029  FUR family transcriptional regulator  35.83 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4503  FUR family transcriptional regulator  35.83 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.606254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4132  ferric uptake regulator family protein  35.83 
 
 
137 aa  82  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4301  transcriptional regulator, Fur family  35.83 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.08025e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4397  transcriptional regulator, Fur family  35.83 
 
 
137 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.108592  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2401  ferric uptake regulator, Fur family  34.92 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0839  transcriptional regulator, Fur family  35.83 
 
 
128 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.442755  hitchhiker  0.000379655 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  38.02 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  38.84 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0170  ferric uptake regulator, Fur family  34.17 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  39.02 
 
 
153 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  34.15 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0603  ferric uptake regulator family protein  36.59 
 
 
143 aa  77  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  39.02 
 
 
143 aa  77  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3370  ferric uptake regulator, Fur family  35.34 
 
 
167 aa  76.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.073099  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3496  ferric uptake regulator, Fur family  40.62 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  37.4 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0885  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  31.54 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1140  ferric uptake regulator family protein  44.21 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  37.4 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2524  ferric uptake regulator, Fur family  33.07 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.568134  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2612  ferric uptake regulator, Fur family  31.93 
 
 
146 aa  73.9  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  36.8 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1453  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 
151 aa  73.6  0.0000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.023883  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2141  ferric uptake regulator family protein  32 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  34.92 
 
 
167 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  30.47 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2189  ferric uptake regulator, Fur family  29.75 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000532241  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  34.92 
 
 
167 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  34.92 
 
 
167 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0352  ferric uptake regulator, Fur family  38.04 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  32.52 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4185  ferric uptake regulator, Fur family  31.71 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421488  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  30.65 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3447  zinc uptake regulator  32.26 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0819749  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  36.89 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3510  zinc uptake regulator  32.26 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11469  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  39.84 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3458  zinc uptake regulator  32.26 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.455544  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  33.06 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 
158 aa  70.1  0.000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  32.06 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2171  ferric uptake regulator, Fur family  33.06 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00854605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  32.79 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  35.94 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0279  ferric uptake regulator family protein  29.41 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.666463  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2717  ferric uptake regulator family protein  30.65 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4538  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148082  normal  0.344615 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1892  Fur family transcriptional regulator  30.33 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  37.19 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  33.06 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0856  zinc uptake regulator  32.28 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.763265  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0825  ferric uptake regulator family protein  30.58 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0802  ferric uptake regulator family protein  30.58 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  36.59 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  34.92 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3820  ferric uptake regulator family protein  31.45 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.396621  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  31.45 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1233  ferric uptake regulator family protein  32.52 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  30.95 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  32.26 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  32.26 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  32.26 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  28.35 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1599  ferric uptake regulator, Fur family  30.33 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  30.65 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  31.45 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  29.84 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1536  ferric uptake regulator, Fur family  32.54 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.451133  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1373  ferric uptake regulator, Fur family  28.46 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000536701  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  29.84 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1646  ferric-uptake regulator  26.45 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5908  ferric uptake regulator, Fur family  36.59 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616966  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1216  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1612  ferric uptake regulator family protein  26.45 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.339502  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1138  ferric uptake regulator, Fur family  32.54 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716078  normal  0.825565 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  33.88 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1354  ferric uptake regulator, Fur family  28.57 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000236384  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2124  ferric uptake regulator, Fur family  34.15 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.506102  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  33.6 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1772  ferric uptake regulator, Fur family  29.6 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431388  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0726  ferric uptake regulator, Fur family  38.04 
 
 
130 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.787789  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0543  ferric uptake regulator, Fur family  29.03 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.70942 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1934  zinc uptake regulator  30.89 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395595  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0066  ferric uptake regulator, Fur family  31.78 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0375  ferric uptake regulator family protein  31.75 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.105221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>