More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0194 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0194  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 152 aa  311  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.207086  normal  0.440649 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0184  ferric uptake regulator, Fur family  61.03 
 
 		 143 aa  186  8e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.567959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2477  ferric uptake regulator family protein  48.59 
 
 		 143 aa  141  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0153326  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2318  ferric uptake regulator, Fur family  49.29 
 
 		 152 aa  131  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.956105  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0045  ferric uptake regulator family protein  35.92 
 
 		 142 aa  105  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3601  ferric uptake regulator, Fur family  36.69 
 
 		 144 aa  94.4  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3535  ferric uptake regulator, Fur family  36.69 
 
 		 144 aa  94.4  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2987  FUR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 139 aa  91.7  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4185  ferric uptake regulator, Fur family  29.5 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  31.25 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0170  ferric uptake regulator, Fur family  30.66 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2401  ferric uptake regulator, Fur family  32.14 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  31.25 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  31.25 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  30.56 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4160  FUR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 151 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4001  FUR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 151 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000832394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3832  FUR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 151 aa  72  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3848  FUR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 151 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000844204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4313  FUR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 151 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  29.86 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1036  transcriptional regulator, Fur family  29.33 
 
 		 151 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0163253  normal  0.210334 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4201  transcriptional regulator, Fur family  29.33 
 
 		 151 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0217905  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4224  transcriptional regulator, Fur family  29.33 
 
 		 151 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00546613  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3922  ferric uptake regulator family protein  29.33 
 
 		 151 aa  72  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000572819  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  29.93 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4115  transcriptional regulator, Fur family  29.33 
 
 		 151 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5116299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0279  ferric uptake regulator family protein  29.29 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.666463  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  27.21 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  32.62 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  27.4 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2867  ferric uptake regulator, Fur family  31.5 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000960204  decreased coverage  0.0000000000000181287 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2259  ferric uptake regulator, Fur family  31.34 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  28.24 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0603  ferric uptake regulator family protein  26.47 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  31.3 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3895  ferric uptake regulator family protein  30.6 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.845515 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0593  ferric uptake regulator family protein  32.09 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.211078  unclonable  0.00000627235 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  31.11 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  26.39 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  26.39 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  26.39 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  31.16 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  26.39 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  26.39 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  26.39 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  26.39 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07451  ferric uptake regulator family protein  30.37 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0979772 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0637  ferric uptake regulator family protein  29.1 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.835222  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1216  ferric uptake regulator, Fur family  28.15 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1577  ferric uptake regulator, Fur family  31.78 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1138  ferric uptake regulator, Fur family  25.76 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716078  normal  0.825565 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  25.69 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  30.22 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1120  FUR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.224553  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1892  Fur family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1905  ferric uptake regulator family protein  32.14 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06641  ferric uptake regulator family protein  29.1 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  26.57 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0856  zinc uptake regulator  31.01 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.763265  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1147  ferric uptake regulator family protein  30.77 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  30.6 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0515  ferric uptake regulator, Fur family  26.28 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2340  ferric uptake regulator family protein  30.95 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  26.06 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  26.06 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06931  ferric uptake regulator family protein  29.1 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.247961  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07031  ferric uptake regulator family protein  28.89 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0821588  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13391  hypothetical protein  29.5 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1612  ferric uptake regulator family protein  25.58 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.339502  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1649  ferric uptake regulator family protein  29.37 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0556503  hitchhiker  0.00120732 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1646  ferric-uptake regulator  25.58 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1140  ferric uptake regulator family protein  31.39 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1789  ferric uptake regulator, Fur family  29.2 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.372499  normal  0.929582 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  27.08 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  24.83 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  31.62 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0987  ferric uptake regulator family protein  28.47 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00388915 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1746  FUR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  25.87 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1451  ferric uptake regulation protein  31.16 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000060196  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1389  ferric uptake regulation protein  31.16 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000498211  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3370  ferric uptake regulator, Fur family  30.22 
 
 		 167 aa  60.5  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.073099  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4132  ferric uptake regulator family protein  26.24 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  27.34 
 
 		 154 aa  60.1  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2612  ferric uptake regulator, Fur family  28.36 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1293  ferric uptake regulator family protein  27.59 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2029  FUR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3007  ferric uptake regulator family protein  26.24 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.830794  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  25.53 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0077  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  28.26 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0066  ferric uptake regulator, Fur family  32.06 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  29.55 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1481  ferric uptake regulator family protein  32.84 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.268678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>