More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4413 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4413  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 147 aa  279  7.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00116957  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  39.69 
 
 		 138 aa  93.6  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2373  ferric uptake regulator, Fur family  36.64 
 
 		 154 aa  91.3  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000416204 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0856  zinc uptake regulator  39.84 
 
 		 129 aa  90.5  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.763265  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2638  zinc uptake regulator  34.72 
 
 		 154 aa  89.4  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2171  ferric uptake regulator, Fur family  38.71 
 
 		 133 aa  88.6  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00854605  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2730  ferric uptake regulator family protein  40.31 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2543  ferric-uptake regulator  40.32 
 
 		 187 aa  84  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37741  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  38.28 
 
 		 130 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0066  ferric uptake regulator, Fur family  37.1 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3447  zinc uptake regulator  38.76 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0819749  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3458  zinc uptake regulator  38.76 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.455544  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3510  zinc uptake regulator  38.76 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3820  ferric uptake regulator family protein  37.01 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.396621  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4538  ferric uptake regulator family protein  35.94 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148082  normal  0.344615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2340  ferric uptake regulator family protein  34.88 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07800  zinc uptake regulator, Fur family  34.85 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2717  ferric uptake regulator family protein  36.09 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7263  ferric uptake regulator family protein  34.59 
 
 		 175 aa  80.1  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1772  ferric uptake regulator, Fur family  35.77 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0734  ferric uptake regulator, Fur family  35.77 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3230  ferric uptake regulator, Fur family  34.97 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0854036  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1179  Fur family ferric uptake regulator  36.43 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.462177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0061  zinc uptake regulator  34.04 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2442  ferric uptake regulator, Fur family  35.94 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168746 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11800  zinc uptake regulator, Fur family  34.92 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00894406  normal  0.765019 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1934  zinc uptake regulator  36 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395595  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1536  ferric uptake regulator, Fur family  33.87 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.451133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3370  ferric uptake regulator, Fur family  35.56 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.073099  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3150  ferric-uptake regulator  37.8 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1599  ferric uptake regulator, Fur family  39.52 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2085  zinc uptake regulator  34.85 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0885  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  34.4 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17110  zinc uptake regulator, Fur family  35.25 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184262  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13650  zinc uptake regulator, Fur family  34.45 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.357837 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  30.77 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1040  transcriptional regulator, Fur family  32.52 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13391  hypothetical protein  32.14 
 
 		 186 aa  70.1  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07031  ferric uptake regulator family protein  31.25 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0821588  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1165  ferric uptake regulator family protein  29.1 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0381194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1261  ferric uptake regulator, Fur family  36.72 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13670  zinc uptake regulator, Fur family  34.92 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0603  ferric uptake regulator family protein  31.25 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7037  ferric uptake regulator, Fur family  35.54 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06641  ferric uptake regulator family protein  31.25 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06931  ferric uptake regulator family protein  31.25 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.247961  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0637  ferric uptake regulator family protein  31.25 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.835222  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1892  Fur family transcriptional regulator  30 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0077  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  29.23 
 
 		 154 aa  67  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0564  ferric uptake regulator  28.36 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2725  ferric uptake regulator, Fur family  38.58 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1315  transcriptional regulator, TrmB  32 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07451  ferric uptake regulator family protein  32.03 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0979772 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0802  ferric uptake regulator family protein  28.68 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0825  ferric uptake regulator family protein  28.68 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0939  ferric uptake regulator family protein  35.16 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1373  ferric uptake regulator, Fur family  29.69 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000536701  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0020  FUR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147149  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  26.12 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1789  ferric uptake regulator, Fur family  25.74 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.372499  normal  0.929582 
 
 
-
 
NC_002936  DET1505  FUR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000456774  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2987  FUR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_19  transcriptional regulator, Fur family  29.63 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.677591  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  32.26 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  35.88 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2053  ferric-uptake regulator  35.07 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2513  ferric uptake regulator, Fur family  32.82 
 
 		 137 aa  62  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275348  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  30.37 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1775  ferric uptake regulator family protein  34.38 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.103697  normal  0.0302993 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1295  ferric uptake regulator family protein  29.77 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000494544  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1481  ferric uptake regulator family protein  32.03 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.268678  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  32.54 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  32.54 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  32.54 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  32.54 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1279  transcriptional regulator, Fur family  29.69 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000471651  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  32.54 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  32.54 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  31.25 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  32.54 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  32.54 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  32.54 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  32.54 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  32.54 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  32.54 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  32.54 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  32.54 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  32.54 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0312  ferric uptake regulator family protein  35.38 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2705  ferric uptake regulator, Fur family  33.85 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1389  ferric uptake regulation protein  28.37 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000498211  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  21.8 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1451  ferric uptake regulation protein  28.37 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000060196  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0987  ferric uptake regulator family protein  24.62 
 
 		 147 aa  60.1  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00388915 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2859  ferric-uptake regulator  32.35 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.141734 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0593  ferric uptake regulator family protein  29.69 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.211078  unclonable  0.00000627235 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  24.81 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3007  ferric uptake regulator, Fur family  26.56 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1806  ferric uptake regulator family protein  34.88 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.696064  normal  0.171205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>