More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_2085 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_2085  zinc uptake regulator  100 
 
 		 138 aa  281  2.0000000000000002e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1536  ferric uptake regulator, Fur family  52.34 
 
 		 130 aa  146  8e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.451133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3230  ferric uptake regulator, Fur family  52.99 
 
 		 150 aa  146  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0854036  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7037  ferric uptake regulator, Fur family  59.35 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2543  ferric-uptake regulator  53.91 
 
 		 187 aa  145  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37741  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7263  ferric uptake regulator family protein  51.85 
 
 		 175 aa  143  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0066  ferric uptake regulator, Fur family  53.49 
 
 		 137 aa  142  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3820  ferric uptake regulator family protein  56.35 
 
 		 131 aa  142  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.396621  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  55.28 
 
 		 138 aa  142  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1772  ferric uptake regulator, Fur family  52.85 
 
 		 141 aa  142  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1934  zinc uptake regulator  55.04 
 
 		 135 aa  141  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395595  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0061  zinc uptake regulator  51.49 
 
 		 142 aa  140  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3447  zinc uptake regulator  54.4 
 
 		 131 aa  140  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0819749  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3458  zinc uptake regulator  54.4 
 
 		 131 aa  140  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.455544  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3510  zinc uptake regulator  54.4 
 
 		 131 aa  140  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2730  ferric uptake regulator family protein  52.76 
 
 		 150 aa  140  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  54.47 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2171  ferric uptake regulator, Fur family  53.66 
 
 		 133 aa  138  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00854605  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13670  zinc uptake regulator, Fur family  56.45 
 
 		 142 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1599  ferric uptake regulator, Fur family  54.48 
 
 		 135 aa  136  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2340  ferric uptake regulator family protein  50.41 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1261  ferric uptake regulator, Fur family  55.12 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1179  Fur family ferric uptake regulator  52.85 
 
 		 142 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.462177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0856  zinc uptake regulator  49.6 
 
 		 129 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.763265  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13650  zinc uptake regulator, Fur family  52.94 
 
 		 136 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.357837 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2717  ferric uptake regulator family protein  53.6 
 
 		 134 aa  133  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3150  ferric-uptake regulator  53.97 
 
 		 137 aa  133  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2638  zinc uptake regulator  46.97 
 
 		 154 aa  131  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3370  ferric uptake regulator, Fur family  54.84 
 
 		 167 aa  130  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.073099  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2373  ferric uptake regulator, Fur family  46.67 
 
 		 154 aa  130  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000416204 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17110  zinc uptake regulator, Fur family  50.4 
 
 		 138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184262  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07800  zinc uptake regulator, Fur family  50 
 
 		 148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0734  ferric uptake regulator, Fur family  48.78 
 
 		 123 aa  124  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1040  transcriptional regulator, Fur family  47.15 
 
 		 134 aa  121  3e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0885  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  49.59 
 
 		 142 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2442  ferric uptake regulator, Fur family  45.6 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168746 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11800  zinc uptake regulator, Fur family  45.97 
 
 		 129 aa  117  7e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00894406  normal  0.765019 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4538  ferric uptake regulator family protein  47.2 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148082  normal  0.344615 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1024  ferric uptake regulator, Fur family  38.76 
 
 		 131 aa  94  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.215149  hitchhiker  0.00554488 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  34.96 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  33.86 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  32.52 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  31.82 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  32.52 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  32.52 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  32.52 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  32.52 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  32.52 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  32.52 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  32.52 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  32.52 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  32.54 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  32.52 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0603  ferric uptake regulator family protein  31.75 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2294  ferric uptake regulator, Fur family  35.48 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11321  ferric uptake regulator family protein  33.88 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.948862  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  31.25 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11321  ferric uptake regulator family protein  32.8 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  31.25 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1033  ferric uptake regulator family  33.85 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0438  ferric uptake regulation protein  34.68 
 
 		 136 aa  73.6  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0414  ferric uptake regulation protein  34.68 
 
 		 136 aa  73.6  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1041  ferric uptake regulator family protein  33.06 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.213524  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  27.64 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  31.2 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3535  ferric uptake regulator, Fur family  29.03 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3601  ferric uptake regulator, Fur family  29.03 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19031  ferric uptake regulator family protein  33.61 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.442263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4383  ferric uptake regulator, Fur family  32.03 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.134348 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11241  ferric uptake regulator family protein  33.88 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.934792  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0987  ferric uptake regulator family protein  33.01 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00388915 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1194  ferric-uptake regulator  33.06 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  30.33 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  29.03 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  30.89 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0342  ferric uptake regulator family protein  30.77 
 
 		 237 aa  70.9  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.087099  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0405  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  31.58 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  31.58 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  31.58 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3007  ferric uptake regulator, Fur family  29.03 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  31.58 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1279  transcriptional regulator, Fur family  29.6 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000471651  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  31.01 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  32.62 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  32.62 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4413  ferric uptake regulator, Fur family  34.68 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00116957  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3031  ferric uptake regulator family protein  33.61 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2987  FUR family transcriptional regulator  32 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2859  ferric-uptake regulator  36.8 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.141734 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  31.4 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15241  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  30.7 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  36.27 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>