More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2318 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2318  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 152 aa  311  1.9999999999999998e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.956105  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2477  ferric uptake regulator family protein  56.52 
 
 		 143 aa  153  7e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0153326  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0184  ferric uptake regulator, Fur family  51.11 
 
 		 143 aa  144  6e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.567959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0194  ferric uptake regulator, Fur family  49.29 
 
 		 152 aa  120  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.207086  normal  0.440649 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2987  FUR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0045  ferric uptake regulator family protein  35.82 
 
 		 142 aa  89.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3535  ferric uptake regulator, Fur family  32.06 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3601  ferric uptake regulator, Fur family  32.06 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  30.99 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  30.07 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3895  ferric uptake regulator family protein  30.88 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.845515 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0637  ferric uptake regulator family protein  30.15 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.835222  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  35.11 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06641  ferric uptake regulator family protein  30.88 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0593  ferric uptake regulator family protein  31.62 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.211078  unclonable  0.00000627235 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0603  ferric uptake regulator family protein  35.11 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06931  ferric uptake regulator family protein  30.15 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.247961  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07031  ferric uptake regulator family protein  30.15 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0821588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4185  ferric uptake regulator, Fur family  25.36 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421488  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1420  FUR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0522352  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0931  ferric uptake regulator family protein  27.54 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  31.91 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0170  ferric uptake regulator, Fur family  27.01 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  31.91 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  28.08 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  25.69 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0603  ferric uptake regulator family protein  32.12 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1230  FUR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0757057  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6009  ferric uptake regulator family protein  31.69 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.964976 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1216  ferric uptake regulator, Fur family  28.57 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2859  ferric-uptake regulator  30.08 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.141734 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1140  ferric uptake regulator family protein  29.93 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  35.07 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  22.54 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1373  ferric uptake regulator, Fur family  26.67 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000536701  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4555  ferric uptake regulator family protein  30.28 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  26.62 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  26.62 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0247  ferric uptake transcriptional (FUR)-like transcription regulator protein  29.79 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0515  ferric uptake regulator, Fur family  25.52 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  29.63 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  29.53 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3007  ferric uptake regulator, Fur family  25.56 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0406  ferric uptake regulator, Fur family  29.5 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1892  Fur family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  25.18 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0990  ferric uptake regulator family protein  29.13 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  28.97 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3924  ferric uptake regulator family protein  30.22 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1120  FUR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.224553  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1930  ferric uptake regulator, Fur family  30.17 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3272  ferric uptake regulator, Fur family  30.88 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.710175  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2837  ferric uptake regulator family protein  34.65 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2050  ferric uptake regulator, Fur family  35 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07451  ferric uptake regulator family protein  28.36 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0979772 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  29.33 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  24.05 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2189  ferric uptake regulator, Fur family  24.26 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000532241  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5530  ferric uptake regulator family protein  31.85 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1123  ferric uptake regulator family protein  30 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.488583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1612  ferric uptake regulator family protein  23.88 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.339502  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4234  ferric uptake regulator family protein  30.99 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0343972  normal  0.519768 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0045  ferric uptake regulator, Fur family  25.98 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.4921e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  26.06 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1646  ferric-uptake regulator  23.88 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2747  ferric uptake transcriptional repressor transcription regulator protein  33.66 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0367  FUR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.596718  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2512  ferric uptake regulator family protein  27.97 
 
 		 201 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.450617  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0344  FUR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.470674  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0279  ferric uptake regulator family protein  24.46 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.666463  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2976  ferric uptake regulator family protein  33.66 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0939  ferric uptake regulator family protein  28.08 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1296  FUR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1481  ferric uptake regulator family protein  29.93 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.268678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0122  ferric uptake regulation protein  27.69 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00816522  normal  0.910281 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2737  ferric uptake regulator family protein  29.71 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348547  normal  0.830954 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  31.82 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0616  ferric uptake regulator family protein  29.71 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.740565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0570  ferric uptake regulator family protein  29.71 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0166  ferric uptake regulator family protein  29.71 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1211  ferric uptake regulation protein  30.56 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0179394  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0544  ferric uptake regulator family protein  29.71 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0596927  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0649  ferric uptake regulator family protein  29.71 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2095  ferric uptake regulator family protein  30.19 
 
 		 166 aa  51.6  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.509153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1279  transcriptional regulator, Fur family  24.82 
 
 		 141 aa  52.4  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000471651  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  22.45 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  25.83 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4224  transcriptional regulator, Fur family  28.97 
 
 		 151 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00546613  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4160  FUR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 151 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4001  FUR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 151 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000832394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3832  FUR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 151 aa  51.2  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3848  FUR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 151 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000844204  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3531  ferric uptake regulator, Fur family  25.19 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3924  ferric uptake regulator family protein  28.39 
 
 		 182 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.567476 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4115  transcriptional regulator, Fur family  28.97 
 
 		 151 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5116299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  29.32 
 
 		 130 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3735  ferric uptake regulator family protein  30.43 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345676 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>