201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2512 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2512  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 201 aa  414  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.450617  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1233  ferric uptake regulator family protein  42.42 
 
 		 147 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3379  ferric uptake regulator, Fur family  36.6 
 
 		 175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1467  transcriptional regulator, Fur family  41.04 
 
 		 158 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1183  ferric uptake regulator, Fur family  41.04 
 
 		 158 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.837957 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3702  ferric uptake regulator, Fur family  35.95 
 
 		 175 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0164  putative transcription regulator protein  39.44 
 
 		 172 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0128  ferric uptake regulator family protein  38.3 
 
 		 169 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1335 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0048  putative transcription regulator protein  33.33 
 
 		 172 aa  99.4  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3496  ferric uptake regulator, Fur family  38.06 
 
 		 152 aa  97.1  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1930  ferric uptake regulator, Fur family  37.1 
 
 		 144 aa  85.5  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0931  ferric uptake regulator family protein  28.68 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0533  ferric uptake regulator, Fur family  34.81 
 
 		 141 aa  74.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3018  ferric uptake regulator, Fur family  30.71 
 
 		 145 aa  72  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0481144  normal  0.294593 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1604  putative transcription regulator protein  31.62 
 
 		 144 aa  72  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000436344  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5541  ferric uptake regulator, Fur family  34.13 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.713771 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0025  ferric uptake regulator family protein  30.71 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344249  normal  0.157034 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0747  ferric-uptake regulator  37.1 
 
 		 152 aa  67.4  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4566  Fur family transcriptional regulator protein  32.54 
 
 		 136 aa  67.8  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2685  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0992523 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3523  zinc uptake transcriptional repressor  30.94 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1728  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.597021 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2211  ferric uptake regulator family protein  30.6 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.395667  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0734  zinc uptake transcriptional repressor  28.78 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0516  zinc uptake transcriptional repressor  28.78 
 
 		 171 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0488  zinc uptake regulation protein  27.66 
 
 		 147 aa  60.8  0.00000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.695603  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7635  ferric uptake regulator family protein  32.87 
 
 		 163 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3397  zinc uptake transcriptional repressor  29.41 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4457  zinc uptake transcriptional repressor  29.29 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11678  putative transcription regulator  30.16 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3859  zinc uptake transcriptional repressor  29.5 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0132  ferric-uptake regulator  27.05 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3769  zinc uptake transcriptional repressor  29.5 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.352583  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1301  zinc uptake transcriptional repressor  29.5 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3640  hypothetical protein  31.69 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1882  ferric uptake regulator family protein  32.37 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161499  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4551  zinc uptake transcriptional repressor  29.79 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03918  DNA-binding transcriptional repressor, Zn(II)-binding  29.79 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3947  ferric uptake regulator, Fur family  29.79 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0116  ferric uptake regulator, Fur family  32 
 
 		 142 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.241411 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03878  hypothetical protein  29.79 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4508  zinc uptake transcriptional repressor  29.79 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0489  ferric uptake regulator family protein  28.37 
 
 		 167 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.574052  normal  0.122535 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4286  zinc uptake transcriptional repressor  29.79 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4599  zinc uptake transcriptional repressor  29.79 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  25.71 
 
 		 166 aa  57.8  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3982  zinc uptake transcriptional repressor  29.79 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.224982 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0621  putative ferric uptake regulator, Fur family  26.81 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.776664  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5527  zinc uptake transcriptional repressor  29.08 
 
 		 171 aa  57  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.508187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4498  zinc uptake transcriptional repressor  29.08 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4584  zinc uptake transcriptional repressor  29.08 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002343  zinc uptake regulation protein ZUR  35.09 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4583  zinc uptake transcriptional repressor  29.08 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4635  zinc uptake transcriptional repressor  29.08 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4433  zinc uptake transcriptional repressor  29.08 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000291933 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0493  ferric-uptake regulator  30.43 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.592412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1145  ferric uptake regulator family protein  28.77 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00010  zinc uptake regulation protein  36.36 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1776  ferric uptake regulator family protein  32.59 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000166629 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0250  zinc uptake transcriptional repressor  26.22 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.463823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0618  ferric uptake regulator family protein  31.39 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4894  ferric uptake regulator, Fur family  32.84 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.164543 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3179  ferric uptake regulator, Fur family protein  29.5 
 
 		 149 aa  54.3  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3601  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 144 aa  53.9  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0975  putative ferric uptake regulator, Fur family  29.93 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  30.94 
 
 		 150 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1210  ferric uptake regulator, Fur family  30.87 
 
 		 163 aa  52.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.427545  decreased coverage  0.00910774 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5385  ferric uptake regulator family protein  30.5 
 
 		 173 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3535  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 144 aa  53.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04819  transcriptional regulator, Fur family  31.03 
 
 		 168 aa  53.1  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2318  ferric uptake regulator, Fur family  27.97 
 
 		 152 aa  52.4  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.956105  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3951  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 		 165 aa  52.4  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.781008  normal  0.0311151 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5586  ferric uptake regulator, Fur family  30.22 
 
 		 176 aa  52  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0827067  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1195  ferric uptake regulator family protein  25.76 
 
 		 136 aa  52  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.4932  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3152  ABC-type uncharacterized transport systems ATPase components-like protein  32.35 
 
 		 163 aa  51.6  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.459101 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13391  hypothetical protein  25.75 
 
 		 186 aa  51.2  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3128  ferric uptake regulator family protein  30.99 
 
 		 161 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4139  ferric uptake regulator family protein  30.43 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0983423 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2788  putative zinc uptake regulation protein  34.09 
 
 		 155 aa  51.2  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  32.33 
 
 		 146 aa  50.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0302  hypothetical protein  25.53 
 
 		 148 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0285  hypothetical protein  25.53 
 
 		 148 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  30.22 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0387  zinc uptake regulation protein  27.34 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  30.22 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  33.09 
 
 		 138 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1959  putative ferric uptake regulator, Fur family  25.34 
 
 		 161 aa  50.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1172  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  28.87 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.842565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  30.22 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  30.94 
 
 		 143 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0518  ferric uptake regulator, Fur family  29.93 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 144 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  30.22 
 
 		 144 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  30.22 
 
 		 144 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2798  Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins  27.46 
 
 		 146 aa  49.7  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.1309500000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 144 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  30.22 
 
 		 142 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3010  ferric uptake regulator family protein  26.98 
 
 		 159 aa  49.7  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.184065 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  30.22 
 
 		 142 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>