More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1882 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1882  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 
149 aa  300  6.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161499  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1195  ferric uptake regulator family protein  52.9 
 
 
162 aa  143  8.000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal  0.113542 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1729  ferric uptake regulator family protein  51.45 
 
 
164 aa  142  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2424  ferric-uptake regulator  50 
 
 
163 aa  140  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.688654  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3054  ferric uptake regulator, Fur family  49.26 
 
 
157 aa  140  7e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5109  ferric uptake regulator family protein  48.61 
 
 
161 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.143994 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2432  ferric uptake regulator, Fur family  49.66 
 
 
156 aa  137  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00932127  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3523  zinc uptake transcriptional repressor  46.85 
 
 
169 aa  135  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3397  zinc uptake transcriptional repressor  46.62 
 
 
169 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0136  ferric uptake regulator family protein  46.53 
 
 
161 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4496  ferric uptake regulator family protein  49.64 
 
 
161 aa  133  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0134  ferric uptake regulator family protein  46.53 
 
 
161 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74995  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00840  zinc uptake transcriptional regulator, Fur family  49.29 
 
 
161 aa  133  9e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4139  ferric uptake regulator family protein  48.25 
 
 
164 aa  132  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0983423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3179  ferric uptake regulator, Fur family protein  44.76 
 
 
149 aa  132  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0734  zinc uptake transcriptional repressor  47.55 
 
 
171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0119  FUR family transcriptional regulator  48.51 
 
 
135 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.723813  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0060  zinc uptake regulation protein, putative  45.45 
 
 
160 aa  130  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1959  putative ferric uptake regulator, Fur family  45.95 
 
 
161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0516  zinc uptake transcriptional repressor  46.85 
 
 
171 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0387  zinc uptake regulation protein  45.19 
 
 
149 aa  128  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183946  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6300  transcriptional regulator np20  48.18 
 
 
167 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72560  transcriptional regulator np20  46.15 
 
 
167 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640017  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5267  zinc uptake regulation protein, putative  46.85 
 
 
160 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4457  zinc uptake transcriptional repressor  47.83 
 
 
170 aa  127  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0554  ferric uptake regulator, Fur family  46.43 
 
 
153 aa  126  8.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.028923  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0276  zinc uptake regulation protein, putative  46.15 
 
 
160 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0593  ferric uptake regulator family protein  47.1 
 
 
145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.687838  hitchhiker  0.00515693 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3152  ABC-type uncharacterized transport systems ATPase components-like protein  46.53 
 
 
163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.459101 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1301  zinc uptake transcriptional repressor  45.45 
 
 
172 aa  124  5e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3859  zinc uptake transcriptional repressor  45.45 
 
 
170 aa  124  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3769  zinc uptake transcriptional repressor  45.45 
 
 
170 aa  124  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.352583  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0766  ferric uptake regulator family protein  44.12 
 
 
160 aa  122  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.885762  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002343  zinc uptake regulation protein ZUR  43.17 
 
 
154 aa  122  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0412  zinc uptake regulation protein  42.76 
 
 
146 aa  122  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.338359  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3775  ferric uptake regulator family protein  46.32 
 
 
163 aa  122  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4894  ferric uptake regulator, Fur family  47.06 
 
 
190 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.164543 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1776  ferric uptake regulator family protein  46.72 
 
 
188 aa  121  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000166629 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0247  ferric uptake regulator family protein  43.28 
 
 
143 aa  121  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0292  ferric uptake regulator family protein  43.26 
 
 
174 aa  121  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0252498  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0059  zinc uptake regulation protein, putative  40.14 
 
 
162 aa  120  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00010  zinc uptake regulation protein  43.17 
 
 
161 aa  120  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2788  putative zinc uptake regulation protein  40.97 
 
 
155 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0489  ferric uptake regulator family protein  45.71 
 
 
167 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.574052  normal  0.122535 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04819  transcriptional regulator, Fur family  45.83 
 
 
168 aa  117  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7635  ferric uptake regulator family protein  44.44 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1210  ferric uptake regulator, Fur family  44.44 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.427545  decreased coverage  0.00910774 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5586  ferric uptake regulator, Fur family  45.45 
 
