More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0184 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0184  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 
143 aa  295  1e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.567959  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0194  ferric uptake regulator, Fur family  61.03 
 
 
152 aa  174  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.207086  normal  0.440649 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2477  ferric uptake regulator family protein  53.96 
 
 
143 aa  165  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0153326  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2318  ferric uptake regulator, Fur family  51.11 
 
 
152 aa  144  5e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.956105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2987  FUR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
139 aa  105  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3535  ferric uptake regulator, Fur family  35.82 
 
 
144 aa  99.4  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3601  ferric uptake regulator, Fur family  35.82 
 
 
144 aa  99  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0045  ferric uptake regulator family protein  31.85 
 
 
142 aa  92  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0170  ferric uptake regulator, Fur family  30.94 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4185  ferric uptake regulator, Fur family  30.22 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421488  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  35 
 
 
154 aa  80.1  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  31.43 
 
 
159 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  28.67 
 
 
146 aa  80.1  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  33.81 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2401  ferric uptake regulator, Fur family  27.94 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1905  ferric uptake regulator family protein  36.3 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  30.15 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3007  ferric uptake regulator family protein  31.06 
 
 
137 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.830794  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  28.37 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4413  transcriptional regulator, Fur family  30.37 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000236646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4359  FUR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.291339  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4181  FUR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4019  FUR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.642016  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4029  FUR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4503  FUR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.606254  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4301  transcriptional regulator, Fur family  30.37 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.08025e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0839  transcriptional regulator, Fur family  30.3 
 
 
128 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.442755  hitchhiker  0.000379655 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4397  transcriptional regulator, Fur family  30.37 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.108592  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  27.74 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  29.17 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0279  ferric uptake regulator family protein  27.27 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.666463  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1577  ferric uptake regulator, Fur family  29.55 
 
 
147 aa  70.1  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  30 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2442  ferric uptake regulator, Fur family  32.56 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000168746 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1140  ferric uptake regulator family protein  33.81 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4132  ferric uptake regulator family protein  29.55 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0603  ferric uptake regulator family protein  27.66 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2859  ferric-uptake regulator  33.33 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.141734 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1388  ferric uptake regulator, Fur family  30.83 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00327608  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1216  ferric uptake regulator, Fur family  29.29 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  25 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2612  ferric uptake regulator, Fur family  29.41 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2340  ferric uptake regulator family protein  31.5 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  31.69 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3895  ferric uptake regulator family protein  28.78 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.845515 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0856  zinc uptake regulator  32.54 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.763265  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  26.72 
 
 
145 aa  67  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0684  ferric uptake regulator family protein  31.76 
 
 
142 aa  67  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564127  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  26.95 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1460  ferric uptake regulator, Fur family  30 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0593  ferric uptake regulator family protein  29.85 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.211078  unclonable  0.00000627235 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0738  ferric uptake regulator family protein  31.76 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376687  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1373  ferric uptake regulator, Fur family  27.13 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000536701  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  30.47 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  28.87 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0987  ferric uptake regulator family protein  30.22 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00388915 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3447  zinc uptake regulator  31.25 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0819749  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0660  Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins  29.1 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3230  ferric uptake regulator, Fur family  31.78 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0854036  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  28.87 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3510  zinc uptake regulator  31.25 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11469  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3458  zinc uptake regulator  31.25 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.455544  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1612  ferric uptake regulator family protein  24.82 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.339502  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  28.68 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1646  ferric-uptake regulator  24.82 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  28.95 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2867  ferric uptake regulator, Fur family  29.37 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000960204  decreased coverage  0.0000000000000181287 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  28.47 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  28.95 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1536  ferric uptake regulator, Fur family  32.82 
 
 
130 aa  64.7  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.451133  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2366  ferric uptake regulator, Fur family  30.16 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.437919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0515  ferric uptake regulator, Fur family  24.82 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4234  ferric uptake regulator family protein  31.88 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0343972  normal  0.519768 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3820  ferric uptake regulator family protein  30.77 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.396621  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0284  ferric uptake regulator family protein  26.19 
 
 
128 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0246387 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4134  ferric uptake regulator, Fur family  32.26 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4174  ferric uptake regulator, Fur family  32.26 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  29.93 
 
 
150 aa  63.5  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  29.46 
 
 
130 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  23.19 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1120  FUR family transcriptional regulator  25.19 
 
 
139 aa  63.5  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.224553  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4454  ferric uptake regulator, Fur family  36.5 
 
 
147 aa  62.8  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  26.67 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0066  ferric uptake regulator, Fur family  31.2 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3370  ferric uptake regulator, Fur family  31.78 
 
 
167 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.073099  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  28.89 
 
 
157 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4224  transcriptional regulator, Fur family  30.5 
 
 
151 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00546613  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4160  FUR family transcriptional regulator  30.5 
 
 
151 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4001  FUR family transcriptional regulator  30.5 
 
 
151 aa  62  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000832394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3832  FUR family transcriptional regulator  30.5 
 
 
151 aa  62  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3848  FUR family transcriptional regulator  30.5 
 
 
151 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000844204  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  24.82 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4313  FUR family transcriptional regulator  30.5 
 
 
151 aa  62  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  29.8 
 
 
152 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1147  ferric uptake regulator family protein  33.8 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1481  ferric uptake regulator family protein  33.58 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.268678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>