More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0856 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0856  zinc uptake regulator  100 
 
 
129 aa  266  8.999999999999999e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.763265  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0734  ferric uptake regulator, Fur family  74.8 
 
 
123 aa  198  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264881  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2340  ferric uptake regulator family protein  65.62 
 
 
135 aa  185  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3230  ferric uptake regulator, Fur family  69.67 
 
 
150 aa  185  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0854036  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1179  Fur family ferric uptake regulator  64.06 
 
 
142 aa  179  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.462177  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7037  ferric uptake regulator, Fur family  63.03 
 
 
150 aa  156  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7263  ferric uptake regulator family protein  57.85 
 
 
175 aa  153  7e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2171  ferric uptake regulator, Fur family  57.38 
 
 
133 aa  153  9e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00854605  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  58.68 
 
 
138 aa  152  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0061  zinc uptake regulator  57.26 
 
 
142 aa  152  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11800  zinc uptake regulator, Fur family  55.56 
 
 
129 aa  150  4e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00894406  normal  0.765019 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1599  ferric uptake regulator, Fur family  60.98 
 
 
135 aa  147  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3370  ferric uptake regulator, Fur family  59.02 
 
 
167 aa  147  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.073099  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1261  ferric uptake regulator, Fur family  60 
 
 
141 aa  146  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1536  ferric uptake regulator, Fur family  53.23 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.451133  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2373  ferric uptake regulator, Fur family  53.97 
 
 
154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000416204 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2730  ferric uptake regulator family protein  54.84 
 
 
150 aa  145  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1772  ferric uptake regulator, Fur family  54.92 
 
 
141 aa  144  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431388  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2638  zinc uptake regulator  53.17 
 
 
154 aa  144  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1934  zinc uptake regulator  55.37 
 
 
135 aa  143  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395595  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3447  zinc uptake regulator  55.28 
 
 
131 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0819749  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3458  zinc uptake regulator  55.28 
 
 
131 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.455544  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3510  zinc uptake regulator  55.28 
 
 
131 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11469  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3820  ferric uptake regulator family protein  56 
 
 
131 aa  141  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.396621  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2717  ferric uptake regulator family protein  54.33 
 
 
134 aa  141  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  55.46 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0066  ferric uptake regulator, Fur family  48.8 
 
 
137 aa  139  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13670  zinc uptake regulator, Fur family  57.6 
 
 
142 aa  138  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2543  ferric-uptake regulator  51.61 
 
 
187 aa  138  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37741  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13650  zinc uptake regulator, Fur family  54.24 
 
 
136 aa  136  8.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.357837 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4538  ferric uptake regulator family protein  52.85 
 
 
134 aa  134  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148082  normal  0.344615 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2085  zinc uptake regulator  49.6 
 
 
138 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17110  zinc uptake regulator, Fur family  46.34 
 
 
138 aa  130  7.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184262  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3150  ferric-uptake regulator  54.72 
 
 
137 aa  124  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0885  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  50.82 
 
 
142 aa  124  6e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07800  zinc uptake regulator, Fur family  48.76 
 
 
148 aa  122  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1040  transcriptional regulator, Fur family  47.93 
 
 
134 aa  120  7e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2442  ferric uptake regulator, Fur family  42.06 
 
 
131 aa  115  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000168746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4413  ferric uptake regulator, Fur family  39.84 
 
 
147 aa  90.5  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00116957  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  36.36 
 
 
143 aa  89.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  36.36 
 
 
143 aa  88.6  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3508  ferric uptake regulator  44.66 
 
 
134 aa  87.4  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  32 
 
 
143 aa  87  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  40.78 
 
 
153 aa  87  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  43.4 
 
 
143 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  43.4 
 
 
143 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  43.4 
 
 
143 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  43.4 
 
 
143 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  36.36 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  44.55 
 
 
148 aa  84.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4383  ferric uptake regulator, Fur family  38.21 
 
 
132 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.134348 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  44.55 
 
 
148 aa  84.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  42.45 
 
 
143 aa  84.7  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  33.06 
 
 
147 aa  84.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  29.69 
 
 
148 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  42.45 
 
 
143 aa  84  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  44.55 
 
 
148 aa  84  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  41.51 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  35.54 
 
 
143 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  30 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  41.51 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  30 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  30 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  41.51 
 
 
143 aa  82  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  41.51 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0405  ferric uptake regulator family protein  41.75 
 
 
134 aa  82.4  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  41.51 
 
 
143 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  34.43 
 
 
143 aa  82  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0817  ferric uptake regulator family protein  37.69 
 
 
130 aa  81.6  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2152  ferric uptake regulator  38.32 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  41.51 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  42.73 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  42.73 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  42.73 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  42.73 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  42.73 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  42.73 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  42.73 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4174  ferric uptake regulator, Fur family  37.6 
 
 
132 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  43.14 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  42.73 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  41.51 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  41.51 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4134  ferric uptake regulator, Fur family  37.6 
 
 
132 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  42.73 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  42.34 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  42.34 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1084  ferric uptake regulator, Fur family  30.4 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.784641  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  42.34 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  42.73 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  42.34 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  43.14 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  42.34 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1024  ferric uptake regulator, Fur family  35.25 
 
 
131 aa  80.5  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.215149  hitchhiker  0.00554488 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1206  ferric uptake regulator  43.4 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000560641  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3125  ferric uptake regulator  43.4 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2248  ferric uptake regulator, Fur family  39.17 
 
 
133 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0111232 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  32.23 
 
 
167 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2338  ferric uptake regulator  40.57 
 
 
169 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807618  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  35.54 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>