More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0066 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0066  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 137 aa  282  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2171  ferric uptake regulator, Fur family  54.47 
 
 		 133 aa  149  8.999999999999999e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00854605  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2543  ferric-uptake regulator  56 
 
 		 187 aa  147  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37741  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2730  ferric uptake regulator family protein  54.4 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2717  ferric uptake regulator family protein  56.35 
 
 		 134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7037  ferric uptake regulator, Fur family  54.84 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1599  ferric uptake regulator, Fur family  56.25 
 
 		 135 aa  143  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1772  ferric uptake regulator, Fur family  50 
 
 		 141 aa  143  7.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2085  zinc uptake regulator  53.49 
 
 		 138 aa  142  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3820  ferric uptake regulator family protein  55.2 
 
 		 131 aa  142  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.396621  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2638  zinc uptake regulator  49.24 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1934  zinc uptake regulator  52.85 
 
 		 135 aa  141  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395595  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1536  ferric uptake regulator, Fur family  51.59 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.451133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3370  ferric uptake regulator, Fur family  55.2 
 
 		 167 aa  141  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.073099  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0856  zinc uptake regulator  48.8 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.763265  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3230  ferric uptake regulator, Fur family  50.81 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0854036  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  54.47 
 
 		 138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3458  zinc uptake regulator  53.6 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.455544  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3447  zinc uptake regulator  53.6 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0819749  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3510  zinc uptake regulator  53.6 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0734  ferric uptake regulator, Fur family  48.36 
 
 		 123 aa  137  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2373  ferric uptake regulator, Fur family  49.61 
 
 		 154 aa  137  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000416204 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  54.47 
 
 		 130 aa  136  7e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2340  ferric uptake regulator family protein  51.94 
 
 		 135 aa  137  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13670  zinc uptake regulator, Fur family  55.47 
 
 		 142 aa  133  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1261  ferric uptake regulator, Fur family  55.91 
 
 		 141 aa  133  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1179  Fur family ferric uptake regulator  49.22 
 
 		 142 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.462177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11800  zinc uptake regulator, Fur family  46.77 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00894406  normal  0.765019 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4538  ferric uptake regulator family protein  51.59 
 
 		 134 aa  131  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148082  normal  0.344615 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13650  zinc uptake regulator, Fur family  51.26 
 
 		 136 aa  131  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.357837 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0061  zinc uptake regulator  49.6 
 
 		 142 aa  131  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7263  ferric uptake regulator family protein  46.97 
 
 		 175 aa  130  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17110  zinc uptake regulator, Fur family  46.27 
 
 		 138 aa  130  9e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184262  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3150  ferric-uptake regulator  57.26 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07800  zinc uptake regulator, Fur family  49.21 
 
 		 148 aa  127  6e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2442  ferric uptake regulator, Fur family  47.69 
 
 		 131 aa  123  7e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168746 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1040  transcriptional regulator, Fur family  45.16 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0885  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  48.78 
 
 		 142 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1024  ferric uptake regulator, Fur family  41.67 
 
 		 131 aa  94  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.215149  hitchhiker  0.00554488 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  38.21 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  35.43 
 
 		 146 aa  88.2  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  37.4 
 
 		 143 aa  87.8  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  35.66 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  35.43 
 
 		 159 aa  87.4  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  36.43 
 
 		 143 aa  86.7  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  35.66 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3601  ferric uptake regulator, Fur family  33.85 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3535  ferric uptake regulator, Fur family  33.85 
 
 		 144 aa  84  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4413  ferric uptake regulator, Fur family  37.1 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00116957  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2401  ferric uptake regulator, Fur family  33.06 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0817  ferric uptake regulator family protein  35.11 
 
 		 130 aa  80.1  0.000000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  28.12 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  32 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  27.64 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4555  ferric uptake regulator family protein  32.58 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0247  ferric uptake transcriptional (FUR)-like transcription regulator protein  35.94 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0045  ferric uptake regulator family protein  28.23 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0438  ferric uptake regulation protein  33.06 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0414  ferric uptake regulation protein  33.06 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  28.24 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2987  FUR family transcriptional regulator  32 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  33.6 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  32 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11241  ferric uptake regulator family protein  35.54 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.934792  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2294  ferric uptake regulator, Fur family  36.8 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  32.52 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  30.4 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  27.13 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0967  ferric uptake regulator, Fur family  32.81 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.924679  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  33.06 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  29.92 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  27.78 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0077  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  32.03 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  33.33 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0987  ferric uptake regulator family protein  33.6 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00388915 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13391  hypothetical protein  35.88 
 
 		 186 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  34.15 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11321  ferric uptake regulator family protein  35.54 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.948862  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0406  ferric uptake regulator, Fur family  30.83 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  34.38 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  28.79 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1789  ferric uptake regulator, Fur family  32.54 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.372499  normal  0.929582 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  34.38 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0170  ferric uptake regulator, Fur family  32.26 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  31.5 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  27.27 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  35 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07031  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0821588  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11321  ferric uptake regulator family protein  34.71 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  31.5 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  35.29 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0603  ferric uptake regulator family protein  32 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  30.23 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0149  ferric uptake regulator, Fur family  30.08 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000946287  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  33.61 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0223  transcriptional regulator  33.88 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2524  ferric uptake regulator, Fur family  31.25 
 
 		 138 aa  72  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.568134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  33.61 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  29.6 
 
 		 157 aa  72  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>