More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1649 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1649  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 149 aa  311  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0556503  hitchhiker  0.00120732 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1293  ferric uptake regulator family protein  93.29 
 
 		 149 aa  298  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1460  ferric uptake regulator, Fur family  41.22 
 
 		 161 aa  134  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4545  ferric uptake regulator family protein  41.78 
 
 		 147 aa  124  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2073  ferric uptake regulator family protein  36.11 
 
 		 151 aa  90.1  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365477  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2024  ferric uptake regulator, Fur family  37.24 
 
 		 176 aa  89.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.523147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1892  Fur family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 141 aa  85.5  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3901  ferric uptake regulator family protein  34.9 
 
 		 168 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000831439  normal  0.164099 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  28.77 
 
 		 145 aa  84  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0593  ferric uptake regulator family protein  32.61 
 
 		 154 aa  83.6  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.211078  unclonable  0.00000627235 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  36.23 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0842  ferric uptake regulator, Fur family  31.85 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  34.03 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  31.58 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  38.24 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  32.85 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  30.82 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0603  ferric uptake regulator family protein  31.58 
 
 		 143 aa  80.1  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 143 aa  80.1  0.000000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  32.67 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  33.33 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  29.53 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  33.79 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3895  ferric uptake regulator family protein  31.43 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.845515 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  26.28 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  32.64 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2145  ferric-uptake regulator  38.3 
 
 		 164 aa  76.6  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0251  ferric uptake regulator, Fur family  36.76 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1147  ferric uptake regulator family protein  32.86 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1216  ferric uptake regulator, Fur family  28.67 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  27.27 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1084  ferric uptake regulator, Fur family  29.69 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.784641  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  31.33 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  29.37 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1194  ferric-uptake regulator  32.17 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  32.61 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  32.61 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1123  ferric uptake regulator family protein  34.07 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.488583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  35.88 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  29.66 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2612  ferric uptake regulator, Fur family  28.47 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4742  ferric uptake regulator, Fur family  27.52 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00840  zinc uptake transcriptional regulator, Fur family  33.33 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0229  ferric uptake regulator family protein  35.66 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2152  ferric uptake regulator  35.04 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4185  ferric uptake regulator, Fur family  26.76 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1690  ferric uptake regulator  33.57 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000286155  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0928  FUR family manganese uptake regulator  30.94 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  30.71 
 
 		 156 aa  72  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  28.87 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1206  ferric uptake regulator  34.07 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  34.59 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1577  ferric uptake regulator, Fur family  28.36 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  35.77 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2458  ferric uptake regulator  34.07 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3457  ferric uptake regulator  34.07 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0375  ferric uptake regulator  34.07 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  31.25 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3420  ferric uptake regulator  34.07 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133952  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2645  ferric uptake regulator  34.07 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1234  ferric uptake regulator  34.07 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3455  ferric uptake regulator  34.07 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114286  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  34.33 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  34.33 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3385  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.514247  hitchhiker  0.0000888993 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0515  ferric uptake regulator, Fur family  30.34 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1140  ferric uptake regulator family protein  32.39 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 144 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  29.08 
 
 		 144 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  29.08 
 
 		 144 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 144 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  29.93 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  29.08 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  29.08 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  29.93 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  29.08 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0616  ferric uptake regulator family protein  32.59 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.740565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  29.08 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  29.93 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  34.59 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0603  ferric uptake regulator family protein  31.65 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  28.67 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0571  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2976  ferric uptake regulator family protein  35.29 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0166  ferric uptake regulator family protein  32.59 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  34.93 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0833  ferric uptake regulator  33.08 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0649  ferric uptake regulator family protein  32.59 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0894  ferric uptake regulator family protein  33.58 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572753 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2737  ferric uptake regulator family protein  32.59 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348547  normal  0.830954 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  29.08 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  33.58 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1575  ferric uptake regulator  30.15 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  34.33 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  34.81 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1593  ferric uptake regulator  34.33 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000083166  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  34.93 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2593  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000283641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>