212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1728 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1728  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 164 aa  332  2e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.597021 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0116  ferric uptake regulator, Fur family  54.55 
 
 		 142 aa  137  6e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.241411 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2211  ferric uptake regulator family protein  38.81 
 
 		 150 aa  90.5  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.395667  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0025  ferric uptake regulator family protein  37.12 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344249  normal  0.157034 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0128  ferric uptake regulator family protein  35.14 
 
 		 169 aa  80.9  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1335 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1233  ferric uptake regulator family protein  33.09 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1467  transcriptional regulator, Fur family  32.86 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1183  ferric uptake regulator, Fur family  32.86 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.837957 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0164  putative transcription regulator protein  34.62 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0621  putative ferric uptake regulator, Fur family  33.11 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.776664  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3496  ferric uptake regulator, Fur family  36.3 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2512  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.450617  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3379  ferric uptake regulator, Fur family  31.65 
 
 		 175 aa  63.9  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2685  ferric uptake regulator family protein  34.31 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0992523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3702  ferric uptake regulator, Fur family  31.65 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0048  putative transcription regulator protein  31.43 
 
 		 172 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3018  ferric uptake regulator, Fur family  32.09 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0481144  normal  0.294593 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0284  ferric uptake regulator family protein  31.97 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0246387 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0208  ferric uptake regulator family protein  27.21 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0734  ferric uptake regulator family protein  30.56 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000194517  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0747  ferric-uptake regulator  29.29 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1195  ferric uptake regulator family protein  27.01 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.4932  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0466  ferric uptake regulator family protein  29.71 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000190383  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2058  ferric uptake regulator, Fur family  34.91 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3240  ferric uptake regulator family protein  28.68 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000230922  hitchhiker  0.00191408 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  30.07 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3531  ferric uptake regulator, Fur family  30.88 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0020  FUR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147149  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3292  FUR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000231053  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  30.3 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1930  ferric uptake regulator, Fur family  25.55 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  30.43 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3922  ferric uptake regulator family protein  29.66 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000572819  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0132  ferric-uptake regulator  28.99 
 
 		 123 aa  52.4  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1143  ferric uptake regulator, Fur family  30.08 
 
 		 150 aa  52.4  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000124537  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3601  ferric uptake regulator, Fur family  28.47 
 
 		 144 aa  52  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11678  putative transcription regulator  29.63 
 
 		 137 aa  52  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1411  ferric uptake regulator family protein  27.82 
 
 		 150 aa  52  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3674  ferric uptake regulator family protein  31.97 
 
 		 129 aa  51.6  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21260  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  41.35 
 
 		 157 aa  51.6  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.570442  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0515  ferric uptake regulator, Fur family  31.31 
 
 		 142 aa  51.6  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  30.1 
 
 		 152 aa  51.6  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  27.54 
 
 		 149 aa  51.6  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  27.54 
 
 		 149 aa  51.6  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4160  FUR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4001  FUR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000832394  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3239  ferric uptake regulator, Fur family  31.94 
 
 		 173 aa  51.2  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3832  FUR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3848  FUR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000844204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4313  FUR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4201  transcriptional regulator, Fur family  29.66 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0217905  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4224  transcriptional regulator, Fur family  29.66 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00546613  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3535  ferric uptake regulator, Fur family  28.47 
 
 		 144 aa  51.2  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_19  transcriptional regulator, Fur family  27.94 
 
 		 142 aa  51.2  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.677591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4115  transcriptional regulator, Fur family  29.66 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5116299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1036  transcriptional regulator, Fur family  29.66 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0163253  normal  0.210334 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  30.22 
 
 		 150 aa  51.2  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4099  ferric uptake regulator family protein  27.86 
 
 		 143 aa  50.8  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  27.01 
 
 		 149 aa  50.8  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.499744 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2145  ferric-uptake regulator  30.94 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1597  ferric uptake regulator, Fur family  29.55 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1610  ferric uptake regulator, Fur family  26.51 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.596418  normal  0.587643 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1315  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3815  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1806  ferric uptake regulator family protein  34.85 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.696064  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3007  ferric uptake regulator, Fur family  29.29 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  27.07 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2524  ferric uptake regulator, Fur family  32.26 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.568134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0918  ferric uptake regulator  35.2 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1604  putative transcription regulator protein  34.29 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000436344  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0931  ferric uptake regulator family protein  27.69 
 
 		 130 aa  48.9  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  31.25 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1415  ferric uptake regulator family protein  31.3 
 
 		 140 aa  48.5  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000163802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0488  zinc uptake regulation protein  38.82 
 
 		 147 aa  48.5  0.00004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.695603  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2867  ferric uptake regulator, Fur family  35.63 
 
 		 149 aa  48.1  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000960204  decreased coverage  0.0000000000000181287 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1140  ferric uptake regulator family protein  41.67 
 
 		 152 aa  47.8  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0726  ferric uptake regulator, Fur family  32.59 
 
 		 130 aa  47.8  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.787789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1792  ferric uptake regulator, Fur family  28.79 
 
 		 150 aa  47.8  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000306351  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4578  ferric uptake regulator, Fur family  28.57 
 
 		 166 aa  47.8  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.622664  normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  28.03 
 
 		 146 aa  47.8  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  28.68 
 
 		 154 aa  47.8  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0667  oxidative stress regulator protein BosR  23.08 
 
 		 176 aa  47.4  0.00009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36340  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  32.59 
 
 		 151 aa  47.4  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  29.69 
 
 		 143 aa  47.4  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2809  FUR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.110848  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  27.01 
 
 		 148 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2366  ferric uptake regulator, Fur family  27.87 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.437919 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1445  FUR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0423256  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1746  FUR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0159  ferric uptake regulator, Fur family  27.56 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0105  ferric uptake regulator family protein  27.27 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.013681  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2725  ferric uptake regulator, Fur family  29.2 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4566  Fur family transcriptional regulator protein  30.43 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2259  ferric uptake regulator, Fur family  35.05 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  25.49 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2198  ferric uptake regulator, Fur family  28.29 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0637  ferric uptake regulator family protein  37.5 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.835222  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1703  ferric uptake regulator protein  28.12 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.341625 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1713  FUR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 136 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0366911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>