More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1293 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1293  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 149 aa  311  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1649  ferric uptake regulator family protein  93.29 
 
 		 149 aa  298  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0556503  hitchhiker  0.00120732 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1460  ferric uptake regulator, Fur family  42.57 
 
 		 161 aa  137  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4545  ferric uptake regulator family protein  41.89 
 
 		 147 aa  126  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2024  ferric uptake regulator, Fur family  38.19 
 
 		 176 aa  90.5  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.523147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2073  ferric uptake regulator family protein  37.69 
 
 		 151 aa  90.9  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365477  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3901  ferric uptake regulator family protein  35.62 
 
 		 168 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000831439  normal  0.164099 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  31.58 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1892  Fur family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  30.77 
 
 		 151 aa  84  7e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0593  ferric uptake regulator family protein  31.88 
 
 		 154 aa  84  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.211078  unclonable  0.00000627235 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  28.77 
 
 		 145 aa  83.6  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  33.09 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  26.28 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0603  ferric uptake regulator family protein  30.83 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  32.64 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0842  ferric uptake regulator, Fur family  31.11 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  34.75 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  31.79 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3895  ferric uptake regulator family protein  31.39 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.845515 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  29.53 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  32.88 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  32.64 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  36.57 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  32.12 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1084  ferric uptake regulator, Fur family  30.47 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.784641  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4185  ferric uptake regulator, Fur family  29.58 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  30.26 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2145  ferric-uptake regulator  38.3 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4742  ferric uptake regulator, Fur family  29.05 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  31.88 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1216  ferric uptake regulator, Fur family  30 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  27.97 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2152  ferric uptake regulator  35.71 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  28.67 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  35.82 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1147  ferric uptake regulator family protein  32.14 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  31.13 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0251  ferric uptake regulator, Fur family  35.77 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  30.34 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  30.34 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  30.34 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  35.34 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1194  ferric-uptake regulator  32.17 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1123  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.488583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1206  ferric uptake regulator  34.33 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  35.07 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1234  ferric uptake regulator  34.33 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2458  ferric uptake regulator  34.33 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0375  ferric uptake regulator  34.33 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3457  ferric uptake regulator  34.33 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3455  ferric uptake regulator  34.33 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114286  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2645  ferric uptake regulator  34.33 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3420  ferric uptake regulator  34.33 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133952  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1140  ferric uptake regulator family protein  33.1 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  35.07 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  35.07 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  35.07 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1690  ferric uptake regulator  34.27 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000286155  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  35.07 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  35.07 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  35.07 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  35.07 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  35.07 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0928  FUR family manganese uptake regulator  33.33 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  35.07 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  31.16 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  30.07 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3385  ferric uptake regulator, Fur family  34.07 
 
 		 142 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.514247  hitchhiker  0.0000888993 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  35.11 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  28.76 
 
 		 147 aa  72  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  34.33 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  31.16 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0616  ferric uptake regulator family protein  32.84 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.740565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1593  ferric uptake regulator  35.07 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000083166  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0166  ferric uptake regulator family protein  32.84 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00840  zinc uptake transcriptional regulator, Fur family  34.29 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0649  ferric uptake regulator family protein  32.84 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0894  ferric uptake regulator family protein  35.51 
 
 		 152 aa  72  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572753 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2737  ferric uptake regulator family protein  32.84 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348547  normal  0.830954 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0571  ferric uptake regulator family protein  34.07 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1575  ferric uptake regulator  30.88 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2976  ferric uptake regulator family protein  35.56 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  35.07 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0229  ferric uptake regulator family protein  34.62 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2442  ferric uptake regulator, Fur family  33.08 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168746 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0570  ferric uptake regulator family protein  32.09 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2189  ferric uptake regulator, Fur family  29.79 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000532241  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  26.53 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0544  ferric uptake regulator family protein  32.09 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0596927  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0833  ferric uptake regulator  33.08 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  31.54 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2788  putative zinc uptake regulation protein  30.22 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2612  ferric uptake regulator, Fur family  27.14 
 
 		 146 aa  70.1  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2986  ferric uptake regulator, Fur family  34.81 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.105319  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0438  ferric uptake regulation protein  31.43 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0414  ferric uptake regulation protein  31.43 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0603  ferric uptake regulator family protein  31.65 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2593  ferric uptake regulator family protein  34.07 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000283641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>