More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7037 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7037  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 
150 aa  301  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1934  zinc uptake regulator  71.31 
 
 
135 aa  170  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395595  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3447  zinc uptake regulator  65.35 
 
 
131 aa  168  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0819749  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3458  zinc uptake regulator  65.35 
 
 
131 aa  168  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.455544  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3510  zinc uptake regulator  65.35 
 
 
131 aa  168  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11469  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3370  ferric uptake regulator, Fur family  70.49 
 
 
167 aa  167  6e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.073099  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2638  zinc uptake regulator  65.04 
 
 
154 aa  167  6e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1261  ferric uptake regulator, Fur family  71.54 
 
 
141 aa  166  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1536  ferric uptake regulator, Fur family  63.64 
 
 
130 aa  166  8e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.451133  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2373  ferric uptake regulator, Fur family  61.24 
 
 
154 aa  164  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000416204 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1599  ferric uptake regulator, Fur family  69.67 
 
 
135 aa  164  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3820  ferric uptake regulator family protein  65.04 
 
 
131 aa  163  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.396621  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  65.04 
 
 
130 aa  163  9e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2717  ferric uptake regulator family protein  63.11 
 
 
134 aa  161  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13650  zinc uptake regulator, Fur family  62.5 
 
 
136 aa  161  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.357837 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2730  ferric uptake regulator family protein  61.54 
 
 
150 aa  160  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1772  ferric uptake regulator, Fur family  60.98 
 
 
141 aa  157  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431388  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0856  zinc uptake regulator  63.03 
 
 
129 aa  156  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.763265  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  59.35 
 
 
138 aa  155  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13670  zinc uptake regulator, Fur family  64.57 
 
 
142 aa  155  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3230  ferric uptake regulator, Fur family  55.3 
 
 
150 aa  153  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0854036  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2543  ferric-uptake regulator  62.81 
 
 
187 aa  153  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37741  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2171  ferric uptake regulator, Fur family  59.5 
 
 
133 aa  152  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00854605  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7263  ferric uptake regulator family protein  58.91 
 
 
175 aa  151  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0061  zinc uptake regulator  58.02 
 
 
142 aa  150  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2085  zinc uptake regulator  59.35 
 
 
138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0066  ferric uptake regulator, Fur family  54.84 
 
 
137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2340  ferric uptake regulator family protein  56.67 
 
 
135 aa  144  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4538  ferric uptake regulator family protein  59.68 
 
 
134 aa  144  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148082  normal  0.344615 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17110  zinc uptake regulator, Fur family  54.03 
 
 
138 aa  141  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184262  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0734  ferric uptake regulator, Fur family  57.38 
 
 
123 aa  140  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264881  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1179  Fur family ferric uptake regulator  57.98 
 
 
142 aa  140  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.462177  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11800  zinc uptake regulator, Fur family  52.85 
 
 
129 aa  136  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00894406  normal  0.765019 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3150  ferric-uptake regulator  59.5 
 
 
137 aa  133  9e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07800  zinc uptake regulator, Fur family  54.4 
 
 
148 aa  131  3.9999999999999996e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0885  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  50.41 
 
 
142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2442  ferric uptake regulator, Fur family  48 
 
 
131 aa  123  8.000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000168746 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1040  transcriptional regulator, Fur family  50.41 
 
 
134 aa  121  3e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  33.6 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  33.6 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  33.6 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  33.61 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  35.48 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0405  ferric uptake regulator family protein  33.61 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  38.83 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  32.52 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4134  ferric uptake regulator, Fur family  34.92 
 
 
132 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4174  ferric uptake regulator, Fur family  34.92 
 
 
132 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3535  ferric uptake regulator, Fur family  31.4 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  34.07 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  30.23 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2152  ferric uptake regulator  32.59 
 
 
140 aa  72  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3508  ferric uptake regulator  33.61 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3601  ferric uptake regulator, Fur family  31.4 
 
 
144 aa  72  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  28.46 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  28.46 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  29.69 
 
 
159 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  33.82 
 
 
148 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  33.82 
 
 
148 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  33.82 
 
 
148 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  33.82 
 
 
148 aa  70.5  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  33.82 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  33.82 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  33.82 
 
 
148 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  33.82 
 
 
148 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  33.82 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  33.82 
 
 
148 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  33.82 
 
 
148 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  30.89 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  33.82 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  33.82 
 
 
148 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  29.27 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  33.82 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2248  ferric uptake regulator, Fur family  36.67 
 
 
133 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0111232 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  33.33 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  34.15 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  32.81 
 
 
154 aa  70.1  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1024  ferric uptake regulator, Fur family  33.85 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.215149  hitchhiker  0.00554488 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  37.25 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  32.59 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  30.58 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  33.33 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  28.69 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  32.59 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1392  ferric uptake regulator family protein  36.51 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  36.89 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  36.89 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1084  ferric uptake regulator, Fur family  30.17 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.784641  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  27.64 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1041  ferric uptake regulator family protein  34.96 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.213524  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  37.62 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1429  ferric uptake regulator family protein  36.51 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533787  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  36.89 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  28.23 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11321  ferric uptake regulator family protein  34.96 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.948862  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  36.89 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  26.61 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>