More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7263 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7263  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 
175 aa  349  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0061  zinc uptake regulator  82.22 
 
 
142 aa  230  7.000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3230  ferric uptake regulator, Fur family  53.28 
 
 
150 aa  158  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0854036  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3370  ferric uptake regulator, Fur family  57.66 
 
 
167 aa  156  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.073099  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2340  ferric uptake regulator family protein  56.59 
 
 
135 aa  156  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07800  zinc uptake regulator, Fur family  52.83 
 
 
148 aa  156  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0856  zinc uptake regulator  57.85 
 
 
129 aa  153  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.763265  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7037  ferric uptake regulator, Fur family  56.03 
 
 
150 aa  152  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  53.08 
 
 
138 aa  152  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1261  ferric uptake regulator, Fur family  55.41 
 
 
141 aa  151  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2171  ferric uptake regulator, Fur family  58.87 
 
 
133 aa  150  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00854605  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1536  ferric uptake regulator, Fur family  56 
 
 
130 aa  149  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.451133  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13670  zinc uptake regulator, Fur family  58.09 
 
 
142 aa  149  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1934  zinc uptake regulator  56.45 
 
 
135 aa  147  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395595  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0734  ferric uptake regulator, Fur family  57.63 
 
 
123 aa  147  8e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264881  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2373  ferric uptake regulator, Fur family  51.47 
 
 
154 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000416204 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  55.65 
 
 
130 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3820  ferric uptake regulator family protein  56.69 
 
 
131 aa  145  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.396621  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1179  Fur family ferric uptake regulator  55.65 
 
 
142 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.462177  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3447  zinc uptake regulator  55.56 
 
 
131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0819749  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3458  zinc uptake regulator  55.56 
 
 
131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.455544  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3510  zinc uptake regulator  55.56 
 
 
131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11469  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2717  ferric uptake regulator family protein  54.69 
 
 
134 aa  144  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2638  zinc uptake regulator  49.64 
 
 
154 aa  144  8.000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2085  zinc uptake regulator  51.85 
 
 
138 aa  143  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1772  ferric uptake regulator, Fur family  56.91 
 
 
141 aa  140  7e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431388  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13650  zinc uptake regulator, Fur family  57.14 
 
 
136 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.357837 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1599  ferric uptake regulator, Fur family  57.6 
 
 
135 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4538  ferric uptake regulator family protein  54.4 
 
 
134 aa  138  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148082  normal  0.344615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2543  ferric-uptake regulator  52.34 
 
 
187 aa  136  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37741  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2730  ferric uptake regulator family protein  53.12 
 
 
150 aa  136  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0885  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  50.76 
 
 
142 aa  135  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11800  zinc uptake regulator, Fur family  51.18 
 
 
129 aa  136  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00894406  normal  0.765019 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17110  zinc uptake regulator, Fur family  47.01 
 
 
138 aa  134  7.000000000000001e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184262  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3150  ferric-uptake regulator  55.12 
 
 
137 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0066  ferric uptake regulator, Fur family  46.97 
 
 
137 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1040  transcriptional regulator, Fur family  46.34 
 
 
134 aa  118  3e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2442  ferric uptake regulator, Fur family  44 
 
 
131 aa  119  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000168746 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  36.29 
 
 
143 aa  90.5  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  34.68 
 
 
153 aa  89  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  34.68 
 
 
143 aa  88.2  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  33.87 
 
 
143 aa  86.3  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  31.55 
 
 
167 aa  85.5  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  31.55 
 
 
167 aa  85.1  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  33.87 
 
 
143 aa  85.5  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  31.55 
 
 
167 aa  85.5  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  35.43 
 
 
144 aa  85.1  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  33.09 
 
 
147 aa  84.3  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4383  ferric uptake regulator, Fur family  35.04 
 
 
132 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.134348 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  33.07 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3508  ferric uptake regulator  35.54 
 
 
134 aa  81.6  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0817  ferric uptake regulator family protein  35.43 
 
 
130 aa  80.1  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  30.47 
 
 
146 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0342  ferric uptake regulator family protein  30.57 
 
 
237 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.087099  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  33.03 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0405  ferric uptake regulator family protein  33.08 
 
 
134 aa  77.8  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
139 aa  77  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2248  ferric uptake regulator, Fur family  34.71 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0111232 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1279  transcriptional regulator, Fur family  34.35 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000471651  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0842  ferric uptake regulator, Fur family  32.95 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  29.85 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  30 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  33.08 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  32.28 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  33.87 
 
 
154 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1295  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000494544  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1024  ferric uptake regulator, Fur family  33.59 
 
 
131 aa  73.6  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.215149  hitchhiker  0.00554488 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4413  ferric uptake regulator, Fur family  33.87 
 
 
147 aa  73.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00116957  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11241  ferric uptake regulator family protein  31.01 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.934792  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11321  ferric uptake regulator family protein  30.71 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19031  ferric uptake regulator family protein  31.75 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.442263  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  26.92 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11321  ferric uptake regulator family protein  30.71 
 
 
144 aa  72  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.948862  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1505  FUR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000456774  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  25.76 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1033  ferric uptake regulator family  31.75 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1041  ferric uptake regulator family protein  30.53 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.213524  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0754  ferric uptake regulator family protein  35.29 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.354602  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4134  ferric uptake regulator, Fur family  33.59 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  28.68 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4174  ferric uptake regulator, Fur family  33.59 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4742  ferric uptake regulator, Fur family  36.36 
 
 
154 aa  70.9  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0101  ferric uptake regulator, Fur family  32.85 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133113  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0603  ferric uptake regulator family protein  39.05 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401566  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0135  ferric uptake regulator, Fur family  33.82 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000297915  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  31.54 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3601  ferric uptake regulator, Fur family  31.01 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  30.88 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3535  ferric uptake regulator, Fur family  31.01 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0753  ferric uptake regulator family protein  38.02 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.629039  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0603  ferric uptake regulator family protein  31.54 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  36.79 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  27.42 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  36.79 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  36.79 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  27.74 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  36.79 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  36.79 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  36.79 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  36.79 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>