More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2029 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2029  FUR family transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  302  9.000000000000001e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1746  FUR family transcriptional regulator  99.33 
 
 		 150 aa  301  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  59.86 
 
 		 147 aa  184  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  59.57 
 
 		 146 aa  174  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  56.85 
 
 		 146 aa  170  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  49.29 
 
 		 149 aa  150  5e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  47.86 
 
 		 149 aa  148  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  47.86 
 
 		 149 aa  148  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  51.47 
 
 		 154 aa  146  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  47.86 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1036  transcriptional regulator, Fur family  47.14 
 
 		 151 aa  144  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0163253  normal  0.210334 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4201  transcriptional regulator, Fur family  47.14 
 
 		 151 aa  144  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0217905  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3922  ferric uptake regulator family protein  47.14 
 
 		 151 aa  144  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000572819  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4160  FUR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 151 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4001  FUR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 151 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000832394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3832  FUR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 151 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3848  FUR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 151 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000844204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4115  transcriptional regulator, Fur family  47.14 
 
 		 151 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5116299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4313  FUR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 151 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4224  transcriptional regulator, Fur family  47.14 
 
 		 151 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00546613  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  47.41 
 
 		 144 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  45.19 
 
 		 145 aa  140  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1138  ferric uptake regulator, Fur family  47.92 
 
 		 143 aa  140  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716078  normal  0.825565 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  47.14 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  50 
 
 		 159 aa  137  7e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2259  ferric uptake regulator, Fur family  48.94 
 
 		 154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1147  ferric uptake regulator family protein  46.04 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  37.86 
 
 		 152 aa  121  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  37.86 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1006  ferric uptake regulator, Fur family  46.72 
 
 		 152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000144475 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  45.86 
 
 		 138 aa  115  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1411  ferric uptake regulator family protein  43.7 
 
 		 150 aa  114  6e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0660  Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins  45.65 
 
 		 146 aa  113  6.9999999999999995e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2867  ferric uptake regulator, Fur family  47.83 
 
 		 149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000960204  decreased coverage  0.0000000000000181287 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1415  ferric uptake regulator family protein  38.19 
 
 		 140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000163802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  40.46 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1315  transcriptional regulator, TrmB  37.84 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07451  ferric uptake regulator family protein  41.3 
 
 		 148 aa  107  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0979772 
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 143 aa  107  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4185  ferric uptake regulator, Fur family  37.78 
 
 		 139 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  35.21 
 
 		 143 aa  106  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  40.15 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  36.62 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0529  ferric uptake regulator, Fur family  40 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000605392  normal  0.102669 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  38.13 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0734  ferric uptake regulator family protein  38.03 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000194517  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0020  FUR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 142 aa  103  6e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147149  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13391  hypothetical protein  37.5 
 
 		 186 aa  103  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_19  transcriptional regulator, Fur family  38.41 
 
 		 142 aa  103  6e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.677591  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0637  ferric uptake regulator family protein  35.57 
 
 		 150 aa  103  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.835222  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  38.81 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1789  ferric uptake regulator, Fur family  36.43 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.372499  normal  0.929582 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06931  ferric uptake regulator family protein  35.57 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.247961  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2058  ferric uptake regulator, Fur family  36.24 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3404  ferric uptake regulator family protein  38.3 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.092554  normal  0.327657 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  37.23 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1241  ferric uptake regulator, Fur family  36.96 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00903138 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0603  ferric uptake regulator family protein  35 
 
 		 143 aa  101  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06641  ferric uptake regulator family protein  35.57 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  35.97 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0396  ferric uptake regulator, Fur family  33.57 
 
 		 175 aa  100  5e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  36.84 
 
 		 143 aa  100  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0940  ferric uptake regulator, Fur family  31.69 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  36.09 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  36.3 
 
 		 166 aa  98.6  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  33.77 
 
 		 157 aa  98.6  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  37.12 
 
 		 146 aa  98.2  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2612  ferric uptake regulator, Fur family  33.81 
 
 		 146 aa  98.6  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  33.77 
 
 		 157 aa  98.6  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  35.07 
 
 		 134 aa  98.6  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  35.81 
 
 		 154 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1722  ferric uptake regulator family protein  35.46 
 
 		 146 aa  98.2  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.907916 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  33.77 
 
 		 157 aa  98.6  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0918  ferric uptake regulator  34.06 
 
 		 137 aa  97.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  34.78 
 
 		 143 aa  98.2  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0987  ferric uptake regulator family protein  35.71 
 
 		 147 aa  97.8  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00388915 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  40 
 
 		 147 aa  97.4  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1165  ferric uptake regulator family protein  34.53 
 
 		 151 aa  97.4  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0381194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1775  ferric uptake regulator family protein  34.67 
 
 		 151 aa  97.4  6e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.103697  normal  0.0302993 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0833  ferric uptake regulator  37.96 
 
 		 147 aa  97.1  8e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  36.09 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  31.11 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6836  ferric uptake regulator, Fur family  34.29 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  34.78 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  31.11 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1140  ferric uptake regulator family protein  36.62 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07031  ferric uptake regulator family protein  33.56 
 
 		 150 aa  95.9  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0821588  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  34.59 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0061  FUR family nickel uptake regulator  34.78 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  35.14 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  35.97 
 
 		 158 aa  95.5  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2050  ferric uptake regulator, Fur family  40.6 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  35.82 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1958  ferric uptake regulator family protein  37.23 
 
 		 170 aa  95.9  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0491085  hitchhiker  0.00899541 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  34.03 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1147  FUR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 135 aa  95.1  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0473  Fur family ferric uptake regulator  36.23 
 
 		 136 aa  94.7  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1806  ferric uptake regulator family protein  37.21 
 
 		 141 aa  94.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.696064  normal  0.171205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>