170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0621 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0621  putative ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 
155 aa  316  6e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.776664  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0025  ferric uptake regulator family protein  35.71 
 
 
149 aa  87.8  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344249  normal  0.157034 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0116  ferric uptake regulator, Fur family  39.39 
 
 
142 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.241411 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0164  putative transcription regulator protein  33.77 
 
 
172 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2211  ferric uptake regulator family protein  35.56 
 
 
150 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.395667  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0128  ferric uptake regulator family protein  31.16 
 
 
169 aa  79  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.1335 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3379  ferric uptake regulator, Fur family  34.04 
 
 
175 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3702  ferric uptake regulator, Fur family  34.04 
 
 
175 aa  73.9  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0048  putative transcription regulator protein  34.03 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1728  ferric uptake regulator family protein  35.16 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.597021 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3496  ferric uptake regulator, Fur family  31.58 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1467  transcriptional regulator, Fur family  28.87 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1183  ferric uptake regulator, Fur family  28.87 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.837957 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3018  ferric uptake regulator, Fur family  33.08 
 
 
145 aa  60.8  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0481144  normal  0.294593 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  30 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0515  ferric uptake regulator, Fur family  30.08 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0208  ferric uptake regulator family protein  32.8 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  26.76 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2512  ferric uptake regulator family protein  26.81 
 
 
201 aa  57.4  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.450617  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0734  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 
155 aa  57  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000194517  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0747  ferric-uptake regulator  28.47 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3240  ferric uptake regulator family protein  31.06 
 
 
148 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000230922  hitchhiker  0.00191408 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1233  ferric uptake regulator family protein  27.61 
 
 
147 aa  55.1  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1604  putative transcription regulator protein  27.54 
 
 
144 aa  54.7  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000436344  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0945  ferric uptake regulator, Fur family  24.24 
 
 
134 aa  53.5  0.0000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  28.87 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  28.57 
 
 
146 aa  52  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2725  ferric uptake regulator, Fur family  32.14 
 
 
152 aa  52.4  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1411  ferric uptake regulator family protein  28.46 
 
 
150 aa  52  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  25.69 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13391  hypothetical protein  26.12 
 
 
186 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  25.71 
 
 
148 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  25.71 
 
 
148 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3007  ferric uptake regulator, Fur family  23.66 
 
 
143 aa  50.8  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1892  Fur family transcriptional regulator  27.66 
 
 
141 aa  50.4  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  29.63 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3209  ferric uptake regulator family protein  29.08 
 
 
147 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.829925  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1241  ferric uptake regulator, Fur family  28.68 
 
 
170 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00903138 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1577  ferric uptake regulator, Fur family  26.72 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1930  ferric uptake regulator, Fur family  25.55 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0077  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  28.99 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3640  hypothetical protein  30.66 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  25.4 
 
 
134 aa  49.7  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3503  ferric uptake regulator family protein  28.46 
 
 
166 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.248398 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1143  ferric uptake regulator, Fur family  28.37 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000124537  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3452  ferric uptake regulator family protein  29.37 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604214  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07451  ferric uptake regulator family protein  30.83 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0979772 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1373  ferric uptake regulator, Fur family  28.68 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000536701  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  23.57 
 
 
150 aa  48.5  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0132  ferric-uptake regulator  25.81 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5385  ferric uptake regulator family protein  29.68 
 
 
173 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  25.19 
 
 
158 aa  47.8  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  25.9 
 
 
150 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3251  ferric uptake regulator family protein  27.08 
 
 
158 aa  48.1  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  27.7 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  31.91 
 
 
152 aa  48.1  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36340  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  27.7 
 
 
151 aa  47.8  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1300  ferric uptake regulator family protein  27.78 
 
 
151 aa  47.8  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0844  ferric uptake regulator, Fur family  25.35 
 
 
150 aa  47.4  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126283  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3951  ferric uptake regulator family protein  28.39 
 
 
165 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.781008  normal  0.0311151 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3239  ferric uptake regulator, Fur family  28.29 
 
 
173 aa  47.4  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2612  ferric uptake regulator, Fur family  28.37 
 
 
146 aa  47  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4160  FUR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4001  FUR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000832394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3832  FUR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3848  FUR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000844204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4313  FUR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4071  ferric uptake regulator, Fur family  26.47 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000323892  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4224  transcriptional regulator, Fur family  30.43 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00546613  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4201  transcriptional regulator, Fur family  31.2 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0217905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1036  transcriptional regulator, Fur family  31.2 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0163253  normal  0.210334 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4115  transcriptional regulator, Fur family  30.43 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5116299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2294  ferric uptake regulator, Fur family  29.37 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  27.66 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  27.66 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0822  ferric uptake regulator family protein  28.07 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000300093  normal  0.0104511 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1140  ferric uptake regulator family protein  30.66 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  27.66 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1102  ferric uptake regulator, Fur family  28.37 
 
 
140 aa  46.2  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.387055  normal  0.912899 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25080  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  31.01 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0884067  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1959  putative ferric uptake regulator, Fur family  30.22 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  27.66 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0533  ferric uptake regulator, Fur family  30.22 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1472  ferric uptake regulator, Fur family  34.88 
 
 
131 aa  46.2  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000290418  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0247  ferric uptake transcriptional (FUR)-like transcription regulator protein  32.12 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0391  FUR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
159 aa  45.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  27.66 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  27.66 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  26.87 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0164  ferric uptake regulator, Fur family  24.77 
 
 
112 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112785  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  31.91 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  31.85 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4742  ferric uptake regulator, Fur family  27.62 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  24.26 
 
 
159 aa  45.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  27.66 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  31.85 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0488  ferric uptake regulator family protein  27.61 
 
 
163 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00616714  hitchhiker  0.00143129 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1573  ferric uptake regulator, Fur family  29.67 
 
 
171 aa  44.7  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00719756 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>