More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2987 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2987  FUR family transcriptional regulator  100 
 
 		 139 aa  286  5.0000000000000004e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0045  ferric uptake regulator family protein  58.78 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3535  ferric uptake regulator, Fur family  60.47 
 
 		 144 aa  175  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3601  ferric uptake regulator, Fur family  59.69 
 
 		 144 aa  174  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0184  ferric uptake regulator, Fur family  37.04 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.567959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2318  ferric uptake regulator, Fur family  35.71 
 
 		 152 aa  94.4  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.956105  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2477  ferric uptake regulator family protein  36.23 
 
 		 143 aa  86.7  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0153326  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0279  ferric uptake regulator family protein  33.07 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.666463  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2171  ferric uptake regulator, Fur family  34.68 
 
 		 133 aa  80.1  0.000000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00854605  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1536  ferric uptake regulator, Fur family  34.65 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.451133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0194  ferric uptake regulator, Fur family  34.81 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.207086  normal  0.440649 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2442  ferric uptake regulator, Fur family  35.38 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168746 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2401  ferric uptake regulator, Fur family  28.35 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0066  ferric uptake regulator, Fur family  32 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0170  ferric uptake regulator, Fur family  26.92 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1772  ferric uptake regulator, Fur family  34.96 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1875  ferric uptake regulator family protein  35.48 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.332253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0778  ferric uptake regulator family protein  34.96 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.714115  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  28.99 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4359  FUR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.291339  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4181  FUR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4019  FUR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.642016  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4029  FUR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742096  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0515  ferric uptake regulator, Fur family  28.26 
 
 		 142 aa  72  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4503  FUR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.606254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4132  ferric uptake regulator family protein  29.13 
 
 		 137 aa  72  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4413  transcriptional regulator, Fur family  29.92 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000236646  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4185  ferric uptake regulator, Fur family  29.01 
 
 		 139 aa  72  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  33.08 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4301  transcriptional regulator, Fur family  29.92 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.08025e-17 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1892  Fur family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4397  transcriptional regulator, Fur family  29.13 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.108592  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  32.86 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  31.39 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  32.86 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3007  ferric uptake regulator family protein  28.35 
 
 		 137 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.830794  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0839  transcriptional regulator, Fur family  28.57 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.442755  hitchhiker  0.000379655 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1279  transcriptional regulator, Fur family  30.16 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000471651  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  32.81 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3531  ferric uptake regulator, Fur family  35.04 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0603  ferric uptake regulator family protein  31.39 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  28.89 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1295  ferric uptake regulator family protein  30.16 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000494544  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2085  zinc uptake regulator  32 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1505  FUR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000456774  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1216  ferric uptake regulator, Fur family  29.86 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0885  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  33.59 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  31.82 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2340  ferric uptake regulator family protein  31.45 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  30.15 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  33.07 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1120  FUR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.224553  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  28.78 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  31.06 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3447  zinc uptake regulator  31.5 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0819749  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2543  ferric-uptake regulator  35.2 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37741  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3458  zinc uptake regulator  31.5 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.455544  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  29.01 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1315  transcriptional regulator, TrmB  29.85 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3510  zinc uptake regulator  31.5 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3230  ferric uptake regulator, Fur family  28.46 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0854036  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17110  zinc uptake regulator, Fur family  30.23 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184262  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13650  zinc uptake regulator, Fur family  36.67 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.357837 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0990  ferric uptake regulator family protein  28 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  28.89 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2730  ferric uptake regulator family protein  35.2 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0061  zinc uptake regulator  34.33 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1637  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000434333  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  25.19 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3924  ferric uptake regulator family protein  33.09 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.567476 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0842  ferric uptake regulator, Fur family  28.37 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  28.89 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1934  zinc uptake regulator  34.68 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395595  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3820  ferric uptake regulator family protein  32.54 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.396621  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0734  ferric uptake regulator, Fur family  28.8 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1147  ferric uptake regulator family protein  34.56 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  37.59 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  28.57 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3863  ferric uptake regulator, Fur family  31.43 
 
 		 160 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199126  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  31.2 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1451  ferric uptake regulation protein  33.08 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000060196  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  28.89 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  28.26 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  28.15 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1389  ferric uptake regulation protein  33.08 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000498211  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2189  ferric uptake regulator, Fur family  28.24 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000532241  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  28.15 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7037  ferric uptake regulator, Fur family  33.58 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1599  ferric uptake regulator, Fur family  36.15 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0856  zinc uptake regulator  26.19 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.763265  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4413  ferric uptake regulator, Fur family  36.8 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00116957  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6009  ferric uptake regulator family protein  34.48 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.964976 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1296  FUR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3806  ferric uptake regulator family protein  30.71 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  26.09 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2638  zinc uptake regulator  29.92 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17451  ferric uptake regulator family protein  30.08 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.949789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>