More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3901 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3901  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 168 aa  338  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000831439  normal  0.164099 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2024  ferric uptake regulator, Fur family  61.45 
 
 		 176 aa  185  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.523147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2073  ferric uptake regulator family protein  38.51 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365477  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1460  ferric uptake regulator, Fur family  36.88 
 
 		 161 aa  100  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4545  ferric uptake regulator family protein  37.23 
 
 		 147 aa  87  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1293  ferric uptake regulator family protein  35.62 
 
 		 149 aa  86.3  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1649  ferric uptake regulator family protein  34.9 
 
 		 149 aa  85.1  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0556503  hitchhiker  0.00120732 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1934  zinc uptake regulator  37.4 
 
 		 135 aa  80.1  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395595  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3370  ferric uptake regulator, Fur family  37.4 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.073099  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 143 aa  77.4  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  31.78 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1577  ferric uptake regulator, Fur family  31.2 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3447  zinc uptake regulator  34.68 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0819749  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3510  zinc uptake regulator  34.68 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3458  zinc uptake regulator  34.68 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.455544  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0603  ferric uptake regulator family protein  31.78 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1040  transcriptional regulator, Fur family  29.92 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4538  ferric uptake regulator family protein  34.15 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148082  normal  0.344615 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2717  ferric uptake regulator family protein  32.03 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1892  Fur family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  32.09 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3820  ferric uptake regulator family protein  33.87 
 
 		 131 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.396621  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11800  zinc uptake regulator, Fur family  31.45 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00894406  normal  0.765019 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4742  ferric uptake regulator, Fur family  29.86 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  31.2 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0885  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  34.65 
 
 		 142 aa  67.4  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  32.28 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1599  ferric uptake regulator, Fur family  33.61 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  32.03 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  33.08 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2171  ferric uptake regulator, Fur family  34.38 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00854605  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2638  zinc uptake regulator  34.09 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2373  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000416204 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2612  ferric uptake regulator, Fur family  30.5 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  31.5 
 
 		 146 aa  63.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3007  ferric uptake regulator, Fur family  29.27 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0856  zinc uptake regulator  31.2 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.763265  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2442  ferric uptake regulator, Fur family  29.84 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168746 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07800  zinc uptake regulator, Fur family  31.65 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2058  ferric uptake regulator, Fur family  29.84 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1536  ferric uptake regulator, Fur family  30.89 
 
 		 130 aa  62  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.451133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7037  ferric uptake regulator, Fur family  33.06 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  31.01 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  31.45 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  31.78 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7263  ferric uptake regulator family protein  29.69 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  31.01 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  29.23 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17110  zinc uptake regulator, Fur family  30.83 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2340  ferric uptake regulator family protein  28.8 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  30.83 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2661  ferric uptake regulator family protein  30.88 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.946961  normal  0.0414019 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0842  ferric uptake regulator, Fur family  29.32 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3601  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0894  ferric uptake regulator family protein  29.27 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572753 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2987  FUR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  27.41 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3535  ferric uptake regulator, Fur family  32.61 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0519  ferric uptake regulator family protein  35.07 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.639512  normal  0.494415 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1216  ferric uptake regulator, Fur family  32.37 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  23.33 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3230  ferric uptake regulator, Fur family  30.08 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0854036  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0066  ferric uptake regulator, Fur family  30.08 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  28.46 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  25.58 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1469  ferric uptake regulator, Fur family  31.71 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0185274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  26.72 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  23.58 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  25.58 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  26.72 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3895  ferric uptake regulator family protein  27.87 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.845515 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  28.46 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1261  ferric uptake regulator, Fur family  32.54 
 
 		 141 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  26.72 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  28.91 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  27.27 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  32.09 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13650  zinc uptake regulator, Fur family  32.2 
 
 		 136 aa  57  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.357837 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3397  zinc uptake transcriptional repressor  27.7 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4610  ferric uptake regulator family protein  26.52 
 
 		 181 aa  57  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4185  ferric uptake regulator, Fur family  25.93 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  27.27 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  27.27 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  28.91 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  26.72 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  26.72 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1772  ferric uptake regulator, Fur family  29.27 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  27.27 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  29.13 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  29.13 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0817  ferric uptake regulator family protein  27.34 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  28.91 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2294  ferric uptake regulator, Fur family  29.51 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0593  ferric uptake regulator family protein  26.83 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.211078  unclonable  0.00000627235 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1211  ferric uptake regulation protein  25.19 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0179394  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  25.58 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  27.56 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  29.13 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1593  ferric uptake regulator  26.72 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000083166  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0229  ferric uptake regulator family protein  29.01 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>