 
176 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0827067  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0255  ferric uptake regulator family protein  50.41 
 
 
161 aa  114  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3569  Zinc-uptake regulator, Zur  48.82 
 
 
167 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5385  ferric uptake regulator family protein  45.14 
 
 
173 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0313  ferric uptake regulator family protein  41.91 
 
 
172 aa  113  7.999999999999999e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0871  FUR family transcriptional regulator  41.78 
 
 
154 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0627  FUR family transcriptional regulator  41.78 
 
 
154 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0075  FUR family transcriptional regulator  41.78 
 
 
154 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1951  ferric uptake regulator family protein  42.36 
 
 
169 aa  113  8.999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3615  ferric uptake regulator family protein  41.3 
 
 
156 aa  113  8.999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0123339 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2029  FUR family transcriptional regulator  42.36 
 
 
169 aa  113  8.999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0250  zinc uptake transcriptional repressor  42.03 
 
 
186 aa  113  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2322  transctiptional regulator, putative  43.38 
 
 
340 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.559268  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0329  transcriptional regulator, putative  41.78 
 
 
174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0816853  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1030  transcriptional regulator np20  41.78 
 
 
266 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468809  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4551  zinc uptake transcriptional repressor  43.48 
 
 
171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03918  DNA-binding transcriptional repressor, Zn(II)-binding  43.48 
 
 
171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3947  ferric uptake regulator, Fur family  43.48 
 
 
171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4508  zinc uptake transcriptional repressor  43.48 
 
 
171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0867  FUR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3252  ferric uptake regulator family protein  48.03 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0890854 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4286  zinc uptake transcriptional repressor  43.48 
 
 
171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2461  FUR family transcriptional regulator  41.78 
 
 
251 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0618  ferric uptake regulator family protein  42.36 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4599  zinc uptake transcriptional repressor  43.48 
 
 
171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3982  zinc uptake transcriptional repressor  43.48 
 
 
171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.224982 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03878  hypothetical protein  43.48 
 
 
171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5527  zinc uptake transcriptional repressor  42.75 
 
 
171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.508187  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4635  zinc uptake transcriptional repressor  42.03 
 
 
171 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0518  ferric uptake regulator, Fur family  42.66 
 
 
165 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4498  zinc uptake transcriptional repressor  42.03 
 
 
171 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0184  ferric uptake regulator family protein  40.13 
 
 
192 aa  110  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0654518  hitchhiker  0.00635481 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4583  zinc uptake transcriptional repressor  42.03 
 
 
171 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3354  ferric uptake regulator family protein  46.83 
 
 
197 aa  110  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000170522 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4584  zinc uptake transcriptional repressor  42.03 
 
 
171 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735671  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4433  zinc uptake transcriptional repressor  42.03 
 
 
171 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000291933 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0488  ferric uptake regulator family protein  44.12 
 
 
163 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00616714  hitchhiker  0.00143129 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0488  zinc uptake regulation protein  39.29 
 
 
147 aa  110  8.000000000000001e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.695603  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0302  hypothetical protein  40 
 
 
148 aa  110  9e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0285  hypothetical protein  40 
 
 
148 aa  110  9e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0691  transcriptional regulator, putative  41.1 
 
 
216 aa  110  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0718  ferric uptake regulator  42.86 
 
 
159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00407056  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0493  ferric-uptake regulator  40.97 
 
 
177 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.592412  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3128  ferric uptake regulator family protein  42.66 
 
 
161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289928  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0524  ferric uptake regulator family protein  43.48 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.912553  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3248  transcriptional regulator, TrmB  46.4 
 
 
164 aa  107  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0836778  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2647  ferric uptake regulator family protein  41.3 
 
 
153 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2515  ferric uptake regulator family protein  41.3 
 
 
218 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2033  FUR family transcriptional regulator  39.33 
 
 
171 aa  106  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.728485  normal  0.0108698 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1911  ferric uptake regulator family protein  45.21 
 
 
177 aa  106  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0698  ferric uptake regulator family protein  42.03 
 
 
186 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.470229 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0319  zinc uptake regulator ZUR  40.29 
 
 
162 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2623  ferric uptake regulator family protein  40.58 
 
 
153 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195295  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>